Comment effectuer une analyse de sensibilité globale dans JMP ?<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Bonjour. Premier message sur le forum pour moi... Je suis un écologiste de recherche spécialisé dans la conservation de la faune. Pas l'utilisateur typique de JMP, je suppose. J'ai développé et testé un modèle complexe de simulation individuelle de la dynamique des populations d'oiseaux. J'en suis actuellement au stade de l'analyse du modèle, où une analyse de sensibilité globale basée sur la variance serait appropriée. Je me demande si JMP dispose des outils nécessaires pour effectuer une telle analyse.
Bien que j'utilise JMP depuis des années pour les analyses statistiques de base et l'exploration graphique des données, je suis nouveau dans l'utilisation des différents outils de profilage et de la plate-forme de conception d'expériences. Il me semble que ces outils ont été développés pour répondre à des besoins dans des disciplines très différentes (ex. : Six Sigma, pistes cliniques en médecine). Par conséquent, une partie de la terminologie m'est assez étrangère par rapport aux normes de mon domaine (voir l'article joint de Cariboni et al. (2007). Dans la modélisation écologique, l'analyse de sensibilité est souvent décrite comme le processus consistant à faire varier systématiquement les valeurs des paramètres dans l'espace des paramètres d'un modèle pour comprendre dans quelle mesure différents paramètres affectent les résultats clés du modèle et identifier les paramètres les plus influents.
Je peux clairement voir des éléments de ce type d'analyse dans les profileurs et les plates-formes DOE, mais je n'ai pas été en mesure de déterminer quelle plate-forme/outils je pourrais utiliser pour le type d'analyse de sensibilité généralement appliquée dans la modélisation écologique (voir pièces jointes supplémentaires) . Plus précisément, comment puis-je obtenir le type de résultats de sensibilité des paramètres typiques des analyses de sensibilité ?
J'ai joint 4 documents à ce post pour illustrer ce dont je parle. J'espère que je travaille simplement dans une tradition d'analyse différente de celle de la plupart des utilisateurs de JMP et que les outils existants peuvent répondre à mes besoins. En particulier, j'aimerais pouvoir effectuer le processus d'analyse en 2 étapes de l'article ci-joint de Song et al. (2012), qui applique d'abord une conception de dépistage (Campologo et al. 2007) pour limiter le nombre de paramètres qui seraient inclus dans une analyse de sensibilité globale basée sur la variance (Saltelli et al. 2010).
Je serais reconnaissant de l'aide que quiconque peut fournir pour aider à combler la distance entre les analyses de sensibilité dans la modélisation écologique et les analyses de type DOE/profileur qui peuvent être effectuées dans JMP.
Sincèrement,
Casey Lot
Conservatoire américain des oiseaux
(208) 629-8705
Re : Comment effectuer une analyse de sensibilité globale dans JMP ?Merci, @Ian. J'espère que cette question suscitera une discussion. Après avoir relu les papiers que j'ai joints à mon message, je pense que je pourrais probablement exprimer mon intérêt et poser quelques questions plus précisément :
Tout d'abord, j'aimerais adopter l'approche en deux étapes de l'analyse de sensibilité illustrée dans Song et al. papier joint à mon message d'origine. Cela signifie que j'aimerais commencer par utiliser la méthode modifiée de Morris qui est publiée dans Campolongo et al. 2007 pour calculer l'indice de sensibilité aux effets élémentaires (EE) dans le but de "fixer les facteurs", c'est-à-dire de déterminer quels paramètres ont un effet minimal sur les sorties du modèle afin qu'ils puissent être : 1) supprimés du modèle via la simplification du modèle ou 2) fixes à une valeur n'importe où dans leur gamme et ignorée dans les analyses ultérieures. Quelqu'un peut-il m'indiquer la fonctionnalité de JMP que je pourrais utiliser pour effectuer ce type d'analyse ? Si cet indice (l'indice de sensibilité EE) peut être calculé dans JMP, j'aimerais pouvoir consulter les détails statistiques pour voir s'il est calculé à la suite de Morris 1991 ou des méthodes mises à jour présentées dans Campolongo et al. 2007, ou un autre ensemble de méthodes où je peux référencer un article original ET un numéro de page ou une section spécifique de la documentation de JMP. En particulier, je serais intéressé par le calcul de l'indice de sensibilité EE pour les facteurs uniques et les groupes de facteurs. Si JMP fait quelque chose de similaire, mais utilise une méthode différente, j'aimerais beaucoup de l'aide pour y parvenir. Encore une fois, je suis très nouveau sur les plates-formes/outils de JMP qui peuvent faire ce genre de chose.
Deuxièmement, j'aimerais effectuer une analyse de sensibilité basée sur la variance plus détaillée, en utilisant les indices de sensibilité de l'effet principal et de l'effet total qui ont été présentés dans de nombreux articles par Saltelli et ses collègues et mis à jour le plus récemment, pour autant que je sache, dans Saltelli et al. 2010 (que j'ai également joint à mon message d'origine). J'ai regardé le lien que Ian a envoyé pour évaluer l'importance variable, puis je suis allé au lien des détails statistiques à l'intérieur de ce texte. Il semble que JMP utilise une certaine forme de ces indices, puisque ce texte fait référence à Saltelli 2002. Je serais curieux de savoir si l'une des plates-formes/outils JMP existants suit les méthodes mises à jour qui sont décrites en détail dans Saltelli et al. 2010. Encore une fois, si quelqu'un peut m'aider à naviguer dans la documentation JMP pour comprendre cela, je serais reconnaissant.
En fin de compte, j'aimerais pouvoir effectuer une analyse de sensibilité pour un article évalué par des pairs et citer les articles originaux appropriés pour les détails statistiques (par exemple, Campolongo et al. 2007, Saltelli et al. 2010). Je ne sais pas si cela est possible ou s'il serait plus approprié de citer simplement la documentation de JMP pour les plates-formes/outils existants. Si tel est le cas, j'aimerais être sûr que j'utilise les bonnes et qu'elles sont au moins analogues, sinon exactement les mêmes, aux approches décrites dans les deux articles énumérés ci-dessus (et fournies dans mon message d'origine).
Merci d'avance pour l'aide que quiconque pourra apporter à ce sujet.
Re : Comment effectuer une analyse de sensibilité globale dans JMP ?Malheureusement, je n'ai pas eu le temps de rendre justice à votre question.
Je pense qu'il est juste de dire que JMP prend bien en charge une approche séquentielle de l'expérimentation (que la réponse ait ou non du bruit), même si le relativement récent Conceptions de criblage définitives perturber un peu ce paradigme.
Scanning Song et al, je vois qu'ils mentionnent la méthode Sobol. Au cas où cela aiderait, je voulais vous faire savoir que Évaluer l'importance variable dans le profileur de JMP utilise cette approche.
