Paul Fogel, 컨설턴트, Paul Fogel 컨설턴트
Orson Jay, 인턴, Sanofi
Galina Boldina, Sanofi 수석 데이터 과학자
Franck Augé, Sanofi Omics Data Sciences 수석 이사
행렬은 2차 텐서입니다. 일부 응용 프로그램에서 입력 데이터는 3차 이상의 텐서입니다. 예를 들어, 단일 기증자에서 발견된 다른 세포 유형의 유전자 발현 데이터는 {세포 유형 × 유전자} 형식의 2차 텐서를 형성하는 반면, 다른 기증자에서 유사한 세포 유형의 수집은 다음의 3차 텐서가 됩니다. 형태 {세포 유형 × 유전자 × 기증자}. 우리는 2개의 JMP 추가 기능을 제공하며, 그 중 첫 번째는 음이 아닌 텐서 분해를 사용하여 3차 텐서의 다방향 데이터 분석을 수행합니다. 두 번째 추가 기능을 사용하면 텐서에서 발견되는 주요 표현 패턴을 병렬 히트맵 형태로 시각화할 수 있습니다. 공개 transcriptome 데이터 세트를 사용하여 이러한 도구가 유사한 transcriptomic 패턴을 공유하는 세포 유형, 유전자 및 공여자의 3중 군집을 발견하고 시각화하여 서로 다른 세포의 대량 혼합물을 분리하는 데 사용할 수 있는 세포 유형 서명을 생성하는 방법을 보여줍니다. 유형. 또한 핵심 계산을 수행하는 데 사용되는 Python 패키지가 JSL 스크립트에 원활하게 통합될 수 있음을 보여줍니다.
