mezcla de relleno espacial diseño DoE para medios de cultivo celularEstoy usando JMP 15.2 y no vi por dónde comenzar el diseño de mezcla de relleno de espacio. Ya sea desde el diseño de mezcla clásico o desde el diseño personalizado, no vi por dónde comenzar un diseño de mezcla de relleno de espacio
2. Obtuve datos de producción de anticuerpos. Me pregunto cómo puedo poner estos datos en JMP para hacer un análisis. Los datos son los siguientes
Diseño de experimentosRe: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celularLlego muy tarde a esta discusión, así que no quiero desviarla, pero si realmente está en el mundo del diseño de mezclas de relleno de espacios (lo que significa que comprende completamente los efectos de ruido a corto y largo plazo y el proceso es coherente) el análisis debe ser menos estadístico y más gráfico. El análisis de tales diseños debe ser gráficos de contorno y gráficos de respuesta de superficie. Ya debería conocer la significación estadística a través de experimentos anteriores.
Además, es posible que desee leer libros/artículos sobre diseños de mezclas y la razón por la que normalmente se analizan sin la intercepción. Ver el libro de Cornell.
La falta de ajuste es el resultado de eliminar términos del modelo (frente al error puro, que es el resultado de repeticiones aleatorias).
Re: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celularHola, louv, muchas gracias por tu tiempo. Aprendí mucho.
Lamento tener una pregunta de seguimiento. Estaba tratando de encontrar la falta de análisis de ajuste y no lo vi. Me pregunto si es posible hacer un análisis de falta de ajuste para el diseño de mezclas. Como sé, hay falta de ajuste cuando hay réplicas.
Gracias
Re: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celularPara añadir un poco a los consejos proporcionados por @louv para verificar la utilidad de un modelo, además de la verificación empírica adicional, haría una pausa por un momento y examinaría los efectos desde el punto de vista de los primeros principios o del conocimiento a priori. En el pasado, les preguntaba a los científicos e ingenieros con los que trabajé algo como: "Si el modelo sugiere que el agua corre cuesta arriba, creo que el modelo es sospechoso y es posible que deseemos hacer una pausa antes de entretenerlo como una forma de nuevo aprendizaje o 'prueba'." Y especialmente en el caso del conocimiento a priori, ¿el 'conocimiento' es fáctico y derivado de los datos o simplemente un mito de fabricación urbana transmitido a través de los tiempos porque alguien vio algo, hace años, pero nadie puede recordar las circunstancias o el contexto exactos? He visto muchos estudios del DOE destrozar estos mitos de fabricación urbana. Buena caza.
Re: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celular
El modelo que he escrito incluye interacciones bidireccionales. Los datos que ingresé se basaron en su tabla de datos junto con las propiedades de la columna para reflejar sus rangos de configuración. El R2 del modelo se mejora con las interacciones. En mi humilde opinión, la mejor manera de ver si su modelo es útil es intentar verificarlo mediante un experimento.
Re: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celularHola, louv, muchas gracias por tu esfuerzo. Realmente lo aprecio. Lamento tener más preguntas.
1. Según su archivo adjunto, cuando hice clic en el cuadro de diálogo DoE, hay una tabla de datos con datos aleatorios. Me pregunto si ha generado espacio para llenar la tabla de datos DoE y pegado mis datos en esa tabla de datos.
2. De hecho, hice lo mismo al generar la tabla DoE a través de Classical>Mixture design>spacefilling. Luego, simplemente copio y pego la fecha de mi Excel en la tabla de datos. Sin embargo, el resultado del modelado es diferente del resultado del modelado suyo.Según su modelo, cuando maximizo la conveniencia a través del generador de perfiles de predicción, muestra que 0.85 X1 y 0.15 X3 tendrán la máxima conveniencia. Sin embargo, según mi modelo, cuando maximizo la conveniencia a través del generador de perfiles de predicción, muestra que 1 de X1 y 0 de X2, X3 y X4 tendrán la máxima conveniencia.
Me pregunto por qué hay tanta diferencia con los mismos datos.
Por cierto, ¿qué significa "Sin intercepción" en la imagen de abajo? Descubrí que marcar o desmarcar "Sin intercepción" hace una gran diferencia en el resultado del modelado
Gracias de nuevo.
Los mejores deseos
Re: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celularAsí es como se vería en JMP con las propiedades de columna apropiadas y las correcciones/manipulaciones mencionadas por Dan Obermiller.
Re: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celularHas recibido varias sugerencias muy buenas. Como señalan varios de estos mensajes, la cantidad de trabajo involucrada será más de lo normal ya que no tiene el archivo JMP original. JMP guarda varias cosas asociadas con cada una de las columnas al crear un experimento diseñado. Estos elementos (llamados propiedades de columna) facilitarán el análisis y funcionarán correctamente. Mover los datos a una hoja de cálculo elimina esas propiedades.
Por ejemplo, noté que uno de sus primeros problemas será que con la hoja de cálculo, no todas las filas de los porcentajes de su prototipo suman 1. Este será el primer problema que deberá solucionar para JMP. Para que JMP analice correctamente un experimento de mezcla, los componentes deben sumar exactamente 1. Consulte las filas 7, 8 y 9, por ejemplo (probablemente haya otras). Así que verifique el redondeo en su hoja de cálculo y asegúrese de que los cuatro componentes sumen 1.
Re: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celularHola @loganshawn , y bienvenido a JMP !
Además de las excelentes respuestas anteriores, agregaré algunos elementos interesantes relacionados con sus preguntas o situación:
1) Puede hacer diseños mixtos en las plataformas "Diseño personalizado" y "Clásico" -> "Diseños mixtos", pero es posible que no tenga las mismas opciones en estas plataformas. Usted menciona un diseño de mezcla de relleno de espacio, por lo que este tipo de diseño parece generarse desde la plataforma "Clásico" -> "Diseños de mezcla" (ver captura de pantalla).
2) Simplemente puede importar un archivo de Excel o un archivo PDF que contenga una tabla en JMP haciendo clic en "Archivo" -> "Abrir" y luego elija su archivo.
Dado que aquí solo importará los datos sin procesar (no el formato de modelo o factor realizado anteriormente en JMP), deberá agregar algunas propiedades a sus 4 factores (haga clic con el botón derecho en la columna y luego en "Propiedades de columna"): Mezcla, Cambios de función de diseño (mezcla) y factor (¿fácil?) para el diseño de mezcla de relleno de espacio. Ver captura de pantalla.
Con respecto al análisis/modelado, puede intentar hacerlo paso a paso para familiarizarse con los datos: visualice los resultados con "Graph Builder", intente ver relaciones bivariadas (un factor vs. rendimiento) con "Fit Y by X ", y luego pruebe diferentes modelos con "Fit Model".
Si trabaja con personas que no tienen JMP pero aún necesitan completar resultados/información en una tabla DoE (Excel), le recomendaría descargar y usar el "Complemento de atributos de tabla". Este complemento lo ayudará a exportar su DoE en Excel con información sobre el formato de factores y el modelo, de modo que cuando vuelva a cargar el archivo de Excel completo en JMP, no perderá ninguna información sobre cómo se creó el modelo y cómo el se crearon los factores. Más información aquí: JMP a Excel y viceversa.
Si no está familiarizado con DoE, hay muchos recursos para ayudarlo:
Pensamiento estadístico para la resolución de problemas industriales | JMP
Kit de Introducción al Diseño de Experimentos | Primeros pasos con JMP
Documentación del DoE y todos los seminarios web y recursos en la comunidad JMP...
También puede probar este cuestionario JMP DoE que puede ayudarlo a determinar qué tipo de diseño puede ser adecuado para sus necesidades: Cuestionario DOE (jmp.com)
Espero que esto te ayudará,
Re: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celularAdemás de lo que @txnelson compartido, abordaré la pregunta n.º 2. Parece que la imagen de los datos que compartió está en algún tipo de aplicación de hoja de cálculo, ¿tal vez Excel? Existen múltiples flujos de trabajo para obtener datos de una aplicación en JMP. Sugeriré que lo primero que probaría, ya que la tabla de datos es relativamente pequeña, es arrastrar/copiar un encabezado de columna simple, en la aplicación nativa, de toda la hoja de cálculo, luego abrir JMP e instanciar una nueva tabla de datos JMP. En una tabla JMP completamente en blanco, simplemente haga Editar/pegar. Con suerte, su tabla de datos de JMP se completará y luego verificaré el tipo de datos/tipo de modelado de JMP en el menú de propiedades de la columna de JMP para asegurarme de que cada una de las numerosas características sea compatible con los flujos de trabajo de análisis y visualización de datos en JMP. Si este simple flujo de trabajo de copiar y pegar no funciona... hay otros flujos de trabajo que lo harán. Demasiados para escribir en un foro de discusión como este. Mi idea anterior para la importación fue impulsada por '¿cómo puedo realizar esta tarea con la menor cantidad de pulsaciones de teclas?'
¡Bienvenidos a JMP!
Re: mezcla de relleno de espacio diseño DoE para medios de cultivo celularLo primero que le sugiero que haga es leer la documentación del DOE en la Guía del DOE disponible en la Biblioteca de documentación de JMP, en el menú desplegable Ayuda.Hay una sección sobre el aumento de Space Filling que debería ayudarte.
También hay una buena cantidad de elementos de discusión que se pueden revisar.Si busca en las Discusiones sobre relleno de espacio, obtendrá muchas discusiones anteriores sobre el tema.
