C40 mRNA 表現 - 牛卵泡發育本案例研究重點在於如何使用 JMP Pro 17 進行組學資料分析,特別是 mRNA 表現資料。 它主要關注差異基因表現 (DGE) 工作流程。這種類型的分析是分子生物學家/生物化學家/生物標記研究人員的典型分析。
對於那些對分析動物研究/農業領域的「組學數據」感興趣的客戶,SE 可以使用此案例研究向客戶提供演示。 它的設計使您可以僅顯示客戶要求的功能(使用 Great Demo!方法),而且還可以顯示分析此類資料的整個分析工作流程的上下文。 如果您確實嘗試演示所有功能,則需要一個多小時的時間,因為使用了許多功能。
隨附的日誌包含輸出以及用於在每個步驟執行分析的腳本按鈕。 還有一些腳本按鈕也可以執行一些資料操作任務。
也使用了維恩圖插件
有什麼可用
- 一本介紹工作流程、科學/研究問題和所用資料集的期刊
- JMP 專案包含文件、日誌、分析結果和資料表
- 資料集,這樣你就可以自己做
為什麼這有用?
- JMP Genomics 作為產品已於今年早些時候停產,因此我們需要案例研究來展示如何在 JMP Pro 17 中執行“組學分析”
- 它還強調了 JMP/JMP Pro 17 中針對廣泛數據的新增功能,特別是在「組學資料」背景下
- 它還旨在幫助 SE 在給定的演示中變得更加自給自足,並討論「組學」空間中的功能
- 「組學」世界中的資料分析本質上可以是面向腳本/工作流程的或探索性的。 本案例研究將重點放在資料分析的更具探索性的性質,而不是「自動化」或腳本類型的分析。 人們可以使用 JMP Pro 17 的工作流程建立功能將這些步驟轉換為工作流程。 在不久的將來,我將嘗試創建一個並將其附加到本案例研究中作為概念證明。
警告! 相對於其他案例研究,該期刊和資料集非常大。 .zip 檔案外部壓縮後約 50 MB,其中 13.5 MB 用於數據,41.6 MB 用於日誌。 資料集已使用 JMP 進行壓縮。
實例探究數據表JMP基因組學期刊培訓教材回覆:C40 mRNA 表現 - 牛卵泡發育日記在專案中,但我重新附加了 zip 檔案以包含與專案以及專案內分開的日記和資料集。
回覆:C40 mRNA 表現 - 牛卵泡發育當我下載 ZIP 檔案時,日記不在那裡。