Das Verständnis von Positionseffekten in Mikrotiterplatten-basierten Assays ist ein wichtiger Schritt bei der Entwicklung robuster Wirksamkeitsassays zum Testen von Biologika. Hier stellen wir eine maßgeschneiderte JMP-Anwendung vor, die die Analyse von Experimenten mit mehreren Platten automatisiert, die darauf abzielen, Plattenverzerrungen zu erkennen. Die Anwendung erstellt unter Verwendung der Rohausgabedatei des Plattenlesegeräts Plattenkartenvisualisierungen, berechnet IC50/EC50 von Medikamentendosis-Wirkungskurven und analysiert Zeilen- und Spaltenvariabilitäten über Platten hinweg. Was Wissenschaftler normalerweise einen halben Tag für die Analyse, die fehleranfällige manuelle Formatierung von Datensätzen und die Notwendigkeit externer Software für die Kurvenanpassung benötigten, kann jetzt in JMP in weniger als 1 Minute erreicht werden.
Während des Vortrags wurden die Microtiter-Map-Shape-Dateien erwähnt. Hier der Link: Formdefinitionsdatei für Mikrotiter-Well-Platten – 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 und 9600 Well