Este estudio de caso se centra en cómo usar JMP Pro 17 para el análisis de datos ómicos, específicamente datos de selección genómica/raza asistidos por marcadores. Principalmente analiza la exploración de marcadores y rasgos de los pinos Loblolly y agrega modelos predictivos para luego simular la progenie/descendencia para ver qué cruces/apareamientos entre los padres es probable que proporcionen los mejores rasgos deseados.Este tipo de análisis es propio de los Programas de Criadores y Genetistas Estadísticos en Agricultura (Cultivos y Ciencias Animales)
Este estudio de caso se puede utilizar para dar demostraciones a los clientes por parte de los SE para aquellos interesados en analizar datos ómicos en el espacio de investigación clínica. Está diseñado para que pueda mostrar solo las capacidades solicitadas por el cliente (use el método Great Demo!), pero también en contexto con todo el flujo de trabajo analítico para analizar este tipo de datos. Si intenta hacer una demostración de todas las capacidades, le llevará más de una hora, ya que se utilizan muchas capacidades.
El diario incluido contiene botones de script para realizar el análisis en cada paso. También hay botones de script que también realizan algunas tareas de manipulación de datos. Algunos de los análisis pueden llevar mucho tiempo, por lo que es mejor ejecutarlos antes de realizar una demostración.
También se podría utilizar el complemento Diagrama de Venn.
Lo que está disponible:
- Un JMP Journal con una introducción al flujo de trabajo, la pregunta científica/de investigación y el conjunto de datos utilizado
- Tabla de datos JMP
- Los conjuntos de datos para que pueda crear la tabla de datos JMP
- Artículo referenciado en Journal
¿Por qué es útil?
- JMP Genomics como producto se suspendió a principios de este año, por lo que necesitamos estudios de casos para mostrar cómo realizar un análisis ómico en JMP Pro 17.
- También destaca las novedades de JMP/JMP Pro 17 para datos amplios, especialmente en el contexto de datos ómicos.
- Además, está destinado a ayudar a los SE a ser más autosuficientes en demostraciones dadas y hablando de capacidades en el espacio ómico.
- El análisis de datos en el mundo ómico puede estar orientado a secuencias de comandos/flujos de trabajo o ser de naturaleza exploratoria. Este estudio de caso se centrará en la naturaleza más exploratoria del análisis de datos y no en el tipo de análisis "automatizado" o con guión. Uno puede convertir los pasos en un flujo de trabajo utilizando las capacidades de creación de flujo de trabajo de JMP Pro 17.
