Hola. Mi nombre es María Gerus-Durand, y Soy laboral para C investigación erba Montpellier. Hoy, I voluntad espectáculo tú cómo nosotros colocar arriba automatizacion de inmunohistoquímica datos análisis para protocolo validación en Montpellier usando JMP y es herramientas como panel y complemento funciones.
Primero, alguno palabras acerca de investigación cerba, es a mundial compañía con capacidades en todo el continentes. Aquí I resaltado en amarillo el departamento Soy laboral para. Es a histopatología EHC Departamento. Como tú poder ver, Soy basado en Montpellier en Francia.W. mi tener también otro laboratorios en A NOSOTROS, en Nuevo York, y en Taiwán en Taipéi.
Primero de todo, qué es inmunohisto ¿química? El apuntar de el técnica es a detectar se dirige a las proteínas principalmente en a tejido muestra. Aquí tú tener a rebanada de a tejido, para ejemplo, cuando tú hacer a biopsia. Nosotros voluntad mirar en el objetivos de interés usando anticuerpos, cual voluntad detectar el objetivo. Este anticuerpo es Reconocido por otro uno cual es conjunto con cromático fluoroformo o activo componentes eso permitir el detección de el objetivo. Aquí tú ver, para ejemplo, estos tres componentes son resaltado, significado eso anticuerpos unir él y nosotros poder detectar él. Después el experimento, nosotros poder poder mirar en el diapositivas bajo microscopio o usando a escáner, cual permitir visualización y análisis de el resultados.
En el próximo deslizar, I justo zoom en entonces tú poder ver mejor qué él aspecto como. Aquí es a piel muestra y tú tener a celúla nuclear en azul y el objetivo de interés en rojo. Uno de los desafios dentro inmunohisto química y histopatología es eso tú tener muchos posible protocolos, coloraciones. Aquí en el izquierda, es dos diferente histológico coloraciones. Él no involucrar anticuerpos como I espectáculo tú, pero él justo reactivo con el diferente componentes de el tejidos. Tú ver aquí para el MOVAT, nosotros tener cinco colores. Para el ÉL, nosotros tener solo uno color, pero el intensidad depende en el tipo de estructura tú son mirando en en el tejido.
En el bien, tú tener dos inmunohistoquímica protocolo. Uno simplex, nosotros llamado él, porque nosotros detectar solo uno objetivo, y es a cromogénico aquí. Es en marrón. En el arriba bien, tú tener a multicine. h antes de nosotros detectar muchos componentes. Aquí es a cuádruple, cuatro objetivos en el mismo deslizar, y cada es reveló por diferente fluir de trabajar. Tú tener diferente color para cada de el objetivos.
Entre de estos coloración detección posibilidades, entonces tú tener a multitud de posible análisis método.El diapositivas poder ser analizado por a patólogo, cual voluntad dar a nosotros cualitativo o semi- cuantitativo datos, o por imagen análisis, cual voluntad dar a nosotros cuantitativo datos. Otro capa de eso es eso tú poder tener reportable parámetros cual son soltero. Para ejemplo, si tú tener a simple, tú detectar el objetivos, solo uno objetivo, y tú evaluar solo uno parámetro como porcentaje de positivo células, para ejemplo, o tú poder tener muchos. Para uno objetivo, tú poder tener el porcentaje de positivo células y a específico histología puntaje. O si tú tener a multicine, entonces tú poder multiplicar este para todo objetivos en el multicine.Cada informe nivel parámetro es objetivo- dependiente. Tú poder imaginar eso nosotros tener a lote de combinación eso nosotros poder tener a acceso durante nuestro validaciones.
En Investigación Cerba METRO ontpellier, en 2022, nosotros tener a pequeño parte, como 20 % de nuestro proyecto relacionado a animales. Nosotros son estudiando animal muestras. El otro proyectos eran en humano muestras. Entre este, mayoría de ellos son cuatro clínico ensayos de el proyecto. Eso es a muy [inaudible 00:04:56] . W. mi tener alguno otros eso son afuera clínico ensayos, a cuarto de a ellos, y a pequeño parte, 3 % eso son GORRA obediente.GORRA es a específico regulación para A NOSOTROS. Es a saber eso antes ser usado en a clínico ensayo, nosotros debería demostrar eso nuestro protocolo eso nosotros desarrollado en Montpellier espectáculo consistencia en resultados para sección de el mismo muestra. Si nosotros analizar el muestra en diferente puntos tipo, para ejemplo, el muestras de pacientes involucrado en el estudiar, el primero año debería ser el mismo que en el cinco años después.
En el diferente autómatas, nosotros tener en nuestro diferente sitios, y cuando el muestras son analizado por diferente operadores o patólogos. Este aplica a riguroso validación de acuerdo a a el salud agencia, y este validación es principalmente basado en estadístico criterio.
El implicación para el compañía es eso nosotros necesidad a aumentar el equipo miembros a apoyo el creciente número de proyectos nosotros tener cada año, y nosotros necesidad a normal género estadístico análisis tubería a ser seguro eso nosotros voluntad dar todo nuestro clientela el mismo tipo de resultados. Obviamente, nosotros necesidad estadístico análisis herramienta, y es cuando nosotros elegir JMP a apoyo nuestro validación de el protocolo.
Hoy, I voluntad espectáculo tú solo a parte de qué nosotros son haciendo porque I no tener tiempo a espectáculo tú todo.I eligió a bastante simple ejemplo. Es una especie de experimento nosotros hacer a validar el precisión de el protocolo, significado eso nosotros controlar el dentro de la carrera , cual es llamado repetibilidad precisión encima tres diapositivas. Aquí son el tres unos resaltado en púrpura en el mismo ciclo. El tres diapositivas I correr en el mismo tiempo, ellos venir de el mismo muestra, y nosotros justo controlar eso nosotros tener el mismo datos. El entre ejecuciones, reproducibilidad, prueba encima dos diapositivas resaltado en azul en cada ciclo. En total, nosotros tener seis diapositivas encima tres ciclos.
Para reportable parámetros, I voluntad usar un imagen análisis conjunto de datos, cual es cuantitativo datos y generalmente más fácil a analizar. Nosotros voluntad tener dos reportable parámetros para uno objetivo.
Cómo hacer tú ¿comenzar? Primero, nosotros necesidad a importar el datos. I no saber si tú son familiar con eso. Pero en nuestro caso, nosotros tener datos cualquiera de Palabra documentos, entonces nosotros usar el Palabra Importar Herramienta disponible en JMP comunidad sitio web . I poner el enlace aquí entonces tú poder ir y encontrar él de nuevo. O nosotros importar datos de Sobresalir cualquiera directamente por apertura el archivo en JMP o por usando el JMP herramienta en Sobresalir.
Para este presentación, justo a ser más rápido, I crear alguno guion a ayuda a mí a enfocar en el panel creación después eso, cual voluntad llevar más tiempo. Pero este es justo alguno guion y justo a ser más rápido, pero I voluntad no desarrollar en él entonces. Aquí I voluntad abierto a datos mesa de Proyecto X aquí. Como tú poder ver, es a bastante simple mesa. I tener cuatro columnas con el validación, el deslizar IDENTIFICACIÓN, cual son interno deslizar números, y el conjunto de datos para mi dos reportable parámetros. Este datos continúa porque ellos venir de imagen análisis.
Una vez I tener este, I voluntad necesidad a preparar mi datos. Es a mayoría tiempo consumidor parte de análisis datos. De nuevo, es por qué I tener a guion. Tú ver el cinco columnas dónde I hizo. El muestra a ser capaz a correlación cada datos a el mismo muestra, cual es a parte de el deslizar IDENTIFICACIÓN nosotros tener internamente. I justo conseguir a fórmula aquí a ayuda a mí a hacer eso. El deslizar número, cual son el último dígitos de el deslizar IDENTIFICACIÓN, y el deslizar orden, el 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 para cada muestra. Gracias a este deslizar ordenar, I haría decir, I implementar el reloj de repetición.El tres primero diapositivas cual eran quedarse en el mismo ciclo para reloj de repetición, y dos primero diapositivas de cada ciclo para reproductividad prueba.
Aquí I tener todo el información necesario a hacer mi análisis. I ir atrás a mi diario, y nosotros voluntad desear a hacer el panel pregunta. I aún tener alguno pasos a hacer antes eso porque I haría como a tener todo el análisis I desear a poner en el panel. Aquí son el dos pequeño mesa tú ver dónde nosotros son requerido a analizar el CV de nuestro protocolo para cada muestra para repetibilidad. I seleccionado solo el tres primero diapositivas gracias a el local datos filtrar. El mismo para reproducibilidad, dónde tú ver I tener el diapositivas de el reproducibilidad columna.
Aquí son el datos eso I necesidad. Este datos I actualizado a ellos en aquí. Tú ver I tener mucho más columnas ahora. Es más fácil a encontrar el nombre aquí. I tener el muestra CV para repetibilidad, para reportable parámetro 1 y 2, y entonces el mismo para reproducibilidad para el dos parámetros, y entonces I hacer el significar de ambos muestras para cada de estos columnas. Aquí, todo el datos I voluntad necesidad a implementar en mi panel.I poder cruz este mesa. I no necesidad a ellos ya no.
I voluntad ahora hacer el graficos y mesas eso voluntad en realidad adaptar en el panel. De nuevo, qué I desear a espectáculo a el cliente es el distribución de el datos para repetibilidad. I poner como Bueno el estándar desviación y el significar. Generalmente, es bonito bien aquí y para reproducibilidad dónde I tener todo mi seis diapositivas. Entonces I haría poner a mesa con a CV para cada muestra para repetibilidad y el reproducibilidad en el izquierda para el primero parámetro y en el bien para el segundo uno. El mismo describir para el significar de el dos muestras.
Estos son el cuatro parte I desear a espectáculo en mi panel. I voluntad espectáculo tú cómo él aspecto como. I desear a obtener algo como eso. Este es a menudo I hizo eso I poder espectáculo él, el dos graficos y el dos mesa. Es qué I haría espectáculo tú cómo a hacer ahora. Tú ver eso todo el graficos son a el mismo datos mesa, Lo siento, y es mucho más fácil a hacer el panel después. I salvado como Bueno todo el guiones entonces I poder rehacer a ellos cuando sea I desear. I voluntad crear a nuevo archivo, nuevo panel.Tú tener muchos plantillas.I generalmente comenzar de blanco y justo tú tener a poner en qué tú desear a ver. A veces es a poco difícil porque es pequeño, pero nosotros siempre administrar a encontrar nuestro forma.
Mi mesa en el abajo, tú justo gota a ellos dónde tú desear a tener a ellos. Es bonito simple. Tú poder cambiar el nombres de cada uno parte, entonces I voluntad no hacer él justo. Pero tú poder ver eso tú poder editar todo el partes. Tú poder correr su guion y entonces dar tú el panel. Es bonito similar a qué I presentado tú antes. I tener mi dos mesas en el abajo y mi dos graficos en el arriba aquí. I tener invertido el dos, entonces I generalmente preferir a comenzar con repetir eso. I voluntad justo cambiar a ellos. Si I poner él dónde algo era ya, ellos justo cambiar.
Aquí nosotros son. Este es el disposición I desear, entonces es bien. Después, tú poder jugar a ver mejor, más o menos, de el mesa, y etcétera. Pero este es justo para visual [inaudible 00:15:00] proceso. Entonces, bueno, ahora nosotros tener panel, pero él haría ser más interesado si nosotros poder directamente ir para el panel cuando tú tener todo su datos tú desear en el panel y hacer clic y tú tener a panel.Para eso, nosotros justo necesidad a hacer un agregar- en. Es bastante simple. Gracias a el magia triángulo, I llamar él, el rojo triángulo aquí. Tú hacer clic Ahorrar Guion y justo A Agregar-yo norte. Entonces él voluntad crear a guion eso voluntad hacer el mismo panel de nuevo.
vamos ir atrás a el datos mesa. I voluntad cerca este uno. Tú son seguro eso el uno eso tú voluntad ver es no esta uno. Lo siento, I no debería tener cerrado él antes haciendo el panel. I voluntad justo usar este a ser más rápido y no a crear él de nuevo. Aquí, si tú hacer clic en el rojo, Ahorrar Guion, A Agregar -En. Entonces este es el nombre tú voluntad tener en el agregar- en lista, pero es a administrar su agregar- En s, I haría decir, pero es no el uno eso voluntad cifra afuera en el complemento pestaña en JMP. El nombre eso estás en el complemento pestaña es este uno. Para hoy, I haría justo llamar él Prueba entonces I saber cual uno es este. Ahorrar. Tú ver aquí, tú tener todo el guion usado por JMP a hacer este panel, y I voluntad ahorrar él en nuestro Proyecto X. Aquí tú ver él llevar el nombre en el primero pestaña Panel solo.
I ahorrar él. Aquí I tener este ambos garrapata Instalar después ahorrar, entonces él era ya poner en mi complemento lista. Si el caja era no marcado, entonces tú tener justo a ir a el ubicación. Tú ahorrar su archivo y hacer clic en él y es instalado. Ahora I poder cerca este panel .
I tener creado mi complemento ya. Ahora, cómo a usar ¿él? I justo fue a poco más rápido. Si tú abierto él, él instala. Como I tener él ya, I voluntad no comenzar él. Es justo bajo él. Si tú ir a Vista, complementos, Lo siento, Panel, y Darse de baja, es no borrado. I voluntad encontrar él de nuevo cuando I ir a mi proyecto. Aquí tú ver I tener él. Si I doble -hacer clic, él preguntar a mí si I desear a instalar él. Seguro, I desear a instalar él. Es atrás aquí de nuevo. Tú poder compartir él. Tú justo tener a Copiar el mismo archivo I hizo clic en y pegar él en a compartido carpeta o enviar él a a JMP usuario colega. Tú poder modificar él. Para este tú tener a ir en Abierto. De nuevo, este es el panel pero entonces el negro hacer clic este tiempo, justo ir en el flecha aquí a abierto y Abierto usando Complemento Constructor.
Aquí tú ir atrás a el primero tiempo ventana dónde tú tener su guion aquí, y tú poder cualquiera editar el guion o poner otro funciones eso I no en realidad usar, a ser honesto. Pero tú tener muchos funciones. Soy seguro tú voluntad encontrar más información en JMP sitio web acerca de eso. Este, para ejemplo, voluntad permitir tú a poner todo el preparación paso en el mismo complementar. Cuando tú correr, todo es hecho en el mismo tiempo. Este es él.
En conclusión, usando este panel y complemento funciones permitir a nosotros a tener informes consistencia porque nosotros tener siempre el mismo colocar arriba de resultados a enviar a el clientela. Nosotros aumentar el trazabilidad. Gracias como Bueno para el usar de el guiones porque nosotros son seguro eso nosotros son todo haciendo el mismo. I es a excelente tiempo ahorrador porque como tú decir, I justo tener a hacer clic en uno botón y I tener mi panel. Si tú combinar este con a sincronización de precisión. Todo el datos preparación, entonces tú tener su mesa, tú hacer clic en uno botón, y tú tener todo hecho. Es a excelente tiempo ahorrador.
Es todo I buscado a espectáculo tú hoy. I esperanza tú disfrutar él.Si tú tener cualquier pregunta, no dudar a alcanzar afuera a a mí cualquiera por correo electrónico- tú tener el correo electrónico en el primero deslizar aquí- o a través de el JMP comunidad. Agradecer tú.
