ANOVA con factores de medidas repetidasHola,
Quiero construir un modelo para analizar los resultados de un experimento que realicé, la estructura del experimento como se muestra en la imagen. 
Tengo dos tratamientos, cada tratamiento contiene 5 colmenas, de cada colmena elegí 6 abejas, le di a cada abeja una tarea que realizó 8 ensayos.
Medí el tiempo necesario para realizar cada prueba.
Considero a las abejas y a las colmenas como efectos aleatorios, cada ensayo como una medida repetida y tal vez incluso a cada abeja como una medida repetida de la colmena (no estoy seguro de cómo lidiar con esto).
Agradecería consejos para construir el modelo correcto, si es así no quiero usar MANOVA.
Gracias.
Análisis y modelado de datos básicosIngeniería de Calidad y ProcesosCompartir y comunicar resultadosRe: ANOVA con factores de medidas repetidasGracias por avisarme, @ron_horne Este dato es interesante. Me pregunto si la ID de prueba significa algo. Adjunto tabla de datos modificada, con "ensayo" tratado como numérico, continuo. Agregué una columna, que calcula la diferencia de time7 y time6. Agregué 4 scripts de creación de gráficos.
Aquí está la primera gráfica, time6 vs ID de prueba, por urticaria, coloreada por tratamientos.
A continuación se muestra la segunda trama. Lo mismo, pero ajusté líneas rectas simples para cada abeja.
Si la ID de prueba en realidad significa el orden, estas son tramas interesantes para mí. Pueden representar lo que quiere decir con "En general, parece que se aprende de prueba en prueba". Abejas inteligentes 
Re: ANOVA con factores de medidas repetidasHola @Erez ,
en el pasado tuvimos esta discusión Análisis de supervivencia de medidas repetidas
puede tener algunas ideas útiles dependiendo de cómo vea los datos disponibles.
además, ¿sería útil analizar también los datos como conteo (número de flores)? ¿podría tener un distribución de veneno ? ¿Distribución gamma?
tal vez @peng_liu tiene una forma útil de ver esto.
Re: ANOVA con factores de medidas repetidasGracias chicos, vuestros consejos me ayudan mucho (especialmente Víctor_G lo cual enfatiza sus pasos, ya que no soy un experto en JMP).
Con respecto a la abeja completa la tarea, tendré que dar más detalles.
La abeja entra a la habitación con 8 flores artificiales, definí visita en todas las flores. como éxito en la tarea.
Encontrar la primera flor ocurre casi de inmediato, encontrar la última flor es lo más difícil porque hay una alta probabilidad de que la abeja alcance la flor que ya visitó (la cantidad de recompensa en cada flor es muy pequeña, por lo que la abeja eventualmente pasará por todas las flores antes de volver a la colmena).
Todos los eventos se registran para que pueda saber cuándo la abeja llega a la primera. flor , segundo etc
Porque llegar a la última flor es lo más difícil, hay mucho "ruido" en el medición .
Los datos que proporcioné al principio muestran el tiempo que tardó en llegar a la flor número 7, ahora También agregué el tiempo para llegar a la flor 6.
En general parece que hay aprendizaje de ensayo en ensayo.
Estoy interesado en buscar si hay una diferencia entre los tratamientos, la diferencia puede ser el tiempo requerido para completar la tarea o la diferencia en la variación entre grupos (tal vez su sugerencia sobre qué buscar).
Agradecer.
Re: ANOVA con factores de medidas repetidasHola @Erez ,
gracias por proporcionar información completa sobre su caso, esto ayuda mucho a obtener buenas respuestas de la comunidad.
Además de las respuestas anteriores, siempre me gusta jugar visualmente con los datos antes de ponerlos en un modelo más complejo (como Ajustar y por x, es decir, tiempo por todas las demás columnas).
A mí me parece que hay una clara dependencia del tiempo de prueba, quiere decir que hay una curva de aprendizaje. Así que esto no es solo una medición repetida con el mismo valor esperado. Puede ser una opción poner una prueba en el modelo o filtrar las últimas tres pruebas para evaluar el resultado de las abejas entrenadas, etc.
Re: ANOVA con factores de medidas repetidasHola @Erez ,
Puedes probar esto como un primer intento: Complemento ANOVA factorial completo de medidas repetidas
de lo contrario, según mi experiencia con la medición del tiempo de los animales para realizar tareas, siempre hay un problema de distribución. esta tapado? ¿Todos completaron la tarea? ¿Lo tratas como "tiempo hasta el evento"?
háganos saber si estamos en la dirección correcta.
Ron
Re: ANOVA con factores de medidas repetidasHola @Erez ,
Creo que lo que puede ser bueno primero antes de construir un modelo puede ser evaluar la repetibilidad/reproducibilidad de sus ensayos, para verificar si su señal es más importante que el "ruido" de las mediciones.
Al mirar sus resultados con la plataforma "Gráfico de indicador de variabilidad" (secuencia de comandos 1., con "abeja" como "Parte, ID de muestra" y "tratamiento" y "colmena" como variables "X, Agrupación", "tiempo" como "Y, Respuesta" y eligiendo Anidado como tipo de modelo), puedo ver algunas informaciones muy interesantes:
- Mirando los componentes de la varianza, el 58% de la variabilidad proviene de la repetibilidad, el 25,6% de parte a parte (abeja) y el 16,4% de la reproducibilidad. Esa es una primera indicación de que hay mucha variación en la medición.
- Al observar las pruebas de heterogeneidad de varianza, podemos ver que el "tratamiento" tiene una varianza diferente según sea el tratamiento 1:1 o 5:1. Así que podría haber algo para buscar más tarde aquí.
- Si observamos el diagrama medio de R&R del indicador, podemos ver un ligero aumento de tiempo según el tratamiento. Otra pista de que algo podría ser interesante para buscar aquí.
Entonces, mirando ahora la plataforma "Fit Y by X", puede probar la hipótesis de que el tiempo de reacción de las abejas será diferente según el tratamiento. Aquí hay dos opciones :
- Haz el análisis con el tiempo como Y y el tratamiento como X (script 2.1), verifica que las varianzas sean iguales (no lo son), y elige una prueba no paramétrica ya que las distribuciones no se distribuyen normalmente, y terminarás arriba con la prueba de Wilcoxon que muestra un valor de p significativo: hay una diferencia significativa en el tiempo según el tratamiento.
- Realice el análisis con log(time) como Y y el tratamiento como X (script 2.2), esta vez las varianzas son equivalentes y las distribuciones se distribuyen normalmente, por lo que puede realizar una prueba t de Student y una vez más ver un valor p significativo.
Creo que estos primeros análisis pueden ser útiles antes de empezar a modelar todo el proceso.
He guardado los scripts en su tabla de datos JMP para realizar el análisis que he descrito.
Espero que esto te ayude para el comienzo de tu proyecto,
