ANOVA - 数据编码和结构化你好，
我有两个关于在 JMP 中运行 ANOVA 的问题。 我进行了一个包含三个因素的实验，每个因素都有两个水平。 说因素 A、因素 B、因素 C。然后对于每个因素 - “高”级或“低”级。 这给了我总共8个治疗组。 我还包括一个没有接受任何这些治疗的对照组。
所以一个例子是来自组的参与者。 1 将不接受治疗（对照），第 2 组的参与者将接受以下治疗：因子 A = 低，因子 = B，低，因子 = C 高，第 3 组的参与者将接受以下治疗：因素 A = 高，因素 = B，低，因素 = C 高等。
我的假设目前有以下几种：
1）治疗优于对照
2) 对于因素 A，高比低好
3) 对于因素 B，高比低好
4) 对于因素 A，高比低好
1）我的第一个问题是关于数据的编码。 我读了这篇文章https://www.jmp.com/support/help/14/coding-for-nominal-effects.shtml#1047389
- 这给我的印象是我应该将我的处理编码为 -1、0 和 1，以便 JMP 运行 ANOVA。 那是对的吗？ 目前，我为每个因素都有一列，其中我使用数字 0、1、2 表示“控制”、“低”、“高”。 但是我应该将其重新编码为 -1（控制）、0（低）、1（高）吗？
2）我的下一个问题是我如何在方差分析中实际包含对照组。 它应该作为三个因素中的每一个的“水平”还是作为一个单独的因素包括在内？ 如果是这样，这种“控制”因素的水平是多少？ 目前，我已经对数据进行了编码，因此控制条件作为三个因素中的每一个的一个级别包含在内。 但是 JMP 似乎不喜欢这样（我得到了很多奇怪的文本作为输出）——也许这是由于当前的 0、1、2 编码？ 还是应该将对照组作为第四个因素输入？ 如果是这样，那么该列是否应该被编码为控制与非控制？ 还是作为第 1-9 组？ 我希望这是有道理的！
我非常感谢这里的任何输入！ 
/卡特琳娜
回复：ANOVA - 数据编码和结构化- 所以我们得到了一个模型，效果测试就完成了！
- 是的，这就是我同事的建议。 该建议是为了满足您与对照组进行比较的要求。 您可以使用 ANOVA 和随后的多重比较程序 (Dunnet) 来研究显着差异。您正在测试交互作用，实际上是所有影响，但不是明确的。
我最初认为值排序可能会有所帮助，因为 JMP 内部编码因子水平的方式。 我猜这并没有帮助。
回复：ANOVA - 数据编码和结构化你好，我们又见面了
谢谢。 只是为了确保我做对了：
我应该：
1) 使用三个因素运行 ANOVA，但排除对照组。这样可行。该模型没有显示三种治疗方法之间的任何显着差异（正如我的初步分析所预期的那样）。 它也没有显示出任何显着的交互作用。
2）用一个因素运行单向方差分析。 实际上，我使用数据集中具有组号 (1-9) 的列，并且基本上将这些治疗组用作自变量。 这是你同事建议的吗？ 它有效，但那样我想我无法检查交互效果......如果第一个分析没有显示任何显着差异，为什么要进行此分析？
对于您对值排序的最后评论：我确实对级别进行了排序，但我不太明白它对结果的影响（如果有的话）。 我只看到视觉输出的差异......但也许我应该停在这里！
回复：ANOVA - 数据编码和结构化不要道歉。 有些问题或问题需要一些时间来理解和解决。
是的，感谢您的澄清。 您必须将估计/建模与分析的测试部分分开。 不要包括建模的对照组。 排除但不隐藏带有控件的行。 这样你仍然会看到控件出现在哪里，但它不会导致估计中的奇异性。
我的一位同事建议您通过连接三个因素的水平来使用单向方差分析进行测试。 这个过程将产生一个 9 水平的因子，八个处理加上控制。 您现在可以使用 Oneway 或 Fit Least Squares 来测试差异。
回复：ANOVA - 数据编码和结构化你好，我们又见面了
很抱歉让这个线程继续运行，但我仍然没有找到正确运行它的方法。
关于值排序：这只是输出报告中的视觉表示问题，对吗？ 我更改了顺序，因此控件 (0) 现在位于底部。这似乎对结果没有任何影响。
关于您的其他评论：是的，我会说这些因素都是分类的。 为简单起见，我在这篇文章中将它们标记为“高”和“低”。 但是让我给你一些关于实验和实际治疗的更多细节。
我想测试在网站中呈现一条信息的不同方式的影响。
信息可以呈现：
1) 以基于意见或基于行为的方式。
2）来自一组随机朋友或参与者预先选择的一组朋友（在实验早期）
3) 来自大量朋友（显示 8 个）和少量朋友（显示 2 个）。没有显示其他值，只有 2 或 8——为什么我将这些标记为“高”和“低”。
因此，例如，一名参与者可能会得到以下待遇：他接触到基于行为的信息来自一个随机的一套8 （高数）他的朋友。
对照组在没有特定信息的情况下体验了该网站。 因此，对于我数据集中的每一行对照组参与者，我将所有三个“因子列”中的处理编码为 0。
这些细节是否让您更接近于解决我应该如何包括对照组的问题？
回复：ANOVA - 数据编码和结构化您混淆了估计和测试。 奇点细节表明无法估计指定的模型。 控制水平必须独立变化，但您只有一个组合，所有因素都设置为该水平。
您的因子是真正分类的（例如，“低”和“高”）还是实际上是连续的（例如，50 和 100）？ “控制”是0？
回复：ANOVA - 数据编码和结构化您可以输入“控制”作为每个因素的水平。 我建议您使用 Value Ordering 列属性将其设为最后一个值。 这样，参数估计值将与控制值相关。
回复：ANOVA - 数据编码和结构化嗨，马克
感谢您的快速回复！ 很高兴知道。 你也有我的第二个问题的答案吗？ 即如何在方差分析中包括对照组。目前，对照组包括以下方式：我有三列，每个因素一列。 对于每一列，参与者被编码为 1（表示“低”）或 2（表示“高”）或简单地 0 表示控制。 但是，当我运行 ANOVA（拟合模型 -> 选择我的三个因子并选择“全因子” -> 选择 DV -> 按“运行”）时，JMP 在标题“奇点详细信息”下返回大量与因子相关的文本。 其余的结果看起来也很奇怪（例如，“效果测试”输出中的文本“LostDFs”，没有 F 比率等。当我从分析中排除对照组时，不会出现此问题。 您能否就我应该如何包括对照组提供见解？ 还是我应该简单地进行单独的 t 检验来检验我的第一个假设（治疗优于对照），然后对治疗组运行 ANOVA 以检验剩余的假设（与对照组无关）？
回复：ANOVA - 数据编码和结构化编码由 JMP 在内部为您完成。 只需根据需要在数据列中输入级别（例如，低和高）。
