重複測量因素的變異數分析你好，
我想建立一個模型用於分析我所做的一個實驗的結果，實驗的結構如圖所示。 
我有兩種處理方法，每種處理方法包含 5 個蜂巢，從每個蜂巢中我選擇了 6 隻蜜蜂，我給每隻蜜蜂一項任務，讓她進行 8 次試驗。
我測量了每次試驗所需的時間。
我認為蜜蜂和蜂巢是隨機效應，每次試驗都是重複測量，甚至可能將每隻蜜蜂視為蜂巢的重複測量（我不確定如何處理它）。
我將非常感激有關建立正確模型的建議，如果是這樣的話，我不想使用 MANOVA。
謝謝。
基礎資料分析與建模品質與工藝工程分享和交流成果回复：具有重複測量因素的方差分析謝謝你通知我， @ron_horne這個數據很有意思。 我想知道試用 ID 是否有任何意義。 我附上修改後的數據表，“試驗”被視為數字，連續。 我添加了一列，它計算時間 7 和時間 6 的差值。 我添加了 4 個圖形生成器腳本。
這是第一個圖，時間 6 與試驗 ID，按蕁麻疹，按治療著色。
下面是第二個情節。 同樣的事情，但我為每隻蜜蜂都設置了簡單的直線。
如果試用 ID 實際上意味著訂單，那麼這些情節對我來說很有趣。 它們可能代表您所說的“總的來說，似乎從試驗到試驗都在學習”。 聰明的蜜蜂 
回复：具有重複測量因素的方差分析你好@埃雷茲,
過去我們有過這樣的討論重複測量生存分析
它可能有一些有用的見解，具體取決於您如何看待手頭的數據。
此外，將數據分析為計數（花數）是否有用？它可能有一個泊松分佈？ 伽瑪分佈？
也許@彭劉有一個有用的方法來看待這個。
回复：具有重複測量因素的方差分析謝謝你們，你們的建議對我幫助很大（尤其是維克多_G這強調了他的步驟，因為我不是 JMP 方面的專家）。
關於蜜蜂完成任務，我將不得不提供更多細節。
蜜蜂進入有 8 朵人造花的房間，我在所有花中定義了訪問作為任務的成功。
幾乎立即找到第一朵花，找到最後一朵花是最困難的，因為蜜蜂很有可能到達她已經訪問過的花（每朵花的獎勵量非常小，所以蜜蜂最終將在返回蜂巢之前檢查所有的花）。
所有的事件都被記錄下來，這樣我就可以知道蜜蜂什麼時候到達第一個花, 第二等
因為到達最後一朵花是最困難的，所以里面有很多“噪音”測量.
我一開始提供的數據是到達7號花的時間，現在我還添加了到達花 6 的時間。
一般來說它似乎從試驗到試驗都在學習。
我有興趣搜索治療之間是否存在差異，差異可能是完成任務所需的時間或組間方差的差異（可能是您對尋找內容的建議）。
感謝。
回复：具有重複測量因素的方差分析你好@埃雷茲,
感謝您提供有關您的案例的全面信息，這對從社區獲得好的答案有很大幫助。
除了之前的答案之外，我總是喜歡在將數據放入更複雜的模型之前（例如用 x 擬合 y，即所有其他列的時間）之前，先直觀地處理數據。
在我看來，時間對試驗有明顯的依賴性，這意味著有一條學習曲線。 所以這不僅僅是用相同的期望值重複測量。 可以選擇將試驗放入模型中，或者過濾最後三個試驗以評估受過訓練的蜜蜂的結果等。
回复：具有重複測量因素的方差分析你好@埃雷茲,
您可以將此作為第一次嘗試：全因子重複測量方差分析插件
否則，根據我測量動物執行任務的時間的經驗，總是存在分配問題。它有上限嗎？他們都完成任務了嗎？您是否將其視為“活動時間”？
如果我們的方向正確，請告訴我們。
羅恩
回复：具有重複測量因素的方差分析你好@埃雷茲,
我認為在建立模型之前首先要做的可能是評估試驗的可重複性/再現性，檢查信號是否比測量的“噪音”更重要。
使用平台“變異性量表”查看結果時（腳本 1.，“蜜蜂”作為“部分，樣本 ID”，“治療”和“蜂巢”作為“X，分組”變量，“時間”作為“Y，響應”並選擇嵌套作為模型類型），我可以看到一些非常有趣的信息：
- 查看方差分量，58% 的變異性來自重複性，25.6% 來自部件間（蜜蜂），16.4% 來自再現性。 因此，這是測量結果存在很大差異的第一個跡象。
- 查看方差檢驗的異質性，我們可以看到“治療”具有不同的方差，具體取決於治療是 1:1 還是 5:1。 因此，稍後可能會在這裡搜索一些東西。
- 查看 Gauge R&R Mean Plot，我們可以看到時間略有增加，具體取決於處理方式。 另一個線索表明在這裡搜索某些東西可能很有趣。
所以現在看看“Fit Y by X”平台，你可以嘗試假設蜜蜂的反應時間會因治療而異。 這裡有兩個選項：
- 將時間作為 Y，將治療作為 X（腳本 2.1）進行分析，檢查方差是否相等（它們不相等），並選擇非參數檢驗，因為分佈不是正態分佈的，您將結束Wilcoxon 檢驗顯示出顯著的 p 值：時間上存在顯著差異，具體取決於治療。
- 使用日誌（時間）作為 Y 和處理作為 X（腳本 2.2）進行分析，此時方差是等效的並且分佈是正態分佈的，因此您可以進行學生 t 檢驗並再次看到顯著的 p 值。
我認為在開始對整個過程建模之前，這些初步分析可能會有用。
我已將腳本保存在您的 JMP 數據表中以執行我所描述的分析。
希望這對您項目的開始有所幫助，
