C44基因組選擇:6個火炬松性狀的遺傳分析和標記模擬本案例研究重點介紹如何使用 JMP Pro 17 進行組學數據分析,特別是標記輔助品種/基因組選擇數據。 它主要著眼於探索火炬鬆的標記和特徵,並添加預測模型,然後模擬後代/後代,以查看父母之間的哪些雜交/交配可能會產生最佳的所需特徵。這種類型的分析是農業(作物和動物科學)品種計劃的育種者和統計遺傳學家的典型分析
該案例研究可用於 SE 為那些有興趣在臨床研究領域分析組學數據的客戶提供演示。 它的設計使您可以僅顯示客戶要求的功能(使用 Great Demo!方法),但也可以在分析此類數據的整個分析工作流程的上下文中顯示。 如果您嘗試演示所有功能,將花費一個多小時,因為使用了很多功能。
隨附的日誌包含用於在每個步驟執行分析的腳本按鈕。 還有一些腳本按鈕也可以執行一些數據操作任務。 一些分析可能需要很長時間,因此最好在進行演示之前預先運行它們。
也可以使用維恩圖插件。
什麼是可用的:
- JMP 期刊,介紹工作流程、科學/研究問題和使用的數據集
- JMP 數據表
- 數據集,以便您可以創建 JMP 數據表
- 期刊中引用的論文
為什麼這有用?
- JMP Genomics 作為產品於今年早些時候停產,因此我們需要案例研究來展示如何在 JMP Pro 17 中執行組學分析
- 它還強調了 JMP/JMP Pro 17 中針對寬數據的新增功能,尤其是在“組學數據”的背景下
- 它還旨在幫助 SE 在給定的演示和討論“omic 空間”中的功能時變得更加自給自足
- 'omic 世界中的數據分析可以是腳本/工作流導向的或探索性的。 本案例研究將側重於數據分析更具探索性的性質,而不是“自動化”或腳本類型的分析。 可以使用 JMP Pro 17 的工作流構建功能將步驟轉換為工作流。
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