Come posso condurre un'analisi di sensibilità globale in JMP?<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Ciao. Primo post sul forum per me... Sono un ecologista ricercatore con un'enfasi sulla conservazione della fauna selvatica. Non è il tipico utente di JMP, immagino. Ho sviluppato e testato un complesso modello di simulazione basato sull'individuo delle dinamiche delle popolazioni di uccelli. Attualmente sono al punto dell'analisi del modello, in cui sarebbe appropriata un'analisi di sensibilità globale basata sulla varianza. Mi chiedo se JMP abbia gli strumenti per completare un'analisi del genere.
Anche se utilizzo JMP da anni per le analisi statistiche di base e l'esplorazione grafica dei dati, sono nuovo nell'utilizzo dei diversi strumenti di profilazione e della piattaforma Design of Experiments. Mi sembra che questi strumenti siano stati sviluppati per soddisfare esigenze in discipline molto diverse (ad esempio, Six Sigma, percorsi clinici in medicina). Di conseguenza, parte della terminologia mi è del tutto estranea rispetto agli standard del mio campo (vedi documento allegato di Cariboni et al. (2007). Nella modellazione ecologica, l'analisi di sensibilità è spesso descritta come il processo di variazione sistematica dei valori dei parametri nello spazio dei parametri di un modello per comprendere il grado in cui i diversi parametri influenzano i risultati chiave del modello e identificare i parametri più influenti.
Riesco a vedere chiaramente elementi di questo tipo di analisi nei profiler e nelle piattaforme DOE, ma non sono riuscito a capire quale piattaforma/strumenti potrei utilizzare per il tipo di analisi di sensitività tipicamente applicata nella modellazione ecologica (vedi allegati aggiuntivi) . Nello specifico, come posso ottenere il tipo di output di sensibilità dei parametri tipici delle analisi di sensibilità?
Ho allegato 4 documenti a questo post per illustrare ciò di cui sto parlando. Spero di lavorare solo in una tradizione di analisi diversa rispetto alla maggior parte degli utenti di JMP e che gli strumenti esistenti possano soddisfare le mie esigenze. In particolare, mi piacerebbe poter eseguire il processo di analisi in 2 fasi del documento allegato di Song et al. (2012), che per prima applica un disegno di screening (Campologo et al. 2007) per limitare il numero di parametri che verrebbero inclusi in un'analisi di sensitività globale basata sulla varianza (Saltelli et al. 2010).
Sarei grato per l'aiuto che chiunque può fornire per aiutare a colmare la distanza tra le analisi di sensibilità nella modellazione ecologica e le analisi di tipo DOE/profiler che possono essere eseguite in JMP.
Cordiali saluti,
Casey Lott
Conservazione americana degli uccelli
(208) 629-8705
Ri: Come posso condurre un'analisi di sensibilità globale in JMP?Grazie, @Ian. Spero che questa domanda generi qualche discussione. Dopo aver riletto i documenti che ho allegato al mio messaggio, penso che potrei probabilmente manifestare il mio interesse e porre alcune domande in modo più specifico:
In primo luogo, vorrei adottare l'approccio in due fasi verso l'analisi della sensibilità illustrato in Song et al. documento che è allegato al mio post originale. Ciò significa che vorrei iniziare utilizzando il metodo Morris modificato pubblicato in Campolongo et al. 2007 da calcolare l'indice di sensibilità agli effetti elementari (EE) con l'obiettivo di "fissare i fattori", ovvero trovare quali parametri hanno un effetto minimo sugli output del modello in modo che possano essere: 1) rimossi dal modello tramite la semplificazione del modello o 2) corretti a un valore qualsiasi nel loro intervallo e ignorato nelle analisi successive. Qualcuno può indicarmi la funzione di JMP che potrei utilizzare per condurre questo tipo di analisi? Se questo indice (l'indice di sensibilità EE) può essere calcolato in JMP, mi piacerebbe poter cercare i dettagli statistici per vedere se viene calcolato seguendo Morris 1991, o i metodi aggiornati presentati in Campolongo et al. 2007, o qualche altro insieme di metodi in cui posso fare riferimento a un documento originale E a un numero di pagina o sezione specifica della documentazione di JMP. In particolare, sarei interessato a calcolare l'indice di sensibilità EE sia per singoli fattori che per gruppi di fattori. Se JMP fa qualcosa di simile, ma utilizza un metodo diverso, mi piacerebbe un aiuto per trovare la mia strada. Ancora una volta, sono molto nuovo nelle piattaforme/strumenti in JMP che potrebbero fare questo genere di cose.
In secondo luogo, mi piacerebbe eseguire un'analisi di sensibilità basata sulla varianza più dettagliata, utilizzando gli indici di sensibilità all'effetto principale e all'effetto totale che sono stati presentati in molti articoli di Saltelli e colleghi e più recentemente aggiornati, per quanto ne so, in Saltelli et al. 2010 (che ho anche allegato al mio post originale). Ho guardato il link che Ian ha inviato per valutare l'importanza della variabile e poi sono andato al link dei dettagli statistici all'interno di quel testo. Sembra che JMP stia utilizzando una qualche forma di questi indici, poiché questo testo fa riferimento a Saltelli 2002. Sarei curioso di sapere se qualcuna delle piattaforme/strumenti JMP esistenti segue i metodi aggiornati descritti in dettaglio in Saltelli et al. 2010. Ancora una volta, se qualcuno può aiutarmi a navigare nella documentazione di JMP per capirlo, sarei grato.
In definitiva, mi piacerebbe essere in grado di eseguire un'analisi di sensibilità per un articolo sottoposto a peer review e citare gli articoli originali appropriati per i dettagli statistici (ad esempio, Campolongo et al. 2007, Saltelli et al. 2010). Non sono sicuro che ciò sia possibile o se sarebbe più appropriato citare solo la documentazione di JMP per piattaforme/strumenti esistenti. Se questo è il caso, vorrei essere sicuro di utilizzare quelli giusti e che siano almeno analoghi, se non esattamente uguali, agli approcci delineati nei due articoli sopra elencati (e forniti nel mio post originale).
Grazie in anticipo per l'aiuto che chiunque può fornire su questo.
Ri: Come posso condurre un'analisi di sensibilità globale in JMP?Sfortunatamente, non ho avuto il tempo di rendere giustizia alla tua domanda.
Penso che sia giusto dire che JMP supporta bene un approccio sequenziale alla sperimentazione (indipendentemente dal fatto che la risposta abbia rumore), anche se il relativamente recente Disegni di screening definitivi sconvolgere un po' questo paradigma.
Scanning Song et al, vedo che menzionano il metodo Sobol. Nel caso possa esserti d'aiuto, volevo informarti che Valutare l'importanza delle variabili in Profiler di JMP utilizza questo approccio.
