Question sur la génération de tous les résultats possibles et la détermination des CVBonjour, je suis un utilisateur basique de JMP avec la version 15. Ce que j'essaie de faire, c'est de déterminer la disposition optimale des plaques pour un test à haut débit qui minimise les biais d'emplacement des plaques. Pour ce faire, je teste la courbe dose-réponse de l'échantillon sur 3 plaques dans toutes les positions et j'ai mes résultats. Donc, ce que j'ai, c'est 10 valeurs rapportées pour chacune des 3 plaques et je veux savoir quelle combinaison d'emplacement de plaque produit les CV les plus bas (c'est-à-dire ce que je sais de mes conceptions à débit inférieur, il est préférable de faire pivoter les échantillons, mais cette conception ne permet pas chaque échantillon doit être dans chaque position depuis ses 10 échantillons et 3 plaques, il est donc préférable de mettre l'échantillon 1 en position 2 sur la plaque 1, la position 4 sur la plaque 2 et la position 7 sur la plaque 3 pour le CV le plus bas en tenant compte du biais de localisation de la plaque ). Au lieu de parcourir et de faire littéralement la moyenne et de trouver les CV des résultats de chacune des 1000 combinaisons possibles dans Excel, je me demandais s'il y avait une fonctionnalité dans JMP qui me permettrait de les croiser et cela ferait tous les résultats pas seulement un ensemble d'entre eux.
AnalytiqueRe : Question sur la génération de tous les résultats possibles et la détermination des CVToutes mes excuses pour le détournement d'un ancien fil, mais ma situation semble être similaire:
- Courbe dose-réponse
- Axe X : gamme de doses (nécessite une transformation logarithmique)
- Axe Y : réponse
- 2 à 4 mesures par dose
Logistique 4P semble bien, puisque je m'attends à des asymptotes aux deux extrémités.
Je peux obtenir les barres d'erreur en utilisant Graph Builder.
Le problème est avec la visualisation : j'essaie de superposer les barres d'erreur sur la courbe ajustée, comme cela peut être fait en utilisant Prisme .
J'ai essayé d'ajouter artificiellement une "Colonne 3" pour regrouper mes mesures, mais je ne peux pas "grouper" 2 mesures lorsque j'utilise Logistic 4P (ou 3P).
Existe-t-il un moyen de faire la même chose dans JMP (JMP16) ?
Merci.
Re : Question sur la génération de tous les résultats possibles et la détermination des CVJe suis désolé. J'ai raté le fait que vous avez déjà les données.
En plus de @Mme , vous pourriez trouver Analyse > Qualité et processus > Tableau de variabilité utile. Voir la documentation JMP ici .
Re : Question sur la génération de tous les résultats possibles et la détermination des CVVous ne savez pas comment vos données sont organisées (vous pourriez peut-être partager un exemple), mais un moyen rapide de créer toutes les combinaisons est l'option de jointure cartésienne (Tables/Join). Il créera un tableau développé, puis utilisera Résumé (ou Tabuler) pour calculer toutes les estimations moyennes, SD et CV.
Re : Question sur la génération de tous les résultats possibles et la détermination des CVBien que toutes ces idées soient de bonnes idées pour la disposition des plaques, nous ne pouvons pas effectuer la plupart des tests recommandés, ils ne donneraient pas de résultats utiles. Je pense que mon message initial était confus. La raison pour laquelle je veux déterminer le CV est que le rapport pour les résultats du test à 3 plaques est la moyenne de l'échantillon (génération à partir de l'évaluation de la courbe dose-réponse dans son ensemble et non d'un seul point) sur chacune des plaques et les critères d'acceptation du dosage sont définis par le % CV de la moyenne. Je connais déjà les biais du test à partir de la position de l'incubateur et de la position de l'échantillon et après avoir contrôlé ce que nous pouvons, j'ai mes résultats et la dernière chose est de déterminer la rotation optimale d'un échantillon sur les 3 plaques pour atténuer davantage les biais de localisation. Dans l'ensemble, j'espérais une fonction dans JMP qui me permettrait de calculer toutes les moyennes, stdev et CV possibles, car j'ai toutes mes données et le faire dans Excel prend du temps, mais d'après ce que j'ai vu, je n'y crois pas. possède un complément ou une fonctionnalité.
Re : Question sur la génération de tous les résultats possibles et la détermination des CVJe tiens à souligner la disponibilité de fichiers de forme personnalisés pour aider à visualiser le biais et la variance entre les puits avec Graph Builder. Vous pouvez trouver une description et les fichiers ici : Fichiers de forme de micro-titre
Re : Question sur la génération de tous les résultats possibles et la détermination des CVJe n'ai pas suffisamment d'informations pour fournir des conseils spécifiques, mais en ajoutant à la réponse de Mark, peut-être que le mot pour décrire le phénomène à l'intérieur de la plaque est variation vs biais (au moins jusqu'à ce que vous compreniez si cette variation est cohérente et s'il y a un décalage moyen) ? Je ne sais pas pourquoi vous avez besoin de toutes les combinaisons possibles ? Je commencerais par des hypothèses (par exemple, pourquoi y aurait-il des variations dans les différents emplacements sur les plaques ? Pourquoi suspectez-vous une interaction entre les courbes de dose et l'emplacement des plaques ?). Peut-être existe-t-il un sous-ensemble d'emplacements à l'intérieur des plaques que vous pourriez tester dans une expérience (pensez quels emplacements seraient les plus différents et pourquoi). Si vous pouvez réduire ce nombre, vous pouvez concevoir un test plus efficace.
Je ne suis pas sûr du nombre de tests que vous exécutez, mais pourriez-vous utiliser l'échantillonnage (composante de l'étude de la variation) pour obtenir des estimations de la variation au sein d'une plaque, d'une plaque à l'autre et d'un test à l'autre sur de nombreuses plaques au fil du temps ?
Re : Question sur la génération de tous les résultats possibles et la détermination des CVLe biais et la variance sont des caractéristiques différentes de la réponse. Le biais est l'erreur systématique et la variance est l'erreur aléatoire. De plus, la variance nécessite une taille d'échantillon beaucoup plus grande pour être estimée ainsi que la moyenne.
Au lieu de reproduire l'intégralité de la courbe dose-réponse sur chaque plaque, pourquoi ne pas commencer par une conception plus simple. Pourquoi ne pas tester le même standard qui devrait générer une réponse proche du point d'inflexion de la courbe ? Cette réponse devrait être plus sensible aux effets de position. Exécutez le même échantillon dans les 96 puits sur toutes les plaques. Vous pouvez économiser la conception en sautant certaines lignes et colonnes si vous vous attendez à un changement continu, éventuellement non linéaire, sur la plaque. Cependant, vous aurez peut-être besoin de plus de plaques, car les estimations de CV sur les plaques seront médiocres avec seulement trois répétitions.
