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miscela di riempimento dello spazio Design DoE per terreni di coltura cellulare

Sto usando JMP 15.2 e non ho visto da dove iniziare il design della miscela di riempimento dello spazio. O dal classico> design misto o dal design personalizzato, non vedevo da dove iniziare un design misto per riempire lo spazio

2. Ho i dati sulla resa degli anticorpi. Mi chiedo come posso inserire questi dati in JMP per eseguire analisi. I dati sono i seguenti

 

 

Progettazione di esperimentiRi: miscela di riempimento dello spazio Design DoE per terreni di coltura cellulare

Sono davvero in ritardo per questa discussione, quindi non voglio sviarla, ma se sei veramente nel mondo del design delle miscele che riempie lo spazio (il che significa che comprendi completamente gli effetti del rumore a breve e lungo termine e il processo è coerenti) l'analisi dovrebbe essere meno statistica e più grafica. L'analisi di tali progetti dovrebbe essere costituita da grafici di contorno e grafici di risposta della superficie. Dovresti già conoscere la significatività statistica attraverso esperimenti precedenti.

Inoltre, potresti voler leggere libri / documenti riguardanti i progetti di miscele e il motivo per cui questi vengono generalmente analizzati senza l'intercettazione. Vedi il libro di Cornell.

 

La mancanza di adattamento è il risultato della rimozione di termini dal modello (rispetto al puro errore che è il risultato di repliche randomizzate).

 

Ri: miscela di riempimento dello spazio Design DoE per terreni di coltura cellulare

Ciao, louv, grazie mille per il tuo tempo. Ho imparato molto.

Mi dispiace di avere una domanda di follow-up. Stavo cercando di trovare un'analisi della mancanza di adattamento e non l'ho visto. Mi chiedo se sia possibile eseguire un'analisi della mancanza di adattamento per la progettazione della miscela. Come so, c'è mancanza di adattamento quando ci sono repliche.

Grazie

Ri: miscela di riempimento dello spazio Design DoE per terreni di coltura cellulare

Per aggiungere solo un po 'ai consigli forniti da @louv per verificare l'utilità di un modello, oltre ad un'ulteriore verifica empirica, mi fermerei un attimo ed esaminerei gli effetti dal punto di vista dei primi principi o della conoscenza a priori. In passato chiedevo agli scienziati e agli ingegneri con cui ho lavorato qualcosa del tipo: "Se il modello suggerisce che l'acqua scorre in salita, penso che il modello sia sospetto e potremmo voler fermarci prima di considerarlo una forma di nuovo apprendimento o 'prova'." E specialmente nel caso della conoscenza a priori, la "conoscenza" è fattuale e derivata dai dati o solo un mito della produzione urbana tramandato attraverso i secoli perché qualcuno ha visto qualcosa, anni fa, ma nessuno riesce a ricordare esattamente le circostanze o il contesto esatti? Ho visto molti studi del DOE infrangere questi miti della produzione urbana. Buona caccia.

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Il modello che ho sceneggiato include interazioni bidirezionali. I dati che ho inserito erano basati sulla tua tabella di dati insieme alle proprietà della colonna per riflettere i tuoi intervalli di impostazione. L'R2 per il modello è migliorato con le interazioni. IMHO il modo migliore per vedere se il tuo modello è utile è provare a verificare tramite esperimento.

 

Ri: miscela di riempimento dello spazio Design DoE per terreni di coltura cellulare

Ciao, Louv, grazie mille per il tuo impegno. Lo apprezzo molto. Mi dispiace di avere altre domande.

1. In base al file allegato, quando ho fatto clic sulla finestra di dialogo DoE, sono presenti alcune tabelle di dati con dati casuali. Mi chiedo se hai generato una tabella di dati DoE che riempie lo spazio e incollato i miei dati in quella tabella di dati?

2. In realtà ho fatto allo stesso modo generando la tabella DoE tramite Classica> Mixture design> riempimento dello spazio. Quindi, semplicemente copio e incollo la data dal mio Excel nella tabella dei dati. Tuttavia, il risultato della modellazione è diverso dal tuo risultato della modellazione.Dal tuo modello, quando massimizzo la desiderabilità attraverso il profiler di previsione, mostra che 0,85 X1 e 0,15 X3 avranno la massima desiderabilità. Tuttavia, dal mio modello, quando massimizzo la desiderabilità tramite il profiler di previsione, mostra che 1 di X1 e 0 di X2, X3 e X4 avranno la massima desiderabilità.

Mi chiedo perché ci sia una tale differenza dagli stessi dati?

 

A proposito, cosa significa "Nessuna intercettazione" nell'immagine qui sotto? Ho scoperto che selezionare o deselezionare "Nessuna intercettazione" fa una grande differenza nel risultato della modellazione

 

Grazie ancora.

Auguri

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Ecco come apparirebbe in JMP con le proprietà di colonna appropriate e le correzioni/manipolazioni menzionate da Dan Obermiller.

Ri: miscela di riempimento dello spazio Design DoE per terreni di coltura cellulare

Hai ricevuto diversi ottimi suggerimenti. Come molti di questi messaggi sottolineano, la quantità di lavoro richiesta sarà più del normale poiché non si dispone del file JMP originale. JMP salva diversi elementi associati a ciascuna colonna durante la creazione di un esperimento progettato. Questi elementi (chiamati proprietà della colonna) semplificheranno l'analisi e funzioneranno correttamente. Lo spostamento dei dati in un foglio di calcolo rimuove tali proprietà.

 

Ad esempio, ho notato che uno dei tuoi primi problemi sarà che con il foglio di calcolo, non tutte le righe per le percentuali del tuo prototipo si sommano a 1. Questo sarà il primo problema che dovrai risolvere per JMP. Affinché JMP analizzi correttamente un esperimento con una miscela, i componenti devono sommarsi esattamente a 1. Vedi le righe 7, 8 e 9, ad esempio (probabilmente ce ne sono altre). Quindi controlla l'arrotondamento nel tuo foglio di calcolo e assicurati che i quattro componenti si aggiungano a 1.

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Ciao @loganshawn e benvenuto in JMP!

Oltre alle eccellenti risposte di cui sopra, aggiungerò alcuni elementi interessanti relativi alle tue domande o situazione:

1) Puoi realizzare progetti Mixture sia nelle piattaforme "Custom Design" che "Classical" -> "Mixture Designs", ma potresti non avere le stesse opzioni in queste piattaforme. Hai menzionato un design Space-Filling Mixture, quindi questo tipo di design sembra essere generato dalla piattaforma "Classical" -> "Mixture Designs" (vedi screenshot).

2) Puoi semplicemente importare un file Excel o un file PDF contenente una tabella in JMP facendo clic su "File" -> "Apri" e quindi scegli il tuo file.
Dal momento che qui importerai solo i dati grezzi (non il modello o la formattazione dei fattori fatta in precedenza in JMP), dovrai aggiungere alcune proprietà ai tuoi 4 fattori (fai clic con il tasto destro sulla colonna e poi su "Proprietà colonna"): Miscela, Design Role (Miscela) e cambiamenti di fattore (Facile?) per la progettazione di miscele che riempiono lo spazio. Vedi screenshot.
Per quanto riguarda l'analisi/modellazione, puoi provare a farlo passo dopo passo per familiarizzare con i dati: visualizza i risultati con "Graph Builder", prova a vedere relazioni bivariate (un fattore vs. rendimento) con "Fit Y by X ", quindi prova una modellazione diversa con "Fit Model".

Se lavori con persone che non hanno JMP ma hanno comunque bisogno di compilare risultati/informazioni su una tabella DoE (Excel), ti consiglio di scaricare e utilizzare il "Table Attributes Add-in". Questo componente aggiuntivo ti aiuterà a esportare il tuo DoE in Excel con informazioni sulla formattazione dei fattori e sul modello, quindi quando caricherai nuovamente il file Excel completato in JMP, non perderai alcuna informazione su come è stato creato il modello e come il sono stati creati i fattori Maggiori informazioni qui: JMP in Excel e viceversa.

Se non hai familiarità con DoE, ci sono molte risorse per aiutarti:
Pensiero statistico per la soluzione di problemi industriali | JMP
Kit introduttivo alla progettazione degli esperimenti | Introduzione a JMP
Documentazione DoE e tutti i webinar e le risorse sulla community JMP...

Puoi anche provare questo quiz DoE di JMP che può aiutarti a capire quale tipo di design può essere adatto alle tue esigenze: DOE Quiz (jmp.com)

Spero che questo ti aiuti,

 

Ri: miscela di riempimento dello spazio Design DoE per terreni di coltura cellulare

Oltre a cosa @txnelson condiviso, risponderò alla domanda n. 2. Sembra che l'immagine dei dati che hai condiviso sia in una sorta di applicazione per fogli di calcolo, forse Excel? Esistono più flussi di lavoro per ottenere i dati da un'applicazione in JMP. Suggerirò che la prima cosa che proverei poiché la tabella dei dati è relativamente piccola è un semplice trascinamento/copia dell'intestazione di colonna, nell'applicazione nativa, dell'intero foglio di calcolo, quindi aprire JMP e istanziare una nuova tabella di dati JMP. Su una tabella JMP completamente vuota, fai semplicemente un Modifica/incolla. Si spera che la tabella di dati JMP venga popolata e quindi eseguirei un controllo del tipo di dati/tipo di modellazione JMP nel menu delle proprietà della colonna JMP per assicurarmi che ciascuna delle numerose caratteristiche sia adatta ai flussi di lavoro di analisi e visualizzazione dei dati in JMP. Se questo semplice flusso di lavoro copia/incolla non funziona... ci sono altri flussi di lavoro che lo faranno. Troppi da scrivere in un forum di discussione come questo. La mia idea sopra per l'importazione era semplicemente guidata da "come posso eseguire questo compito con il minor numero di colpi di chiave?"

 

Benvenuti in JMP!

Ri: miscela di riempimento dello spazio Design DoE per terreni di coltura cellulare

La prima cosa che ti suggerisco di fare è leggere la documentazione DOE nella Guida DOE disponibile nella JMP Documentation Library, sotto il menu Help Pull Down.C'è una sezione sull'aumento del riempimento dello spazio che dovrebbe aiutarti.

C'è anche un buon numero di articoli di discussione che possono essere rivisti.Se cerchi nelle discussioni il riempimento dello spazio, otterrai molte discussioni precedenti sull'argomento.