JMP Pro 17 對在 JMP 中執行基因組數據分析的方式進行了重大更改。 JMP 以前依靠與 SAS 的後端連接來使用 JMP 中的自定義用戶界面對話框和輸出儀表板來執行主要數據導入和計算。 新版本允許您直接在 JMP Pro 中完成這項工作，不再使用 SAS 或其他自定義。 傑出研究員拉斯沃爾芬格（ @russ_wolfinger ) 說，“這種巨大的變化將允許簡化和改進許多基因組學分析工作流程。 雖然還有很多工作要做，但最初的產品非常強大，並提供了許多關鍵功能。” Russ 讓我們了解了基因組數據分析的這些令人興奮的變化。
這些更改為我們的用戶解決了哪些問題？
新框架直接依賴於標準的 JMP 接口，使得許多步驟對於了解 JMP 的人來說更加熟悉和直接。 此外，新指南“使用 JMP Pro 進行基因組分析”將幫助使用這些類型的數據和分析的用戶。 該指南計劃很快發布。
您能否舉例說明 JMP 用戶的體驗如何？
典型的起點是文件 > 打開單個文件中的數據或文件 > 導入多個文件以獲取多個文件中的數據。 自動檢測許多常見格式，例如 vcf、bed、gff 和 IDAT。 導入例程通常會以“寬”形式創建一個 JMP 表，其中樣本為行，基因為列，並且此寬表已準備好在許多 JMP Pro 平台中使用，具體取決於分析目標。
許多數據表操作和分析平台已針對這些“寬數據”問題進行了優化，允許用戶輕鬆應用 JMP Pro 的分析工具與數千個變量。 該版本還具有三個特別相關的新平台：標記統計、標記模擬和多變量嵌入。
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這會對用戶的工作和組織產生什麼影響？
通過提高大型寬表性能的關鍵新工作，一些導入例程和分析速度提高了幾個數量級。 每個步驟的結果更加直接，允許更容易解釋和回溯、並排比較以及快速收斂到重要發現和結論的可能性。
你認為什麼會讓用戶對此感到驚訝或高興？
許多用戶會驚訝於新的 JMP Pro 框架內詳細的基因組數據分析的速度和強大程度。 我們還創建了配套的在線書籍，使用 JMP Pro 進行基因組分析，以指導用戶將 JMP Pro 應用於這些類型的問題。
