Come posso condurre un'analisi di sensibilità globale in JMP?<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Ciao. Primo messaggio per me sul forum... Sono un ecologista ricercatore con un'enfasi sulla conservazione della fauna selvatica. Non il tipico utente JMP, immagino. Ho sviluppato e testato un complesso modello di simulazione individuale della dinamica delle popolazioni di uccelli. Attualmente sono al punto dell'analisi del modello, in cui sarebbe appropriata un'analisi della sensibilità globale basata sulla varianza. Mi chiedo se JMP ha gli strumenti per completare un'analisi del genere.
Anche se ho usato JMP per anni per analisi statistiche di base e per l'esplorazione grafica dei dati, sono nuovo nell'uso dei diversi strumenti del profiler e della piattaforma Design of Experiments. Mi sembra che questi strumenti siano stati sviluppati per soddisfare bisogni in discipline molto diverse (es. Six Sigma, percorsi clinici in medicina). Di conseguenza, parte della terminologia mi è abbastanza estranea rispetto agli standard del mio campo (vedi documento allegato di Cariboni et al. (2007). Nella modellazione ecologica, l'analisi della sensibilità è spesso descritta come il processo di variazione sistematica dei valori dei parametri attraverso lo spazio dei parametri di un modello per comprendere il grado in cui parametri diversi influenzano i risultati chiave del modello e identificare i parametri più influenti.
Riesco a vedere chiaramente elementi di questo tipo di analisi nei profiler e nelle piattaforme DOE, ma non sono stato in grado di capire quale piattaforma/strumenti potrei utilizzare per il tipo di analisi di sensibilità tipicamente applicata nella modellazione ecologica (vedi allegati aggiuntivi) . In particolare, come posso ottenere il tipo di output di sensibilità dei parametri che sono tipici delle analisi di sensibilità?
Ho allegato 4 articoli a questo post per illustrare di cosa sto parlando. Spero di lavorare in una tradizione di analisi diversa rispetto alla maggior parte degli utenti JMP e che gli strumenti esistenti possano soddisfare le mie esigenze. In particolare, mi piacerebbe essere in grado di eseguire il processo di analisi in 2 fasi del documento allegato di Song et al. (2012), che in primo luogo applica un disegno di screening (Campologo et al. 2007) per limitare il numero di parametri che sarebbero inclusi in un'analisi di sensibilità globale basata sulla varianza (Saltelli et al. 2010).
Sarei grato per l'aiuto che chiunque può fornire per aiutare a colmare la distanza tra le analisi di sensibilità nella modellazione ecologica e le analisi di tipo DOE/profiler che possono essere eseguite in JMP.
Cordiali saluti,
Casey Lott
Conservazione degli uccelli americani
(208) 629-8705
Re: Come si esegue un'analisi di sensibilità globale in JMP?Grazie, @Ian. Spero che questa domanda generi qualche discussione. Dopo aver riletto i documenti che ho allegato al mio messaggio, penso che potrei probabilmente esprimere il mio interesse e porre alcune domande in modo più specifico:
In primo luogo, vorrei adottare l'approccio in due fasi verso l'analisi della sensibilità che è illustrato in Song et al. foglio che è allegato al mio post originale. Ciò significa che vorrei iniziare utilizzando il metodo Morris modificato pubblicato in Campolongo et al. 2007 da calcolare l'Elementary Effects (EE) Sensitivity Index con l'obiettivo del "factor fixing", ovvero trovare quali parametri hanno un effetto minimo sugli output del modello in modo che possano essere: 1) rimossi dal modello tramite la semplificazione del modello o 2) corretti a un valore in qualsiasi punto del loro intervallo e ignorato nelle analisi successive. Qualcuno può indicarmi la funzione in JMP che potrei utilizzare per condurre questo tipo di analisi? Se questo indice (l'indice di sensibilità EE) può essere calcolato in JMP, mi piacerebbe essere in grado di cercare i dettagli statistici per vedere se viene calcolato seguendo Morris 1991, o i metodi aggiornati presentati in Campolongo et al. 2007 o un altro insieme di metodi in cui posso fare riferimento a un documento originale E a un numero di pagina oa una sezione specifica della documentazione di JMP. In particolare, sarei interessato a calcolare l'indice di sensibilità EE sia per singoli fattori che per gruppi di fattori. Se JMP fa qualcosa di simile, ma utilizza un metodo diverso, mi piacerebbe un aiuto per trovare la mia strada. Ancora una volta, sono molto nuovo alle piattaforme/strumenti in JMP che possono fare questo genere di cose.
In secondo luogo, vorrei eseguire un'analisi di sensibilità più dettagliata basata sulla varianza, utilizzando gli indici di sensibilità dell'effetto principale e totale che sono stati presentati in molti articoli da Saltelli e colleghi e aggiornati più di recente, per quanto posso dire, in Saltelli et al. 2010 (che ho anche allegato al mio post originale). Ho guardato il link inviato da Ian per Valutare l'importanza della variabile e poi sono andato al link dei dettagli statistici all'interno di quel testo. Sembra che JMP stia utilizzando una qualche forma di questi indici, poiché questo testo fa riferimento a Saltelli 2002. Sarei curioso se qualcuno degli strumenti/piattaforme JMP esistenti segua i metodi aggiornati descritti in dettaglio in Saltelli et al. 2010. Ancora una volta, se qualcuno può aiutarmi a navigare nella documentazione di JMP per capirlo, gli sarei grato.
In definitiva, vorrei essere in grado di eseguire un'analisi di sensibilità per un articolo sottoposto a revisione paritaria e citare i documenti originali appropriati per i dettagli statistici (ad es. Campolongo et al. 2007, Saltelli et al. 2010). Non sono sicuro se ciò sia possibile o se sarebbe più appropriato citare semplicemente la documentazione di JMP per piattaforme/strumenti esistenti. Se questo è il caso, vorrei essere sicuro di utilizzare quelli giusti e che siano almeno analoghi, se non esattamente gli stessi, agli approcci delineati nei due articoli sopra elencati (e forniti nel mio post originale).
Grazie in anticipo per l'aiuto che chiunque può fornire su questo.
Re: Come si esegue un'analisi di sensibilità globale in JMP?Sfortunatamente, non ho avuto il tempo di rendere giustizia alla tua domanda.
Penso che sia giusto dire che JMP supporta bene un approccio sequenziale alla sperimentazione (indipendentemente dal fatto che la risposta abbia o meno rumore), anche se il relativamente recente Disegni di screening definitivi sconvolgere un po' questo paradigma.
Scansionando Song e altri, vedo che menzionano il metodo Sobol. Nel caso possa essere d'aiuto, volevo informartelo Valutare l'importanza delle variabili in Profiler di JMP utilizza questo approccio.