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script para crear una tabla de valores p

Tengo una tabla grande de 40 filas (4 grupos de 10 muestras) y 10000 columnas de valores—

1. ¿Hay alguna manera de ejecutar rápidamente pruebas t/ANOVA comparando un grupo en particular con otro grupo, para cada una de esas columnas y enumerar los valores p en una tabla para clasificar rápidamente y comprender los que son significativamente diferentes?

2. Además, ¿es posible establecer el valor p en tal prueba para corregir la corrección múltiple?

 

Gracias

Re: script para crear una tabla de valores p

Aquí hay una secuencia de comandos de muestra que podría estar cerca de lo que desea.Tuve que adivinar un poco qué combinación ibas a hacer.Pero crea una tabla de salida para las 127 columnas de la tabla de datos.

Names Default To Here( 1 );

// Create a data table somewhat similar to your description
dtorig = Open( "$SAMPLE_DATA\semiconductor capability.jmp" );

dt = dtorig << Subset( Sample Size( 10 ), Selected columns only( 0 ), Stratify( :SITE ) );

Close( dtorig, nosave );

// Get all of the tests
colNamesList = dt << get column names( continuous );

// In my example, I am using the first column as the matching column
// so remove it from the list
colNamesList = Remove( colNamesList, 1, 1 );

// Run the Fit Y by X(Oneway)
fg = Fit Group(
 Oneway(
  Y( Eval( colNamesList ) ),
  X( :SITE ),
  Matching Column( :NPN1 ),
  X Axis Proportional( 0 ),
  Matching Lines( 1 ),
  SendToReport(
   Dispatch( {}, "Oneway Plot", FrameBox, {Grid Line Order( 2 ), Reference Line Order( 3 )} ),
   Dispatch( {}, "Matching Fit", OutlineBox, {Close( 0 )} )
  )
 )
);

// Create the output table
Report( fg )[Table Box( 3 )] << make combined data table;

// Close the report output
Report( fg ) << close window;

Re: script para crear una tabla de valores pGracias, pero no estoy seguro de si este es el que quiero. Lo que quiero es más como lo que obtengo si uso:
Analizar==>Ajustar Y por X; y desde el triángulo rojo hacia abajo, use "Columna coincidente"
Esto me da la comparación emparejada previa vs posterior que estoy buscando, pero me gustaría ejecutar esto para las columnas de 20K como se mencionó anteriormente.
Re: script para crear una tabla de valores p

JMP 13 y JMP 14

Analizar==>Modelado especializado==>Pares coincidentes

JMP 12 y anteriores

Analizar==>Pares coincidentes

 

Para referencia futura, esta información se puede encontrar en el Índice de estadísticas, buscando en "emparejado"

Ayuda==>Índice de estadísticas

Re: script para crear una tabla de valores p

¿Hay alguna manera de obligar al sistema a usar una prueba pareada para generar los p-vals? Gracias.

Re: script para crear una tabla de valores p¿Hay alguna manera de elegir entre una prueba paramétrica o no paramétrica/de rango para usar en esto? Ninguna de las opciones disponibles en el cuadro de diálogo parece aplicarse. Gracias.Re: script para crear una tabla de valores pGracias, excluir todas las filas que NO quiero me lleva a donde necesito ir.Re: script para crear una tabla de valores p

Puede usar la capacidad de establecer el estado de fila para que las filas determinadas se excluyan del análisis posterior.

¿Es esto lo que estas tratando de hacer?

Re: script para crear una tabla de valores p

Gracias por la rápida respuesta: no hubiera imaginado que esto es lo que haría.

 

¿Hay alguna manera de activar esto desde un script, seleccionando solo filas particulares para este análisis, en función de los datos en un par de otras columnas (es decir, alguna forma de subconjunto/filtro), sin tener que hacer esa tabla primero?

Re: script para crear una tabla de valores p

Ejecute Response Screening Platform y lo hará por usted

Analizar==>Evaluación==>Evaluación de respuesta

Re: script para crear una tabla de valores p¿Cómo sabemos si los valores significativamente diferentes aumentan/disminuyen y cómo conocemos el grupo de referencia?Re: script para crear una tabla de valores p

La plataforma Oneway permite la visualización de los medios del grupo.El script de muestra no captura esos datos, pero podría incluir esa información.

Sobre la identificación del Grupo Base.la suposición es que los datos contendrían un etiquetado apropiado o que el analizador de los datos conocería esa información.