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script per creare una tabella di valori p

Ho una grande tabella di 40 righe (4 gruppi di 10 campioni) e 10000 colonne di valori—

1. C'è un modo per eseguire rapidamente t-test/ANOVA confrontando un gruppo particolare con un altro gruppo, per ciascuna di queste colonne ed elencare i valori p in una tabella per ordinare rapidamente per comprendere quelli che sono significativamente diversi?

2. Inoltre, è possibile impostare il valore p se tale test corregge correzioni multiple?

 

Grazie

Re: script per creare una tabella di valori p

Ecco uno script di esempio che potrebbe essere vicino a quello che desideri.Ho dovuto indovinare un po' quale corrispondenza avresti fatto.Ma crea una tabella di output per tutte le 127 colonne nella tabella dei dati.

Names Default To Here( 1 );

// Create a data table somewhat similar to your description
dtorig = Open( "$SAMPLE_DATA\semiconductor capability.jmp" );

dt = dtorig << Subset( Sample Size( 10 ), Selected columns only( 0 ), Stratify( :SITE ) );

Close( dtorig, nosave );

// Get all of the tests
colNamesList = dt << get column names( continuous );

// In my example, I am using the first column as the matching column
// so remove it from the list
colNamesList = Remove( colNamesList, 1, 1 );

// Run the Fit Y by X(Oneway)
fg = Fit Group(
 Oneway(
  Y( Eval( colNamesList ) ),
  X( :SITE ),
  Matching Column( :NPN1 ),
  X Axis Proportional( 0 ),
  Matching Lines( 1 ),
  SendToReport(
   Dispatch( {}, "Oneway Plot", FrameBox, {Grid Line Order( 2 ), Reference Line Order( 3 )} ),
   Dispatch( {}, "Matching Fit", OutlineBox, {Close( 0 )} )
  )
 )
);

// Create the output table
Report( fg )[Table Box( 3 )] << make combined data table;

// Close the report output
Report( fg ) << close window;

Re: script per creare una tabella di valori pGrazie - ma non sono sicuro se questo è quello che voglio. Quello che voglio è più simile a quello che ottengo se uso:
Analizza==>Adatta Y per X; e dal triangolo rosso a tendina, usa "Colonna corrispondente"
Questo mi dà il confronto accoppiato pre vs post che sto cercando, ma vorrei eseguirlo per le colonne 20K come menzionato sopra.
Re: script per creare una tabella di valori p

JMP 13 e JMP 14

Analizza==>Modellazione specializzata==>Coppie abbinate

JMP 12 e precedenti

Analizza==>Coppie abbinate

 

Per riferimento futuro, queste informazioni possono essere trovate nell'Indice Statistico, cercando su "accoppiato"

Aiuto==>Indice Statistiche

Re: script per creare una tabella di valori p

C'è un modo per forzare il sistema a utilizzare un test accoppiato per generare i p-val? Grazie.

Re: script per creare una tabella di valori pC'è un modo per scegliere tra test parametrico e non parametrico/rango da utilizzare in questo? Nessuna delle opzioni disponibili nella finestra di dialogo sembra essere applicabile. Grazie.Re: script per creare una tabella di valori pGrazie, l'esclusione di tutte le righe che NON voglio mi porta dove devo andare.Re: script per creare una tabella di valori p

È possibile utilizzare la possibilità di impostare lo stato della riga per determinate righe da escludere dall'analisi successiva.

È questo che stai cercando di fare?

Re: script per creare una tabella di valori p

Grazie o la risposta veloce - non avrei immaginato che questo sarebbe quello che avrebbe fatto.

 

C'è un modo per attivarlo da uno script, selezionando solo righe particolari per questa analisi, in base ai dati in un paio di altre colonne (ad esempio un modo per sottoimpostare/filtrare), senza dover prima creare quella tabella?

Re: script per creare una tabella di valori p

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Analizza==>Screening==>Screening della risposta