La cromatografía de intercambio catiónico (CEX) es el estándar de oro de la industria para el análisis de variantes de carga de productos biofarmacéuticos, como los anticuerpos monoclonales (mAb). Sin embargo, el desarrollo de métodos CEX de manera eficiente en términos de tiempo y recursos constituye un cuello de botella en la caracterización de proteínas. Las separaciones CEX son complejas y se rigen por múltiples factores, como la química de la columna, el tipo de gradiente, el caudal, la composición de la fase móvil y el pH. Varias publicaciones científicas han demostrado la aplicación exitosa del diseño de experimentos (DoE) en el desarrollo de métodos de cromatografía. Sin embargo, realizar DoE con una gran cantidad de factores puede ser desafiante, lento y costoso. Este trabajo ilustra el uso de un enfoque de DoE dividido para ayudar al desarrollo de un método CEX para el análisis del perfil de variantes de carga de un candidato de mAb. El desarrollo del método analítico tenía como objetivo proporcionar un método CEX de alto rendimiento (HT) para respaldar el análisis de variantes de carga con requisitos mínimos de muestra y tiempo. El enfoque split-DoE se basa en el conocimiento fundamental del mecanismo de separación CEX y tiene como objetivo reducir la cantidad de ejecuciones experimentales mientras se explora un amplio espacio experimental. Se utilizó un modelo de regresión para estudiar el efecto de los parámetros de proceso individuales y sus interacciones en la eficiencia de separación para finalmente identificar las condiciones óptimas del método. Este estudio proporciona un flujo de trabajo eficiente para aprovechar el desarrollo de métodos CEX.