이 사례 연구는 'omic 데이터 분석, 특히 마커 지원 품종/게놈 선택 데이터'에 JMP Pro 17을 사용하는 방법에 중점을 둡니다. 주로 Loblolly 소나무의 마커 및 특성 탐색을 살펴보고 예측 모델링을 추가하여 자손/자손을 시뮬레이션하여 부모 간의 어떤 교잡/교배가 원하는 최상의 특성을 제공할 가능성이 있는지 확인합니다.이러한 유형의 분석은 농업(작물 및 동물 과학)의 번식 프로그램의 육종가 및 통계 유전학자의 전형입니다.
이 사례 연구는 임상 연구 공간에서 '오믹 데이터'를 분석하는 데 관심이 있는 사람들을 위해 SE가 고객에게 데모를 제공하는 데 사용할 수 있습니다. 고객이 요청한 기능(Great Demo! 방법 사용)만 표시할 수 있을 뿐만 아니라 이러한 종류의 데이터를 분석하는 전체 분석 워크플로에 대한 컨텍스트도 표시할 수 있도록 설계되었습니다. 모든 기능을 시연하려고 하면 사용되는 기능이 많기 때문에 한 시간 이상 걸립니다.
포함된 저널에는 각 단계에서 분석을 수행하는 스크립트 버튼이 포함되어 있습니다. 일부 데이터 조작 작업을 수행하는 스크립트 버튼도 있습니다. 일부 분석은 시간이 오래 걸릴 수 있으므로 데모를 제공하기 전에 사전 실행하는 것이 가장 좋습니다.
Venn Diagram 추가 기능을 사용할 수도 있습니다.
사용 가능한 것:
- 작업 흐름, 과학/연구 질문, 사용된 데이터 세트에 대한 소개가 포함된 JMP 저널
- JMP 데이터 테이블
- JMP 데이터 테이블을 생성할 수 있는 데이터 세트
- 저널에 인용된 논문
이것이 유용한 이유는 무엇입니까?
- 제품으로서의 JMP Genomics는 올해 초 중단되었으므로 JMP Pro 17에서 'omic 분석을 수행하는 방법을 보여주는 사례 연구가 필요합니다.
- 또한 광범위한 데이터, 특히 '오믹 데이터' 맥락에서 JMP/JMP Pro 17의 새로운 기능을 강조합니다.
- 또한 SE가 주어진 데모에서 자급자족할 수 있도록 돕고 '오믹 공간'의 기능에 대해 이야기합니다.
- 오믹 세계의 데이터 분석은 스크립팅/워크플로 지향적이거나 본질적으로 탐색적일 수 있습니다. 이 사례 연구는 "자동화" 또는 스크립팅된 유형 분석이 아닌 데이터 분석의 보다 탐색적인 특성에 초점을 맞출 것입니다. JMP Pro 17의 워크플로 구축 기능을 사용하여 단계를 워크플로로 변환할 수 있습니다.
