3D PCA——你可以给点添加抖动吗？ 一个位置上的多个点仅显示为一个点，而我想查看所有点。你好社区，
我正在使用 JMP Genomics 10 进行 3D PCA（拷贝数 -> 相关性和主方差成分分析）。 多个点位于同一位置并显示为一个点。 然而，我希望以某种方式明显地看出那里有多个点，因为我试图展示同一组中的样本如何聚集在一起。 如果我将鼠标悬停并且出现标签，我只能说一个点代表多个点（见下图；对图像质量较差表示歉意）。 注意：我根据每个点所属的组（第 1-4 组）对每个点进行标记。
如果您有任何建议，我将不胜感激！ 预先感谢您抽出时间。
高级统计建模消费者和市场研究大规模定制回复：3D PCA - 可以为点添加抖动吗？ 一个位置上的多个点仅显示为一个点，而我想查看所有点。@克里斯_基希伯格感谢您的答复！ 这样可行！
祝你有美好的一天。
回复：3D PCA - 可以为点添加抖动吗？ 一个位置上的多个点仅显示为一个点，而我想查看所有点。在 Scatterplot 3D 旁边的红色三角形下方有一个抖动选项，但它仅在数据类型为字符而不是数字（如示例中的 PC）时出现。
基本上，您的样本的前 3 台 PC 具有相同的值。 您可以将其中一台 PC（例如 Prin3）切换为另一台 PC（例如 Prin4，如果存在），这将有助于将它们分开，除非它们对于所有 PC 都具有相同的值。 这意味着就收集到的用于 PVCA 的数据而言，它们是相同的样本。 这本身就说明它们要么是多余的、相同的、无信息的、相同的，要么是其他类似的结论。 这可能有帮助，也可能没有帮助。 取决于研究或实验。
如果您想强制抖动，则必须执行以下操作：
- 单击查看数据按钮，然后选择 Prin 列
- 转到“列”菜单并选择“标准化属性”。
- 将数据类型从数字更改为字符。
- 3D 图将自动更改，并且抖动选项将出现在红色三角形中并自动被选中
虽然不优雅，但确实有效。
回复：3D PCA - 可以为点添加抖动吗？ 一个位置上的多个点仅显示为一个点，而我想查看所有点。我附上了数据表，希望对回答这个问题有所帮助！ 谢谢您的考虑。
我使用 JMP Genomics 以及相关性和主方差成分分析功能。 以下是我为每个选项卡更改的设置 - 如果没有提及，那么我使用默认设置。
常规选项卡：
- 输入 SAS 数据集 =“PCA 组数据 1”。 文件已附。
实验设计选项卡：
- 实验设计 SAS 数据集 =“PCA Groups Exp 文件 1”。 文件已附。
- 颜色变量=组
- 实验因子变量 = 组
- 标签变量 = 组
主成分分析选项卡：
@statman ， 谢谢你的建议！
1）当我右键单击图形区域时，我没有看到“点”作为选项或任何涉及抖动的选项。 我看到以下内容：重置、设置...、 隐藏灯光边框、墙壁颜色、背景颜色、行、使用硬件加速、显示 ArcBall。 单击“设置”可以选择更改点的大小和颜色，但不抖动它们。 还有其他方法可以访问您正在谈论的菜单吗？
2) 我确实包含了一个实验设计表，根据 JMP Genomics 流程的要求定义了每个组，并且它产生了我包含图像的结果。 不幸的是，它对解决抖动问题没有帮助。
感谢大家的考虑。
回复：3D PCA - 可以为点添加抖动吗？ 一个位置上的多个点仅显示为一个点，而我想查看所有点。如果您附上 JMP 数据表会容易得多，但请注意您可能不被允许这样做。 所以她是我的想法（我无法尝试）：
1. 通常，右键单击图表会弹出选项（很多）。 我认为如果你选择点，你可以选择抖动它们。
2. 创建一个列（您可以使用重新编码）来指定您定义的分组，并在绘制数据时使用该列。
