Genetic Association with JMP Genomics シリーズでは、遺伝マーカーと目的の形質を関連付ける多数の方法を発見しました。 分析を開始する前に、データをインポートしてクリーンアップする必要があります。 このガイドでは、GEO からデータセットをダウンロードし、それをJMPゲノミクスを作成し、分析に最適な形式に変換します。 この例では、組織球性肉腫 (腫瘍) の影響を受けている、または影響を受けていない 474 頭のバーニーズ マウンテン ドッグのサンプル中の約 22,000 個の遺伝マーカーを調査します。
「Genetic Association with JMP Genomics」シリーズでは、遺伝マーカーと関心のある形質を関連付ける多数の方法を発見します。 分析を開始する前に、データをインポートしてクリーンアップする必要があります。 このガイドでは、GEO からデータ セットをダウンロードし、それを JMP に取り込んで、分析に最適な形式に変換します。 この例では、組織球性肉腫 (腫瘍) の影響を受けている、または影響を受けていない 474 頭のバーニーズ マウンテン ドッグのサンプル中の約 22,000 個の遺伝マーカーを調査します。
このような解析はJMP Pro 17で完了できますか？ 完全な連鎖地図は既に作成済みですが、JMPを使って新たに作成しても構いません。QTL研究にJMPを使用することに興味があります。JMP Genomicsが必要な場合は、価格について詳しい担当者をご紹介いただけますか？
ありがとう
SJシュナイダー
こんにちは、 @アルファシュナイダーさん、
残念ながら、JMP Genomics は数年前に製品として廃止されました。
上記の手順はJMP Pro 17で実行できます。「テーブル」メニューと、「分析」メニューの「遺伝学」にある「マーカー統計」プラットフォームを使用してください。JMP Pro 18および19（今秋、9月～10月頃にリリース予定）では、補完手法や記録機能の改善など、いくつかの改善が加えられています。
解析＞スクリーニング、または解析＞モデルの当てはめの下にある応答スクリーニングを使用して、SNP-形質関連解析を行うことができます。JMP Pro 18でこれらの解析を実行する方法については、こちらのリンクをご覧ください（ JMP Proによるゲノム解析）。
いつでもサポートに問い合わせることもできます ( サポート@jmp.com )。
最高、
