Frage zur Generierung aller möglichen Ergebnisse und zur Festlegung von LebensläufenHallo, ich bin ein einfacher Benutzer von JMP und verwende Version 15. Was ich versuche, ist, das optimale Plattenlayout für einen Hochdurchsatz-Assay zu bestimmen, das die Plattenpositionsverzerrungen minimiert. Dazu teste ich die Dosis-Wirkungs-Kurve der Probe auf drei Platten in allen Positionen und habe meine Ergebnisse. Was ich also habe, sind 10 gemeldete Werte für jede der drei Platten, und ich möchte wissen, welche Plattenpositionskombination die niedrigsten CVs erzeugt (d. h. ich weiß aus meinen Designs mit geringerem Durchsatz, dass es am besten ist, die Proben zu drehen, aber dieses Design erlaubt das nicht). Jede Probe muss sich an jeder Position befinden, da es sich um 10 Proben und 3 Platten handelt. Daher ist es am besten, Probe 1 in Position 2 auf Platte 1, Position 4 auf Platte 2 und Position 7 auf Platte 3 zu platzieren, um unter Berücksichtigung der Plattenpositionsabweichung den niedrigsten CV zu erzielen ). Anstatt die Ergebnisse aus jeder der 1000 möglichen Kombinationen in Excel durchzugehen und buchstäblich zu mitteln und die Lebensläufe zu finden, habe ich mich gefragt, ob es in JMP eine Funktion gibt, die es mir ermöglichen würde, sie zu kreuzen, und die alle Ergebnisse erzielen würde, nicht nur eine Satz von ihnen.
VersuchsplanungErgebnisse teilen und kommunizierenBetreff: Frage zur Generierung aller möglichen Ergebnisse und zur Festlegung von LebensläufenSchauen Sie sich die beigefügte Tabelle mit zwei weiteren gespeicherten Skripten an. Der erste Schritt besteht darin, die Vorhersageformel aus Fit Curve zu speichern und dann die zu verwenden Formelelement im Graph Builder. Beim zweiten wird lediglich ein Grafikskript verwendet, das aus dem Berichtsfenster „Kurve anpassen“ kopiert wird (klicken Sie mit der rechten Maustaste auf den weißen Grafikbereich und wählen Sie „Anpassen ...“, um alle mit dem Diagrammfeld verknüpften Skripte anzuzeigen). Das Ausführen des ersten neuen gespeicherten Skripts sollte Folgendes ergeben:
(Übrigens, wenn Sie etwas zu einem „alten“ Thread hinzufügen, kann es leicht passieren, dass Ihre Frage übersehen wird.)
Betreff: Frage zur Generierung aller möglichen Ergebnisse und zur Festlegung von LebensläufenEntschuldigung, dass ich einen älteren Thread gekapert habe, aber meine Situation scheint ähnlich zu sein:
- Dosis-Wirkungs-Kurve
- X-Achse: Dosisbereich (erfordert logarithmische Transformation)
- Y-Achse: Reaktion
- 2 bis 4 Messungen pro Dosis
Logistik 4P scheint in Ordnung zu sein, da ich an beiden Enden Asymptoten erwarte.
Ich kann die Fehlerbalken mit Graph Builder abrufen.
Das Problem liegt in der Visualisierung: Ich versuche, die Fehlerbalken auf die angepasste Kurve zu legen, wie es mit möglich ist Prisma .
Ich habe versucht, künstlich eine „Spalte 3“ hinzuzufügen, um meine Messungen zu gruppieren, aber ich kann nicht 2 Messungen „gruppieren“, wenn ich Logistic 4P (oder 3P) verwende.
Gibt es eine Möglichkeit, dasselbe in JMP (JMP16) zu tun?
Danke.
Betreff: Frage zur Generierung aller möglichen Ergebnisse und zur Festlegung von LebensläufenEs tut mir leid. Mir ist entgangen, dass Sie die Daten bereits haben.
Zusätzlich zu @MS Wenn Sie auf den Vorschlag von „Analysieren“ > „Qualität und Prozess“ > „Variabilitätsdiagramm“ zurückgreifen, könnte dies hilfreich sein. Weitere Informationen finden Sie in der JMP-Dokumentation Hier .
Betreff: Frage zur Generierung aller möglichen Ergebnisse und zur Festlegung von LebensläufenIch bin mir nicht sicher, wie Ihre Daten organisiert sind (vielleicht könnten Sie uns ein Beispiel geben), aber eine schnelle Möglichkeit, alle Kombinationen zu erstellen, ist die kartesische Verknüpfungsoption (Tabellen/Verbinden). Es wird eine erweiterte Tabelle erstellt und dann mithilfe der Zusammenfassung (oder Tabellarisierung) alle Mittelwert-, SD- und CV-Schätzungen berechnet.
Betreff: Frage zur Generierung aller möglichen Ergebnisse und zur Festlegung von LebensläufenObwohl dies alles gute Ideen für das Plattenlayout sind, können wir viele der empfohlenen Tests nicht durchführen, da sie keine brauchbaren Ergebnisse liefern würden. Ich denke, mein erster Beitrag war verwirrend. Der Grund, warum ich den CV bestimmen möchte, liegt darin, dass der Berichtswert für die Ergebnisse des 3-Platten-Assays der Durchschnitt der Probe (Erzeugung aus der Bewertung der Dosis-Wirkungs-Kurve als Ganzes, nicht ein einzelner Punkt) auf jeder der Platten ist und das Assay-Akzeptanzkriterium wird durch den %CV des Mittelwerts festgelegt. Ich kenne bereits die Verzerrungen, die der Assay aufgrund der Inkubatorposition und der Probenposition hat, und nachdem ich überprüft habe, was wir können, habe ich meine Ergebnisse und als Letztes muss ich die optimale Rotation einer Probe über die drei Platten bestimmen, um die Standortverzerrungen weiter abzuschwächen. Insgesamt hatte ich auf eine Funktion in JMP gehofft, die es mir ermöglichen würde, alle möglichen Durchschnittswerte, Standardabweichungen und Lebensläufe zu berechnen, da ich alle meine Daten habe und dies in Excel zeitaufwändig ist, aber nach dem, was ich gesehen habe, glaube ich es nicht verfügt über ein Add-In oder eine Funktion.
Betreff: Frage zur Generierung aller möglichen Ergebnisse und zur Festlegung von LebensläufenIch möchte auf die verfügbaren benutzerdefinierten Formdateien hinweisen, die dabei helfen, die Verzerrung und Varianz zwischen den Wells mit Graph Builder zu visualisieren. Eine Beschreibung und die Dateien finden Sie hier: Mikrotiter-Formdateien
Betreff: Frage zur Generierung aller möglichen Ergebnisse und zur Festlegung von LebensläufenIch habe nicht genügend Informationen, um konkrete Ratschläge zu geben, aber um Marks Antwort zu ergänzen: Vielleicht ist das Wort zur Beschreibung der Phänomene innerhalb der Platte „Variation vs. Bias“ (zumindest bis Sie verstehen, ob diese Variation konsistent ist und es eine mittlere Verschiebung gibt)? Ich bin mir nicht sicher, warum Sie jede mögliche Kombination benötigen? Ich würde mit Hypothesen beginnen (z. B. Warum sollte es Unterschiede an den verschiedenen Orten auf den Platten geben? Warum vermuten Sie eine Wechselwirkung zwischen Dosiskurven und Plattenposition?). Möglicherweise gibt es eine Teilmenge der Standorte innerhalb der Platte, die Sie in einem Experiment testen könnten (überlegen Sie, welche Standorte am unterschiedlichsten wären und warum). Wenn Sie diese Zahl reduzieren können, können Sie einen effizienteren Test entwerfen.
Ich bin mir nicht sicher, wie viele Tests Sie durchführen, aber könnten Sie die Probenahme (Komponente der Variationsstudie) verwenden, um Schätzungen der Variation innerhalb der Platte, von Platte zu Platte und von Test zu Test über viele Platten im Laufe der Zeit zu erhalten?
Betreff: Frage zur Generierung aller möglichen Ergebnisse und zur Festlegung von LebensläufenBias und Varianz sind unterschiedliche Merkmale der Antwort. Bias ist der systematische Fehler und Varianz ist der Zufallsfehler. Außerdem erfordert die Varianz eine viel größere Stichprobengröße, um ebenso geschätzt zu werden wie der Mittelwert.
Warum nicht mit einem einfacheren Design beginnen, anstatt die gesamte Dosis-Wirkungs-Kurve auf jeder Platte zu reproduzieren? Warum nicht denselben Standard testen, der eine Reaktion in der Nähe des Wendepunkts der Kurve erzeugen sollte? Diese Reaktion sollte am empfindlichsten auf Positionseffekte reagieren. Lassen Sie die gleiche Probe in allen 96 Vertiefungen aller Platten laufen. Sie könnten den Entwurf sparen, indem Sie einige Zeilen und Spalten überspringen, wenn Sie einen gleichmäßigen, kontinuierlichen, möglicherweise nichtlinearen Wechsel über die Platte erwarten. Möglicherweise benötigen Sie jedoch mehr Platten, da die CV-Schätzungen über die Platten hinweg mit nur drei Wiederholungen schlecht ausfallen.
