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Comment reproduire la mise à l'échelle multidimensionnelle SAS (MDS)

Je fais une mise à l'échelle multidimensionnelle non métrique en utilisant à la fois SAS et JMP.

 

Mon entrée pour JMP est une matrice de distance n*n (ou matrice de dissemblance ). Je suivais les étapes : Analyser -> Méthodes multivariées -> Mise à l'échelle multidimensionnelle et définissez le nombre de dimensions sur 5.

 

Dans SAS, j'utilisais la procédure proc mds. Ma matrice d'entrée est la même matrice de dissimilarité du triangle inférieur

proc mds data=my_matrix level=ordinal out=mds_out dimension= 5 non-norme ;

identifiant NOM ;

courir ;

 

Je compare les valeurs de coordonnées de ma solution dans JMP et SAS.Les valeurs des résultats SAS sont différentes de celles des résultats JMP. Ils sont similaires, mais ils diffèrent par des valeurs numériques. Je suppose que cela est dû aux valeurs de départ et au nombre d'itérations. Existe-t-il un moyen de faire correspondre les résultats ?

 

Pendant ce temps, la valeur de contrainte finale dans JMP et SAS est très différente. Dans SAS, j'utilise MAXITER=100. Dans l'historique des itérations SAS, la valeur de contrainte dans SAS semble correspondre à ITER = 2 à la valeur de contrainte finale dans JMP.

Quand je mets maxiter=1 dans SAS , la configuration finale dans JMP et SAS est encore assez différente.

 

Merci si quelqu'un peut me dire quelles options définir dans SAS ou JMP (???) pour correspondre aux résultats MDS.

Merci d'avance.

 

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Il ne sera pas possible de faire correspondre exactement la sortie JMP MDS à la sortie SAS PROC MDS. L'algorithme de JMP a été écrit indépendamment de SAS. De plus, les estimations initiales et finales de PROC MDS sont normalisées par défaut. De plus, nous voulions souligner que dans les modèles d'échelle multidimensionnels, les estimations des paramètres ne sont pas déterminées de manière unique. Les estimations peuvent être transformées de diverses manières sans changer leur « mauvais ajustement ».

 

Quelques éléments de réflexion - vous trouverez ci-joint un fichier de programme SAS créé à l'aide des exemples de données JMP, Distances de vol. Si vous spécifiez l'option NONORM, vous pouvez voir que les estimations sont proches des résultats de JMP mais avec des signes opposés. Cependant, pour MDS, la sortie la plus importante est le Biplot. Bien que les estimations (ou coordonnées) soient différentes, les Biplot de SAS et JMP sont identiques.

 

Concernant la statistique Stress, JMP présente Stress de Kruskal, type I , ou simplement Stress1. Il devrait être assez proche de la sortie de SAS (voir documentation ici ) si l'option Formule est définie sur 1.

 

 

Merci!

Cordialement, l'assistance technique JMP.

(Réponse gracieuseté de @sseligman )

Re : Comment reproduire la mise à l'échelle multidimensionnelle SAS (MDS)

Merci beaucoup pour votre question ! Le support technique JMP est sur le cas, comme vous le savez certainement, et j'ai hâte de mettre à jour ce message avec des informations supplémentaires au profit de nos utilisateurs qui fréquentent la communauté des utilisateurs JMP.