정량적 특성 데이터에 대한 순위 기반 역정규 변환(INT)이 JMP 추가 기능은 GWAS(Genome Wide Association Studies)에서 일반적으로 분석되는 비정규 정량적 특성 데이터를 변환하는 것입니다. 구현된 방법은 순위 기반 역정규변환(INT)입니다.
변환할 특성을 선택한 다음 확인을 클릭하여 변환된 새 열을 생성하는 간단한 인터페이스가 생성됩니다(아래 스크린샷 참조).
출력은 두 개의 열 세트입니다. 1) 접미사인 _INT. 2) _p를 접미사로 붙여 변환된 특성 값입니다. 이는 변환된 열의 확률 값입니다.
INT와 그 다양한 형태를 논의하는 논문이 있습니다. 또한 지침을 제공하는 데에도 사용할 수 있습니다.
McCaw ZR, Lane JM, Saxena R, Redline S, Lin X. 게놈 전체 연관 연구에서 정량적 특성 분석을 위한 순위 기반 역정규 변환의 작동 특성. 생체 인식. 020;76:1262~1272.
https://doi.org/10.1111/biom.13214
관심이 있는 경우 추가 방법을 통합할 수 있으며 이러한 방법을 선택할 수 있도록 창을 업데이트할 수 있습니다.
업데이트: 이제 추가 기능 버전 2에는 다음이 포함됩니다.
- 확률을 포함하거나 포함하지 않는 옵션이 추가되었습니다.
- 동점이 있을 때 임의 또는 평균 중에서 선택할 수 있는 옵션이 추가되었습니다. 선택한 결속 방법은 어떤 방법이 사용되었는지에 대한 메모를 데이터 테이블에 기록합니다.
이 추가 기능은 JMP/JMP Pro 17 및 JMP/JMP Pro 18에서 생성, 테스트되었습니다.
생명 과학유용Re: 정량적 특성 데이터에 대한 INT(Inverse Normal Transformation)저는 JMP에서 이 분석을 수행하는 데 도움이 필요했고 Chris와 Di, 그리고 아마도 다른 사람들은 이 작업을 수행하는 데 매우 반응이 좋았습니다.
Annabelle Rodriguez-Oquendo, 메릴랜드
UConn 건강, Farmington CT
Re: 정량적 특성 데이터에 대한 INT(Inverse Normal Transformation)유용한 추가 기능에 감사드립니다. 두 가지 질문이 있습니다.
1. 이 추가 기능을 사용하여 데이터를 변환하면 데이터 세트에 두 개의 열이 추가됩니다. 하나는 변수 이름 끝에 "_INT"가 있고 다른 하나는 "_p"가 있습니다. _p로 끝나는 두 번째 것은 무엇입니까?
2. 귀하가 인용한 논문(McCaw et al., 2020) 역 정규 변환을 위한 두 가지 방법을 소개합니다. 직접(D) 및 간접(I)을 결합한 다음 옴니버스 테스트(O)로 결합합니다. 변환에 대한 추가 지침을 위해 문서만 참조했다고 가정합니다. 그러나 열이 이 세 가지 테스트 중 하나와 어떤 식으로든 관련이 있는 경우 추가 기능에서 사용되는 항목을 명확히 할 수 있으면 감사하겠습니다.
소하일 샤푸리,
조지아 대학교
Re: 정량적 특성 데이터에 대한 역정규 변환(INT)안녕하세요 @SoheilShapouri 님 ,
_INT 열은 변환된 열이고, _p 열은 확률 값입니다.
예, 이 문서는 추가 기능 및 지침에 대한 추론을 참조하는 데 더 적합했습니다. 구현된 것은 논문의 항목 1인 Rank Based Inverse Normal Transformation이었습니다.
설명을 더 명확하게 업데이트하겠습니다. 귀하의 질문과 의견에 감사드립니다.
최상의,
