3D PCA－你可以為點加上抖動嗎？ 一個位置上的多個點僅顯示為一個點，而我想查看所有點。你好社區，
我正在使用 JMP Genomics 10 進行 3D PCA（拷貝數 -> 相關性和主方差成分分析）。 多個點位於同一位置並顯示為一個點。 然而，我希望以某種方式明顯地看出那裡有多個點，因為我試圖展示同一組中的樣本如何聚集在一起。 如果我將滑鼠懸停並且出現標籤，我只能說一個點代表多個點（見下圖；對圖像品質較差表示歉意）。 注意：我根據每個點所屬的群組（第 1-4 組）對每個點進行標記。
如果您有任何建議，我將不勝感激！ 預先感謝您抽出時間。
進階統計建模消費者與市場研究大規模客製化回覆：3D PCA - 可以為點添加抖動嗎？ 一個位置上的多個點僅顯示為一個點，而我想查看所有點。@克里斯_基希伯格感謝您的答覆！ 這樣可行！
祝你有美好的一天。
回覆：3D PCA - 可以為點添加抖動嗎？ 一個位置上的多個點僅顯示為一個點，而我想查看所有點。在 Scatterplot 3D 旁邊的紅色三角形下方有一個抖動選項，但它僅在資料類型為字元而不是數字（如範例中的 PC）時出現。
基本上，您的樣本的前 3 台 PC 具有相同的值。 您可以將其中一台 PC（例如 Prin3）切換為另一台 PC（例如 Prin4，如果存在），這將有助於將它們分開，除非它們對於所有 PC 具有相同的值。 這意味著就收集到的 PVCA 的數據而言，它們是相同的樣本。 這本身就說明它們要不是多餘的、相同的、無資訊的、相同的，就是其他類似的結論。 這可能有幫助，也可能沒有幫助。 取決於研究或實驗。
如果您想強制抖動，則必須執行以下操作：
- 按一下檢視資料按鈕，然後選擇 Prin 資料列
- 轉到“列”選單並選擇“標準化屬性”。
- 將資料類型從數字變更為字元。
- 3D 圖將自動更改，並且抖動選項將出現在紅色三角形中並自動被選中
雖然不優雅，但確實有效。
回覆：3D PCA - 可以為點添加抖動嗎？ 一個位置上的多個點僅顯示為一個點，而我想查看所有點。我附上了數據表，希望對回答這個問題有幫助！ 謝謝您的考慮。
我使用 JMP Genomics 以及相關性和主方差成分分析功能。 以下是我為每個選項卡更改的設定 - 如果沒有提及，那麼我使用預設設定。
常規選項卡：
- 輸入 SAS 資料集 =“PCA 組資料 1”。 文件已附。
實驗設計選項卡：
- 實驗設計 SAS 資料集 =“PCA Groups Exp 文件 1”。 文件已附。
- 顏色變數=組
- 實驗因子變因 = 組
- 標籤變數 = 組
主成分分析標籤：
@statman ， 謝謝你的建議！
1）當我右鍵單擊圖形區域時，我沒有看到“點”作為選項或任何涉及抖動的選項。 我看到以下內容：重設、設定...、 隱藏燈光邊框、牆壁顏色、背景顏色、行、使用硬體加速、顯示 ArcBall。 點擊“設定”可以選擇更改點的大小和顏色，但不抖動它們。 還有其他方法可以存取您正在談論的菜單嗎？
2) 我確實包含了一個實驗設計表，根據 JMP Genomics 流程的要求定義了每個群組，並且它產生了我包含圖像的結果。 不幸的是，它對解決抖動問題沒有幫助。
感謝大家的考慮。
回覆：3D PCA - 可以為點添加抖動嗎？ 一個位置上的多個點僅顯示為一個點，而我想查看所有點。如果您附上 JMP 資料表會容易得多，但請注意您可能不被允許這樣做。 所以她是我的想法（我無法嘗試）：
1. 通常，右鍵單擊圖表會彈出選項（很多）。 我認為如果你選擇點，你可以選擇抖動它們。
2. 建立一個列（您可以使用重新編碼）來指定您定義的分組，並在繪製資料時使用該列。
