ANOVA con fattori di misure ripetuteCiao,
Voglio costruire un modello per analizzare i risultati di un esperimento che ho eseguito; la struttura dell'esperimento è quella mostrata nell'immagine. 
Ho due trattamenti, ogni trattamento contiene 5 alveari, da ogni alveare ho scelto 6 api, ho assegnato a ciascuna ape un compito che ha eseguito per 8 tentativi.
Ho misurato il tempo necessario per eseguire ogni prova.
Considero le api e gli alveari come un effetto casuale, ogni prova come una misura ripetuta e forse persino ogni ape come una misura ripetuta dell'alveare (non so bene come gestire questa situazione).
Gradirei qualche consiglio su come costruire il modello giusto, se così fosse non vorrei usare MANOVA.
Grazie.
Analisi e modellazione dei dati di baseIngegneria della qualità e dei processiCondivisione e comunicazione dei risultatiRi: ANOVA con fattori di misure ripetuteGrazie per avermelo avvisato, @ron_horne Questo dato è interessante. Mi chiedo se l'ID di prova significhi qualcosa. Allego una tabella dati modificata, con "prova" trattata come numerica, continua. Ho aggiunto una colonna, che calcola la differenza di time7 e time6. Ho aggiunto 4 script per la creazione di grafici.
Ecco il primo grafico, time6 vs trial ID, per orticaria, colorato per trattamenti.
Di seguito la seconda trama. La stessa cosa, ma ho adattato semplici linee rette per ogni ape.
Se l'ID di prova in realtà significa l'ordine, queste sono trame interessanti per me. Potrebbero rappresentare ciò che intendi per "In generale sembra che ci sia apprendimento da una prova all'altra". Api intelligenti 
Ri: ANOVA con fattori di misure ripetuteCIAO @Erez ,
in passato abbiamo avuto questa discussione Analisi di sopravvivenza a misure ripetute
potrebbe avere alcune informazioni utili a seconda di come vedi i dati in mano.
inoltre sarebbe utile analizzare anche il dato come count (numero di fiori)? potrebbe avere un Distribuzione di Poisson ? Distribuzione gamma?
Forse @peng_liu ha un modo utile di vedere questo.
Ri: ANOVA con fattori di misure ripetuteGrazie ragazzi, i vostri consigli mi aiutano molto (soprattutto Vittorio_G che sottolinea i suoi passi, dato che non sono un esperto di JMP).
Per quanto riguarda il completamento dell'attività, dovrò fornire maggiori dettagli.
L'ape entra nella stanza con 8 fiori artificiali, ho definito visita in tutti i fiori come successo nel compito.
Trovare il primo fiore avviene quasi immediatamente, trovare l'ultimo fiore è il più difficile perché c'è un'alta probabilità che l'ape raggiunga il fiore che ha già visitato (la quantità di ricompensa in ogni fiore è molto piccola quindi l'ape infine passerà attraverso tutti i fiori prima di tornare all'alveare).
Tutti gli eventi vengono registrati così posso sapere quando l'ape raggiunge la prima fiore , secondo ecc.
Poiché raggiungere l'ultimo fiore è il più difficile, c'è molto "rumore" nel file misurazione .
I dati che ho fornito all'inizio mostrano il tempo impiegato per raggiungere il fiore numero 7, Ora Ho anche aggiunto il tempo per raggiungere il fiore 6.
Generalmente sembra che si impara di prova in prova.
Sono interessato a cercare se c'è una differenza tra i trattamenti, la differenza può essere il tempo necessario per completare l'attività o la differenza nella varianza tra i gruppi (forse il tuo suggerimento su cosa cercare).
Grazie.
Ri: ANOVA con fattori di misure ripetuteCIAO @Erez ,
grazie per aver fornito informazioni complete sul tuo caso, questo aiuta molto a ottenere buone risposte dalla comunità.
Oltre alle risposte precedenti, mi piace sempre giocare solo visivamente con i dati prima di inserirli in un modello più complesso (come Stima y per x, ovvero il tempo per tutte le altre colonne).
A me sembra che ci sia una chiara dipendenza del tempo dal processo, significa che c'è una curva di apprendimento. Quindi questa non è solo una misurazione ripetuta con lo stesso valore atteso. Potrebbe essere un'opzione per inserire la prova nel modello o per filtrare le ultime tre prove per valutare il risultato per le api addestrate ecc.
Ri: ANOVA con fattori di misure ripetuteCIAO @Erez ,
Puoi provare questo come primo tentativo: Componente aggiuntivo ANOVA a misure ripetute fattoriali complete
altrimenti, dalla mia esperienza con la misurazione del tempo impiegato dagli animali per svolgere compiti, c'è sempre un problema di distribuzione. è tappato? hanno completato tutti il compito? lo consideri "il momento dell'evento"?
facci sapere se siamo nella giusta direzione.
Ron
Ri: ANOVA con fattori di misure ripetuteCIAO @Erez ,
Penso che ciò che potrebbe essere utile prima di costruire un modello potrebbe essere valutare la ripetibilità/riproducibilità delle tue prove, per verificare se il tuo segnale è più importante del "rumore" delle misurazioni.
Quando guardi i tuoi risultati con la piattaforma "Variability Gauge Chart" (script 1., con "bee" come "Part, Sample ID" e "treatment" e "hive" come variabili "X, Grouping", "time" come "Y, Response" e scegliendo Nested come tipo di modello), posso vedere alcune informazioni molto interessanti:
- Osservando le componenti della varianza, il 58% della variabilità deriva dalla ripetibilità, il 25,6% da parte a parte (ape) e il 16,4% dalla riproducibilità. Quindi questa è una prima indicazione che c'è molta varianza nella misurazione.
- Osservando l'eterogeneità dei test di varianza, possiamo vedere che "trattamento" ha una varianza diversa a seconda che si tratti di trattamento 1:1 o 5:1. Quindi potrebbe esserci qualcosa da cercare in seguito qui.
- Guardando il Gauge R&R Mean Plot, possiamo vedere un leggero aumento del tempo a seconda del trattamento. Un altro indizio che qualcosa potrebbe essere interessante da cercare qui.
Quindi guardando ora alla piattaforma "Fit Y by X", puoi provare l'ipotesi che il tempo di reazione per le api sarà diverso a seconda del trattamento. Ci sono due opzioni qui:
- Fai l'analisi con il tempo come Y e il trattamento come X (script 2.1), controlla che le varianze siano uguali (non lo sono) e scegli un test non parametrico poiché le distribuzioni non sono distribuite normalmente, e finirai con il test di Wilcoxon che mostra un valore p significativo: c'è una differenza significativa nel tempo a seconda del trattamento.
- Esegui l'analisi con log(time) come Y e trattamento come X (script 2.2), questa volta le varianze sono equivalenti e le distribuzioni sono normalmente distribuite, quindi puoi eseguire un test t di Student e ancora una volta vedere un valore p significativo.
Penso che queste prime analisi possano essere utili prima di iniziare a modellare l'intero processo.
Ho salvato gli script nella tabella dei dati JMP per eseguire l'analisi che ho descritto.
Spero che questo ti aiuti per l'inizio del tuo progetto,
