C43 预测模型:从血液代谢物预测脓毒症存活率本案例研究重点介绍如何使用 JMP Pro 17 进行组学数据分析,特别是代谢物数据。 它主要关注差异基因表达 (DGE) 工作流程并添加预测建模。这种类型的分析是转化科学家/生物标记研究人员的典型分析。
该案例研究可用于 SE 为那些有兴趣在临床研究领域分析组学数据的客户提供演示。 它的设计使您可以仅显示客户要求的功能(使用 Great Demo!方法),但也可以在分析此类数据的整个分析工作流程的上下文中显示。 如果您尝试演示所有功能,将花费一个多小时,因为使用了很多功能。
随附的日志包含输出以及用于在每个步骤执行分析的脚本按钮。 还有一些脚本按钮也可以执行一些数据操作任务。
也可以使用维恩图插件。
什么是可用的
- 介绍工作流程、科学/研究问题和使用的数据集的期刊
- 包含文件、日志、分析结果和数据表的 JMP 项目
- 数据集所以你可以自己做
为什么这有用?
- JMP Genomics 作为产品于今年早些时候停产,因此我们需要案例研究来展示如何在 JMP Pro 17 中执行组学分析
- 它还强调了 JMP/JMP Pro 17 中针对宽数据的新增功能,尤其是在“组学数据”的背景下
- 它还旨在帮助 SE 在给定的演示和讨论“omic 空间”中的功能时变得更加自给自足
- 'omic 世界中的数据分析可以是脚本/工作流导向的或探索性的。 本案例研究将侧重于数据分析更具探索性的性质,而不是“自动化”或脚本类型的分析。 可以使用 JMP Pro 17 的工作流构建功能将步骤转换为工作流。 在不久的将来,我将尝试创建一个并将其作为概念证明附加到本案例研究中。
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