Cette étude de cas se concentre sur l'utilisation de JMP Pro 17 pour l'analyse des données omiques, en particulier les données de sélection génétique/race assistée par marqueurs. Il se penche principalement sur l'exploration des marqueurs et des traits des pins à encens et ajoute une modélisation prédictive pour ensuite simuler la descendance/la progéniture pour voir quels croisements/accouplements entre les parents sont susceptibles de donner les meilleurs traits souhaités.Ce type d'analyse est typique des programmes d'éleveurs et de généticiens statistiques des races en agriculture (sciences végétales et animales)
Cette étude de cas peut être utilisée pour donner des démos aux clients par les SE pour ceux qui s'intéressent à l'analyse des données omiques dans le domaine de la recherche clinique. Il est conçu pour que vous puissiez afficher uniquement les fonctionnalités demandées par le client (utilisez la méthode Great Demo!), mais également dans le contexte de l'ensemble du flux de travail analytique d'analyse de ce type de données. Si vous essayez de faire une démonstration de toutes les fonctionnalités, cela vous prendra plus d'une heure, car de nombreuses fonctionnalités sont utilisées.
Le journal inclus contient des boutons de script pour effectuer l'analyse à chaque étape. Il existe également des boutons de script qui effectuent également certaines tâches de manipulation de données. Certaines des analyses peuvent prendre beaucoup de temps, il est donc préférable de les pré-exécuter avant de faire une démonstration à leur sujet.
Le complément Diagramme de Venn peut également être utilisé.
Ce qui est disponible :
- Un journal JMP avec une introduction au flux de travail, à la question scientifique/recherche et à l'ensemble de données utilisé
- Tableau de données JMP
- Le ou les ensembles de données permettant de créer la table de données JMP
- Article référencé dans Journal
Pourquoi est-ce utile ?
- JMP Genomics en tant que produit a été abandonné plus tôt cette année, nous avons donc besoin d'études de cas pour montrer comment effectuer une analyse omique dans JMP Pro 17
- Il met également en évidence les nouveautés de JMP/JMP Pro 17 pour les données étendues, en particulier dans le contexte des « données omiques ».
- Il est également destiné à aider les SE à devenir plus autonomes dans des démos données et à parler des capacités dans l'espace omique.
- L'analyse de données dans le monde 'omique peut être orientée script/flux de travail ou de nature exploratoire. Cette étude de cas se concentrera sur la nature plus exploratoire de l'analyse des données et non sur l'analyse de type "automatisée" ou scénarisée. Il est possible de convertir les étapes en flux de travail à l'aide des fonctionnalités de création de flux de travail de JMP Pro 17.
