重复测量因素的方差分析你好，
我想建立一个模型用于分析我做的一个实验的结果，实验的结构如图所示。 
我有两种处理方法，每种处理方法包含 5 个蜂巢，从每个蜂巢中我选择了 6 只蜜蜂，我给每只蜜蜂一项任务，让她进行 8 次试验。
我测量了每次试验所需的时间。
我认为蜜蜂和蜂巢是随机效应，每次试验都是重复测量，甚至可能将每只蜜蜂都视为蜂巢的重复测量（我不确定如何处理它）。
我将非常感激有关构建正确模型的建议，如果是这样的话，我不想使用 MANOVA。
谢谢。
基础数据分析与建模质量与工艺工程分享和交流结果回复：具有重复测量因素的方差分析谢谢你通知我， @ron_horne这个数据很有意思。 我想知道试用 ID 是否有任何意义。 我附上修改后的数据表，“试验”被视为数字，连续。 我添加了一列，它计算时间 7 和时间 6 的差值。 我添加了 4 个图形生成器脚本。
这是第一个图，时间 6 与试验 ID，按荨麻疹，按治疗着色。
下面是第二个情节。 同样的事情，但我为每只蜜蜂都设置了简单的直线。
如果试用 ID 实际上意味着订单，那么这些情节对我来说很有趣。 它们可能代表您所说的“总的来说，似乎从试验到试验都在学习”。 聪明的蜜蜂 
回复：具有重复测量因素的方差分析你好@埃雷兹,
过去我们有过这样的讨论重复测量生存分析
它可能有一些有用的见解，具体取决于您如何看待手头的数据。
此外，将数据分析为计数（花数）是否有用？它可能有一个泊松分布？ 伽玛分布？
也许@彭刘有一个有用的方法来看待这个。
回复：具有重复测量因素的方差分析谢谢你们，你们的建议对我帮助很大（尤其是维克多_G这强调了他的步骤，因为我不是 JMP 方面的专家）。
关于蜜蜂完成任务，我将不得不提供更多细节。
蜜蜂进入有 8 朵人造花的房间，我在所有花中定义了访问作为任务的成功。
几乎立即找到第一朵花，找到最后一朵花是最困难的，因为蜜蜂很有可能到达她已经访问过的花（每朵花的奖励量非常小，所以蜜蜂最终将在返回蜂巢之前检查所有的花）。
所有的事件都被记录下来，这样我就可以知道蜜蜂什么时候到达第一个花, 第二等
因为到达最后一朵花是最困难的，所以里面有很多“噪音”测量.
我一开始提供的数据是到达7号花的时间，现在我还添加了到达花 6 的时间。
一般来说它似乎从试验到试验都在学习。
我有兴趣搜索治疗之间是否存在差异，差异可能是完成任务所需的时间或组间方差的差异（也许是您对寻找内容的建议）。
感谢。
回复：具有重复测量因素的方差分析你好@埃雷兹,
感谢您提供有关您的案例的全面信息，这对从社区获得好的答案有很大帮助。
除了之前的答案之外，我总是喜欢在将数据放入更复杂的模型之前（例如用 x 拟合 y，即所有其他列的时间）之前，先直观地处理数据。
在我看来，时间对试验有明显的依赖性，这意味着有一条学习曲线。 所以这不仅仅是用相同的期望值重复测量。 可以选择将试验放入模型中，或者过滤最后三个试验以评估受过训练的蜜蜂的结果等。
回复：具有重复测量因素的方差分析你好@埃雷兹,
您可以将此作为第一次尝试：全因子重复测量方差分析插件
否则，根据我测量动物执行任务的时间的经验，总是存在分配问题。它有上限吗？他们都完成任务了吗？您是否将其视为“活动时间”？
如果我们的方向正确，请告诉我们。
罗恩
回复：具有重复测量因素的方差分析你好@埃雷兹,
我认为在建立模型之前首先要做的可能是评估试验的可重复性/再现性，检查信号是否比测量的“噪音”更重要。
使用平台“变异性量表”查看结果时（脚本 1.，“蜜蜂”作为“部分，样本 ID”，“治疗”和“蜂巢”作为“X，分组”变量，“时间”作为“Y，响应”并选择嵌套作为模型类型），我可以看到一些非常有趣的信息：
- 查看方差分量，58% 的变异性来自重复性，25.6% 来自部件间（蜜蜂），16.4% 来自再现性。 因此，这是测量结果存在很大差异的第一个迹象。
- 查看方差检验的异质性，我们可以看到“治疗”具有不同的方差，具体取决于治疗是 1:1 还是 5:1。 因此，稍后可能会在这里搜索一些东西。
- 查看 Gauge R&R Mean Plot，我们可以看到时间略有增加，具体取决于处理方式。 另一个线索表明在这里搜索某些东西可能很有趣。
所以现在看看“Fit Y by X”平台，你可以尝试假设蜜蜂的反应时间会因治疗而异。 这里有两个选项：
- 将时间作为 Y，将治疗作为 X（脚本 2.1）进行分析，检查方差是否相等（它们不相等），并选择非参数检验，因为分布不是正态分布的，您将结束Wilcoxon 检验显示出显着的 p 值：时间上存在显着差异，具体取决于治疗。
- 使用日志（时间）作为 Y 和处理作为 X（脚本 2.2）进行分析，此时方差是等效的并且分布是正态分布的，因此您可以进行学生 t 检验并再次看到显着的 p 值。
我认为在开始对整个过程建模之前，这些初步分析可能会有用。
我已将脚本保存在您的 JMP 数据表中以执行我所描述的分析。
希望这对您项目的开始有所帮助，
