JMP Pro 17은 JMP에서 게놈 데이터 분석이 수행되는 방식에 대한 중요한 변경 사항을 통합합니다. JMP는 이전에 JMP의 사용자 지정 사용자 인터페이스 대화 상자 및 출력 대시보드를 사용하여 기본 데이터 가져오기 및 계산을 수행하기 위해 SAS에 대한 백엔드 연결에 의존했습니다. 새 릴리스를 사용하면 JMP Pro에서 직접 이 작업을 수행할 수 있으며 더 이상 SAS 또는 추가 사용자 정의를 사용하지 않습니다. 저명한 연구원 Russ Wolfinger( @russ_wolfinger )는 “이러한 극적인 변화는 많은 유전체 분석 워크플로를 간소화하고 개선할 수 있게 해 줄 것입니다. 많은 작업이 남아 있지만 초기 제품은 매우 강력하고 많은 주요 기능을 제공합니다." Russ는 유전체학 데이터 분석의 이러한 흥미로운 변화를 살펴봅니다.
변경 사항은 사용자에게 어떤 문제를 해결합니까?
새 프레임워크는 표준 JMP 인터페이스에 직접 의존하므로 JMP를 아는 사람들에게 많은 단계가 훨씬 더 친숙하고 간단합니다. 또한 새로운 가이드인 JMP Pro를 사용한 게놈 분석은 이러한 유형의 데이터 및 분석 작업을 하는 사용자를 지원합니다. 가이드는 곧 출시될 예정입니다.
JMP 사용자에게 어떤 경험이 될 수 있는지 예를 들어 주시겠습니까?
일반적인 시작 지점은 단일 파일의 데이터에 대한 파일 > 열기 또는 여러 파일의 데이터에 대한 파일 > 여러 파일 가져오기입니다. vcf, bed, gff 및 IDAT와 같은 많은 일반적인 형식이 자동으로 감지됩니다. 가져오기 루틴은 일반적으로 샘플을 행으로, 유전자를 열로 사용하여 "와이드" 형식의 JMP 테이블을 생성하며, 이 넓은 테이블은 분석 목적에 따라 많은 JMP Pro 플랫폼에서 사용할 준비가 되어 있습니다.
많은 데이터 테이블 작업 및 분석 플랫폼이 이러한 "광범위한 데이터" 문제에 최적화되어 사용자가 수천 개의 변수가 있는 JMP Pro의 분석 도구를 쉽게 적용할 수 있습니다. 이 릴리스에는 특히 관련성이 높은 세 가지 새로운 플랫폼인 마커 통계, 마커 시뮬레이션 및 다변수 임베딩도 포함되어 있습니다.
![GeneticAnalysis_25[1].png](https://us.v-cdn.net/6038925/uploads/images/46588i2C432422A0522371/GeneticAnalysis_25%5B1%5D.png "GeneticAnalysis_25[1].png")
![GeneticAnalysis_3[2].png](https://us.v-cdn.net/6038925/uploads/images/46589iD2F23898A3EDDF65/GeneticAnalysis_3%5B2%5D.png "GeneticAnalysis_3[2].png")
이것이 사용자의 작업과 조직에 미칠 수 있는 영향은 무엇입니까?
대형 와이드 테이블의 성능을 개선하기 위한 주요 새 작업으로 여러 가져오기 루틴 및 분석이 훨씬 더 빨라졌습니다. 각 단계의 결과는 훨씬 더 즉각적이어서 역추적, 나란히 비교, 중요한 발견 및 결론에 대한 신속한 수렴을 위한 보다 준비된 해석 및 가능성을 허용합니다.
이에 대해 사용자를 놀라게 하거나 기쁘게 하는 것이 무엇이라고 생각합니까?
많은 사용자는 새로운 JMP Pro 프레임워크 내에서 상세한 게놈 데이터 분석이 얼마나 빠르고 강력한지 놀랄 것입니다. 우리는 또한 JMP Pro를 이러한 유형의 문제에 적용하는 방법을 안내하기 위해 동반 온라인 책인 Genomic Analysis with JMP Pro를 만들었습니다.
