Frage zum Generieren aller möglichen Ergebnisse und zum Bestimmen von LebensläufenHallo, ich bin ein einfacher Benutzer von JMP und verwende Version 15. Ich versuche, das optimale Plattenlayout für einen Hochdurchsatz-Assay zu bestimmen, der die Verzerrungen der Plattenposition minimiert. Dazu teste ich die Dosis-Antwort-Kurve der Probe über 3 Platten in allen Positionen und ich habe meine Ergebnisse. Was ich also habe, sind 10 gemeldete Werte für jede der 3 Platten, und ich möchte wissen, welche Plattenpositionskombination die niedrigsten CVs erzeugt (dh was ich aus meinen Designs mit geringerem Durchsatz weiß, ist es am besten, die Proben zu drehen, aber dieses Design erlaubt es nicht Jede Probe muss sich in jeder Position befinden, da es 10 Proben und 3 Platten gibt. Daher ist es am besten, Probe 1 in Position 2 auf Platte 1, Position 4 auf Platte 2 und Position 7 auf Platte 3 zu platzieren, um den niedrigsten CV unter Berücksichtigung der Plattenpositionsabweichung zu erhalten ). Anstatt die Lebensläufe der Ergebnisse von jeder der 1000 möglichen Kombinationen in Excel durchzugehen und buchstäblich zu mitteln und zu finden, habe ich mich gefragt, ob es eine Funktion in JMP gibt, die es mir ermöglichen würde, sie zu kreuzen, und es würde alle Ergebnisse machen, nicht nur a Satz von ihnen.
AnalytikBetreff: Frage zum Generieren aller möglichen Ergebnisse und zum Bestimmen von LebensläufenEntschuldigung für das Hijacking eines älteren Threads, aber meine Situation scheint ähnlich zu sein:
- Dosis-Wirkungs-Kurve
- X-Achse: Dosisbereich (erfordert logarithmische Transformation)
- Y-Achse: Antwort
- 2 bis 4 Messungen pro Dosis
Logistik 4P scheint in Ordnung zu sein, da ich Asymptoten an beiden Enden erwarte.
Ich kann die Fehlerbalken mit Graph Builder abrufen.
Das Problem liegt bei der Visualisierung: Ich versuche, die Fehlerbalken auf die angepasste Kurve zu legen, wie dies mit möglich ist Prisma .
Ich habe versucht, künstlich eine "Spalte 3" hinzuzufügen, um meine Messungen zu gruppieren, aber ich kann 2 Messungen nicht "gruppieren", wenn ich Logistic 4P (oder 3P) verwende.
Gibt es eine Möglichkeit, dasselbe in JMP (JMP16) zu tun?
Vielen Dank.
Betreff: Frage zum Generieren aller möglichen Ergebnisse und zum Bestimmen von LebensläufenEs tut mir leid. Ich habe übersehen, dass Sie die Daten bereits haben.
Zusätzlich zu @Frau 's Vorschlag finden Sie möglicherweise Analysieren > Qualität und Prozess > Variabilitätsdiagramm hilfreich. Siehe die JMP-Dokumentation hier .
Betreff: Frage zum Generieren aller möglichen Ergebnisse und zum Bestimmen von LebensläufenSie sind sich nicht sicher, wie Ihre Daten organisiert sind (vielleicht könnten Sie ein Beispiel teilen), aber eine schnelle Möglichkeit, alle Kombinationen zu erstellen, ist die kartesische Join-Option (Tables/Join). Es erstellt eine erweiterte Tabelle und verwendet dann Summary (oder Tabulate), um alle Mittelwert-, SD- und CV-Schätzungen zu berechnen.
Betreff: Frage zum Generieren aller möglichen Ergebnisse und zum Bestimmen von LebensläufenWährend all dies für sich genommen gute Ideen für das Plattenlayout sind, können wir viele der empfohlenen Assays nicht durchführen, da sie keine brauchbaren Ergebnisse liefern würden. Ich glaube, mein Anfangspost war verwirrend. Der Grund, warum ich den CV bestimmen möchte, ist, dass die Ergebnisse des 3-Platten-Assays der Durchschnitt der Probe (Erzeugung aus der Bewertung der Dosis-Wirkungs-Kurve als Ganzes, kein einzelner Punkt) auf jeder der Platten ist und die Assay-Akzeptanzkriterien werden durch den %CV des Mittelwerts festgelegt. Ich kenne bereits die Abweichungen, die der Assay von der Inkubatorposition und der Probenposition hat, und nachdem ich kontrolliert habe, was wir können, habe ich meine Ergebnisse und als letztes muss ich die optimale Rotation einer Probe über die 3 Platten bestimmen, um die Standortabweichungen weiter abzuschwächen. Insgesamt hatte ich auf eine Funktion in JMP gehofft, mit der ich alle möglichen Durchschnitte, Standardabweichungen und CVs berechnen kann, da ich alle meine Daten habe und dies in Excel zeitaufwändig ist, aber nach dem, was ich gesehen habe, glaube ich es nicht hat ein Add-In oder eine Funktion.
Betreff: Frage zum Generieren aller möglichen Ergebnisse und zum Bestimmen von LebensläufenIch möchte auf die verfügbaren benutzerdefinierten Formdateien hinweisen, um die Verzerrung und die Varianz zwischen den Vertiefungen mit Graph Builder zu visualisieren. Eine Beschreibung und die Dateien finden Sie hier: Mikrotiter-Formdateien
Betreff: Frage zum Generieren aller möglichen Ergebnisse und zum Bestimmen von LebensläufenIch habe nicht genügend Informationen, um spezifische Ratschläge zu geben, aber um Marks Antwort hinzuzufügen, lautet das Wort zur Beschreibung des Phänomens innerhalb der Platte vielleicht Variation vs. Bias (zumindest bis Sie verstehen, ob diese Variation konsistent ist und es eine mittlere Verschiebung gibt)? Ich bin mir nicht sicher, warum Sie jede mögliche Kombination brauchen? Ich würde mit Hypothesen beginnen (z. B. Warum sollte es Unterschiede an den verschiedenen Orten auf den Platten geben? Warum vermuten Sie eine Wechselwirkung zwischen Dosiskurven und Plattenposition?). Vielleicht gibt es eine Teilmenge der Positionen innerhalb der Platte, die Sie in einem Experiment testen könnten (überlegen Sie, welche Positionen am unterschiedlichsten wären und warum). Wenn Sie diese Anzahl reduzieren können, können Sie einen effizienteren Test entwerfen.
Ich bin mir nicht sicher, wie viele Assays Sie durchführen, aber könnten Sie Stichproben (Bestandteil der Variationsstudie) verwenden, um Schätzungen der Variation innerhalb der Platte, von Platte zu Platte und von Assay zu Assay über viele Platten im Laufe der Zeit zu erhalten?
Betreff: Frage zum Generieren aller möglichen Ergebnisse und zum Bestimmen von LebensläufenBias und Varianz sind unterschiedliche Merkmale der Antwort. Bias ist der systematische Fehler und Varianz ist der zufällige Fehler. Außerdem erfordert die Varianz einen viel größeren Stichprobenumfang, um ebenso wie der Mittelwert geschätzt zu werden.
Anstatt die gesamte Dosis-Wirkungs-Kurve über jede Platte zu replizieren, warum nicht mit einem einfacheren Design beginnen? Warum nicht den gleichen Standard testen, der eine Antwort in der Nähe des Wendepunkts der Kurve erzeugen sollte? Diese Reaktion sollte am empfindlichsten auf Auswirkungen der Position reagieren. Lassen Sie dieselbe Probe in allen 96 Vertiefungen auf allen Platten laufen. Sie könnten das Design einsparen, indem Sie einige Zeilen und Spalten überspringen, wenn Sie eine glatte kontinuierliche, möglicherweise nichtlineare Änderung über die Platte erwarten. Möglicherweise benötigen Sie jedoch mehr Platten, da die CV-Schätzungen über die Platten hinweg bei nur drei Wiederholungen schlecht sind.
