Questo caso di studio si concentra su come utilizzare JMP Pro 17 per l'analisi dei dati omici, in particolare i dati di genotipo/SNP. Esamina principalmente il flusso di lavoro Genome Wide Association Studies (GWAS).Questo tipo di analisi viene in genere eseguito da genetisti statistici, genetisti e/biologi che cercano di comprendere l'associazione di genetica/DNA a un fenotipo/carattere/condizione medica
Questo caso di studio può essere utilizzato per fornire dimostrazioni ai clienti da parte delle SE per coloro che sono interessati ad analizzare i "dati omici nei domini della ricerca sugli animali/del cancro". È progettato in modo da poter mostrare solo le capacità richieste dal cliente (usa il metodo Great Demo!) ma anche nel contesto dell'intero flusso di lavoro analitico di analisi di questo tipo di dati. Se provi a provare tutte le funzionalità, ci vorrà più di un'ora poiché ci sono molte funzionalità che vengono utilizzate.
Il diario incluso contiene output e pulsanti di script per eseguire l'analisi a ogni passaggio. Ci sono anche pulsanti di script che eseguono anche alcune attività di manipolazione dei dati.
Viene utilizzato anche il componente aggiuntivo Diagramma di Venn
Cosa è disponibile
- Una rivista con un'introduzione al flusso di lavoro, alla domanda scientifica/di ricerca e al set di dati utilizzato
- Un progetto che contiene il giornale, i file, le tabelle e l'output/report per ciascuna analisi
- Il set di dati in modo che tu possa farlo da solo
Perché è utile?
- JMP Genomics come prodotto è stato interrotto all'inizio di quest'anno, quindi abbiamo bisogno di casi di studio per mostrare come eseguire "l'analisi omica in JMP Pro 17
- Evidenzia inoltre le novità di JMP/JMP Pro 17 per i dati ampi, in particolare nel contesto dei "dati omici".
- Inoltre ha lo scopo di aiutare le SE a diventare più autosufficienti in determinate demo e parlando delle capacità nello "spazio omico
- L'analisi dei dati nel 'mondo omico può essere di natura basata su script/flusso di lavoro o esplorativa. Questo caso di studio si concentrerà sulla natura più esplorativa dell'analisi dei dati e non sull'analisi di tipo "automatizzata" o con script. È possibile convertire i passaggi in un flusso di lavoro utilizzando le capacità di creazione del flusso di lavoro di JMP Pro 17. Proverò a crearne uno e ad allegarlo a questo case study come proof of concept nel prossimo futuro.
