en un artículo reciente , compartimos que JMP Pro 17 tiene capacidades ampliadas para analizar los tipos de datos comúnmente utilizados para la genómica. Hemos creado un recurso completo, Análisis Genómico con JMP Pro , para ayudarlo a aprender cómo aplicar JMP Pro para este tipo de análisis.@TomPedersen , redactor técnico principal del equipo de I+D de ciencias biológicas de JMP, es el autor principal y comparte su experiencia en el desarrollo de este nuevo libro.
¿Cuál fue la motivación para escribir este nuevo libro?
Una de las excelentes características de nuestro software JMP Genomics anterior era la disponibilidad de varios motores de importación junto con una serie de flujos de trabajo de análisis dedicados. Estas características permitieron a los usuarios importar sus datos de muchos archivos con formato propietario y luego analizarlos. Queremos brindar a los usuarios el conocimiento que necesitan para realizar análisis similares en JMP Pro. Aquí vemos que JMP Pro puede abrir un archivo de matriz de serie, analizar su organización y prepararlo para la importación. 
¿Qué descubrió sobre JMP Pro mientras trabajaba en el libro?
Que JMP Pro es RÁPIDO. Los análisis que antes tomaban horas en JMP Genomics ahora toman solo minutos en JMP Pro. JMP Genomics confió en el software SAS para hacer su "trabajo pesado". Durante análisis prolongados, SAS no "recordaba" los datos; en cambio, lo leería del disco y luego lo escribiría repetidamente. Su análisis dependía de qué tan rápido su computadora pudiera leer y escribir los datos. JMP Pro, en cambio, guarda todo en la memoria, por lo que el análisis es mucho más rápido. Además, JMP Pro es PODEROSO. Con la versión 17, JMP Pro ha mejorado significativamente para trabajar de manera eficiente y efectiva con los conjuntos de datos muy grandes y amplios que se encuentran típicamente en los estudios de genómica.Aquí hay dos ejemplos de JMP Pro que revelan pistas importantes en sus datos. Los gráficos de volcanes a la izquierda permiten la identificación de variantes genéticas que influyen en fenotipos específicos. A la derecha, los fitomejoradores que trabajan en la mejora de cultivos utilizan plantas de arroz cruzadas en silico para predecir los mejores cruces a realizar en el campo.
¿Cómo cree que este libro ayudará a nuestros clientes?
los Análisis Genómico con JMP Pro El libro está organizado para mostrar al usuario cómo aplicar flujos típicos de análisis de datos genómicos (ver imagen a continuación). Comienza mostrando a los usuarios cómo importar sus datos y luego continúa con la transformación de datos, el control de calidad y la normalización. Luego pasa al análisis de marcadores genéticos, explora patrones y estructuras en los datos y, finalmente, al modelado estadístico y predictivo. Este enfoque permite a los usuarios descubrir la información oculta en sus datos y realizar importantes descubrimientos científicos. También incluimos un conjunto de estudios de ejemplo reales y brindamos a los usuarios una guía paso a paso sobre el análisis de los datos.
