JMP Pro 17 對 JMP 中執行基因組資料分析的方式進行了重大更改。 JMP 先前依賴 SAS 的後端連接,使用 JMP 中的自訂使用者介面對話方塊和輸出儀表板執行主要資料匯入和計算。新版本可讓您直接在 JMP Pro 中完成此工作,不再使用 SAS 或其他自訂設定。傑出研究員 Russ Wolfinger ( @russ_wolfinger ) 表示:「這項巨大變化將簡化和完善許多基因組學分析工作流程。雖然還有很多工作要做,但最初的產品非常強大,並提供了許多關鍵功能。” Russ 讓我們了解了基因組數據分析的這些令人興奮的變化。
這些變化為我們的用戶解決了哪些問題?
新框架直接依賴標準 JMP 介面,使了解 JMP 的人員更熟悉且簡單地執行許多步驟。此外,新指南《 使用 JMP Pro 進行基因組分析》將為處理這些類型的數據和分析的用戶提供協助。
您能否舉例說明 JMP 使用者的體驗如何?
典型的起點是「檔案」>「開啟」(對於單一檔案中的資料)或「檔案」>「匯入多個檔案」(對於多個檔案中的資料)。自動偵測許多常見格式,例如 vcf、bed、gff 和 IDAT。匯入例程通常會建立「寬」形式的 JMP 表,其中樣本作為行,基因作為列,並且該寬表可以根據分析目標在許多 JMP Pro 平台中使用。

許多資料表操作和分析平台都針對這些「寬資料」問題進行了最佳化,使用戶能夠輕鬆應用JMP Pro的分析工具來處理數千個變數。該版本還具有三個特別相關的新平台:標記統計、標記模擬和多元嵌入。
![GeneticAnalysis_25[1].png GeneticAnalysis_25[1].png](https://us.v-cdn.net/6038925/uploads/images/46588i2C432422A0522371/GeneticAnalysis_25%5B1%5D.png)
![GeneticAnalysis_3[2].png GeneticAnalysis_3[2].png](https://us.v-cdn.net/6038925/uploads/images/46589iD2F23898A3EDDF65/GeneticAnalysis_3%5B2%5D.png)

這會對使用者的工作和組織產生哪些影響?
透過關鍵的新工作來提高大型寬表的效能,一些導入例程和分析的速度提高了幾個數量級。每個步驟的結果都更加直接,允許更容易的解釋和回溯、並排比較以及快速收斂到重要發現和結論的可能性。
您認為這會讓用戶感到驚訝或高興的是什麼?
許多用戶會對新的 JMP Pro 框架中詳細基因組數據分析的速度和強度感到驚訝。我們還創建了一本配套的線上書籍《 使用 JMP Pro 進行基因組分析》 ,以指導用戶應用 JMP Pro 解決這些類型的問題。