基于等级的定量性状数据的逆正态变换 (INT)此 JMP 插件用于转换基因组关联研究 (GWAS) 中通常分析的非正态定量特征数据。所实施的方法是基于等级的逆正态变换 (INT)。
创建一个简单的界面来选择要转换的特征,然后单击“确定”来创建新的转换列(见下面的屏幕截图)。

输出是两组列:1) _INT 作为后缀。这些是转换后的特征值 2) _p 作为后缀。这些是转换后的列的概率值。
有一篇论文讨论了 INT 及其不同形式。它也可以用来提供指导。
McCaw ZR、Lane JM、Saxena R、Redline S、Lin X。全基因组关联研究中基于等级的逆正态变换在定量性状分析中的操作特性。生物统计学。020;76:1262-1272。
https://doi.org/10.1111/biom.13214
如果有兴趣,可以加入其他方法并更新窗口以允许选择这些方法。
更新:现在插件的第 2 版包括以下内容:
- 添加了包含或不包含概率的选项
- 添加了在出现平局时选择任意或平均的选项。所选的平局方法将在数据表中记录所用方法。
此插件是在 JMP/JMP Pro 17 和 JMP/JMP Pro 18 上创建、测试的
生命科学实用工具回复:数量性状数据的逆正态变换(INT)我在 JMP 中需要帮助来完成这项分析,Chris 和 Di,也许还有其他人,在完成这项工作时反应非常迅速。
医学博士安娜贝尔·罗德里格斯-奥昆多
UConn Health,康涅狄格州法明顿
回复:数量性状数据的逆正态变换(INT)感谢您提供如此有用的插件。 我有两个问题:
1. 当我使用此加载项转换数据时,它向数据集添加了两列。 一个变量名称末尾带有“_INT”,另一个带有“_p”。 第二个以_p结尾的是什么?
2. 您引用的论文(McCaw 等人, 2020)介绍了两种反正态变换的方法;直接 (D) 和间接 (I),然后将它们组合成综合测试 (O)。 我假设您只是参考了这篇论文以获得更多转型指导。 但是,如果该列与这三个测试中的一个有某种关联,我很感激您能澄清在加载项中使用了哪一个。
索海尔·沙普里,
佐治亚大学
回复:数量性状数据的逆正态变换 (INT)你好@SoheilShapouri ,
_INT 列是转换后的列,_p 列是概率值。
是的,这篇论文更多的是关于加载项的推理和指导的参考。实现的是论文中的第 1 项:基于排名的逆正态变换。
我将更新描述以使其更加清晰。感谢您的提问和评论
最好的,