C42 全基因組關聯研究 (GWAS) - 伯恩山犬組織細胞肉瘤(癌症)本案例研究的重點是如何使用 JMP Pro 17 進行組學數據分析,特別是基因型/SNP 數據。 它主要著眼於全基因組關聯研究 (GWAS) 工作流程。這種類型的分析通常由統計遺傳學家、遺傳學家和/生物學家執行,以了解遺傳學/DNA與表型/性狀/醫學狀況的關聯
本案例研究可用於由 SE 為有興趣分析“動物研究/癌症領域的組學數據”的客戶提供演示。 它的設計使您可以僅顯示客戶要求的功能(使用 Great Demo!方法),而且還可以在分析此類數據的整個分析工作流的上下文中顯示。 如果您確實嘗試演示所有功能,則需要一個多小時,因為使用了許多功能。
包含的日誌包含輸出以及腳本按鈕,用於在每個步驟中執行分析。 還有一些腳本按鈕也可以執行一些數據操作任務。
還使用了維恩圖加載項
有什麼可用的
- 介紹工作流程、科學/研究問題和使用的數據集的期刊
- 包含每個分析的日誌、文件、表格和輸出/報告的項目
- 數據集,你可以自己做
為什麼這很有用?
- JMP Genomics 作為產品已於今年早些時候停產,因此我們需要案例研究來展示如何在 JMP Pro 17 中執行“組學分析”
- 它還強調了 JMP/JMP Pro 17 中針對寬數據的新功能,尤其是在“組學數據”的背景下
- 它還旨在幫助 SE 在給定的演示中變得更加自給自足,並討論“組學空間”中的功能
- “組學”世界中的數據分析本質上可以是腳本化的/工作流導向的或探索性的。 本案例研究將側重於數據分析的更具探索性的性質,而不是“自動化”或腳本類型分析。 可以使用 JMP Pro 17 的工作流構建功能將這些步驟轉換為工作流。 在不久的將來,我將嘗試創建一個並將其附加到此案例研究中,作為概念證明。
實例探究數據表JMP基因組學期刊培訓教材