Questo caso di studio si concentra su come utilizzare JMP Pro 17 per l'analisi dei dati 'omici, in particolare dati di selezione genomica/razza assistita da marcatori. Esamina principalmente l'esplorazione dei marcatori e dei tratti dei Loblolly Pine Trees e aggiunge modelli predittivi per poi simulare la progenie/prole per vedere quali incroci/accoppiamenti tra i genitori possono dare i migliori tratti desiderati.Questo tipo di analisi è tipico dei programmi Allevatori e Genetisti Statistici di Razza in Agricoltura (Scienze delle Colture e degli Animali)
Questo caso di studio può essere utilizzato per fornire dimostrazioni ai clienti da parte di IS per coloro che sono interessati ad analizzare i dati "omici" nello spazio della ricerca clinica. È progettato in modo da poter mostrare solo le funzionalità richieste dal cliente (utilizzare il metodo Great Demo!) ma anche nel contesto dell'intero flusso di lavoro analitico di analisi di questo tipo di dati. Se provi a provare tutte le funzionalità, ci vorrà più di un'ora poiché ci sono molte funzionalità utilizzate.
Il diario incluso contiene pulsanti di script per eseguire l'analisi in ogni passaggio. Esistono anche pulsanti di script che eseguono anche alcune attività di manipolazione dei dati. Alcune delle analisi possono richiedere molto tempo, quindi è meglio eseguirle prima di fornire una demo su di esse.
Potrebbe essere utilizzato anche il componente aggiuntivo Diagramma di Venn.
Cosa è disponibile:
- Un JMP Journal con un'introduzione al flusso di lavoro, alla domanda scientifica/di ricerca e al set di dati utilizzato
- Tabella dati JMP
- I set di dati in modo da poter creare la tabella dati JMP
- Documento citato in Journal
Perché è utile?
- JMP Genomics come prodotto è stato interrotto all'inizio di quest'anno, quindi abbiamo bisogno di case study per mostrare come eseguire l'analisi 'omica in JMP Pro 17
- Evidenzia inoltre le novità di JMP/JMP Pro 17 per i dati estesi, in particolare nel contesto dei dati "omici"
- Inoltre ha lo scopo di aiutare gli SE a diventare più autosufficienti in determinate demo e parlare di capacità nello "spazio omico"
- L'analisi dei dati nel mondo 'omico può essere orientata allo script/flusso di lavoro o di natura esplorativa. Questo caso di studio si concentrerà sulla natura più esplorativa dell'analisi dei dati e non sull'analisi di tipo "automatizzata" o basata su script. È possibile convertire i passaggi in un flusso di lavoro utilizzando le funzionalità di creazione del flusso di lavoro di JMP Pro 17.
