考えられるすべての結果の生成と CV の決定に関する質問こんにちは、私はバージョン 15 を使用する JMP の基本ユーザーです。 私がやろうとしているのは、プレート位置の偏りを最小限に抑えるハイスループットアッセイに最適なプレートレイアウトを決定することです。 これを行うために、3 つのプレートのすべての位置でサンプルの用量反応曲線をテストし、その結果を得ました。 したがって、私が持っているのは、3 つのプレートのそれぞれについて 10 個の報告された値であり、どのプレート位置の組み合わせが最も低い CV を生成するかを知りたいと考えています（つまり、スループットが低いことからわかっていることは、サンプルを回転させるのが最適な設計ですが、この設計ではそれができません） 10 個のサンプルと 3 枚のプレートがあるため、各サンプルは各位置に配置される必要があります。プレート位置の偏りを考慮して、CV が最も低くなるように、サンプル 1 をプレート 1 の位置 2、プレート 2 の位置 4、プレート 3 の位置 7 に配置するのが最善ですか? ）。 Excel で 1000 通りの組み合わせのそれぞれから結果の CV を文字通り平均して見つけるのではなく、JMP にそれらを横断できる機能があり、単なる結果だけでなくすべての結果を実行できるのではないかと考えていました。それらのセット。
実験計画法結果の共有と伝達Re: 考えられるすべての結果の生成と CV の決定に関する質問さらに 2 つの保存されたスクリプトを含む添付の表を見てください。 1 つ目は、フィット カーブから予測式を保存し、数式要素グラフビルダーで。 2 つ目は、フィット カーブ レポート ウィンドウからコピーしたグラフィックス スクリプトを使用するだけです (白いグラフィックス領域を右クリックし、[カスタマイズ...] を選択すると、グラフ ボックスに関連付けられたすべてのスクリプトが表示されます)。 最初に新しく保存したスクリプトを実行すると、次の結果が得られます。
(ところで、「古い」スレッドに追加すると、質問が見落とされやすくなります)。
Re: 考えられるすべての結果の生成と CV の決定に関する質問古いスレッドをハイジャックして申し訳ありませんが、私の状況も同様のようです。
- 用量反応曲線
- X 軸: 線量の範囲 (対数変換が必要)
- Y軸: 応答
- 1 回の投与につき 2 ～ 4 回の測定
ロジスティック4P両端に漸近線があることが予想されるので、問題ないようです。
グラフビルダーを使用して誤差範囲を取得できます。
問題は視覚化にあります。次のようにして、誤差範囲を近似曲線に重ね合わせようとしています。プリズム。
測定値をグループ化するために人為的に「列 3」を追加しようとしましたが、ロジスティック 4P (または 3P) を使用している場合、2 つの測定値を「グループ化」できません。
JMP (JMP16) で同じことを行う方法はありますか?
ありがとう。
Re: 考えられるすべての結果の生成と CV の決定に関する質問ごめんなさい。 すでにデータをお持ちであることを見逃していました。
に加えて@MSさんの提案では、「分析」>「品質とプロセス」>「変動グラフ」が役に立つかもしれません。 JMP ドキュメントを参照してください。ここ。
Re: 考えられるすべての結果の生成と CV の決定に関する質問データがどのように編成されているかはわかりませんが (例を共有できるかもしれません)、すべての組み合わせを簡単に作成する方法の 1 つは、デカルト結合オプション (テーブル/結合) です。 展開されたテーブルが作成され、概要 (または表) を使用して、すべての平均、SD、および CV 推定値が計算されます。
Re: 考えられるすべての結果の生成と CV の決定に関する質問これらはすべて、プレート レイアウトにとってはそれ自体良いアイデアですが、推奨されるアッセイの多くは実行できず、有用な結果が得られません。 私の最初の投稿は混乱を招くものだったと思います。 CV を決定したい理由は、3 プレートアッセイの結果について報告できるのは、各プレートのサンプルの平均 (単一点ではなく全体として用量反応曲線の評価から生成される) であるためです。アッセイの許容基準は平均値の %CV によって設定されます。 インキュベーターの位置とサンプルの位置からアッセイに生じるバイアスはすでにわかっており、何ができるかを制御した後、結果が得られます。最後に、位置のバイアスをさらに軽減するために 3 つのプレートにわたるサンプルの最適な回転を決定します。 全体的に、私はすべてのデータを持っており、Excelでそれを行うのは時間がかかるため、考えられるすべての平均、標準偏差、およびCVを計算できるJMPの関数を期待していましたが、私が見たものから、それは信じられませんアドインまたは機能があります。
Re: 考えられるすべての結果の生成と CV の決定に関する質問グラフ ビルダーを使用してウェル全体のバイアスと分散を視覚化するのに役立つカスタム形状ファイルが利用できることを指摘したいと思います。 説明とファイルは次の場所にあります。マイクロタイター形状ファイル
Re: 考えられるすべての結果の生成と CV の決定に関する質問具体的なアドバイスを提供するのに十分な情報がありませんが、マークの応答に追加すると、おそらくプレート内の現象を説明する言葉は変動対偏りです（少なくとも、この変動が一貫していて平均シフトがあるかどうかを理解するまでは）。 なぜすべての可能な組み合わせが必要なのかわかりません。 私は仮説から始めます（たとえば、なぜプレート全体の異なる位置にばらつきがあるのでしょうか？） なぜ線量曲線とプレートの位置との間に相互作用があると疑うのですか?)。 おそらく、実験でテストできるプレート内の位置のサブセットがあるでしょう (どの位置が最も異なるか、そしてその理由を考えてください)。 この数を減らすことができれば、より効率的なテストを設計できます。
実行するアッセイの数がわかりませんが、サンプリング (変動研究のコンポーネント) を使用して、プレート内、プレート間、および多数のプレートにわたるアッセイ間の変動の経時的な推定値を得ることができますか?
Re: 考えられるすべての結果の生成と CV の決定に関する質問バイアスと分散は、応答の異なる特性です。 バイアスは系統誤差、分散はランダム誤差です。 また、分散を推定するには平均よりもはるかに大きなサンプル サイズが必要です。
各プレートにわたって用量反応曲線全体を複製する代わりに、より単純な設計から始めてみてはいかがでしょうか。 曲線の変曲点付近で応答を生成するはずの同じ標準をテストしてみませんか? その応答は位置の影響に最も敏感でなければなりません。 すべてのプレート上の 96 ウェルすべてに同じサンプルを実行します。 プレート上で滑らかな連続的な、場合によっては非線形の変化が期待される場合は、いくつかの行と列をスキップして設計を節約できます。 ただし、反復回数が 3 回のみではプレート全体の CV 推定値が低くなるため、さらに多くのプレートが必要になる場合があります。
