C40 mRNA 表达 - 牛卵泡发育本案例研究重点介绍如何使用 JMP Pro 17 进行组学数据分析,特别是 mRNA 表达数据。 它主要关注差异基因表达 (DGE) 工作流程。这种类型的分析是分子生物学家/生物化学家/生物标记研究人员的典型分析。
对于那些对分析动物研究/农业领域的“组学数据”感兴趣的客户,SE 可以使用此案例研究向客户提供演示。 它的设计使您可以仅显示客户请求的功能(使用 Great Demo!方法),而且还可以显示分析此类数据的整个分析工作流程的上下文。 如果您确实尝试演示所有功能,则需要一个多小时的时间,因为使用了很多功能。
随附的日志包含输出以及用于在每个步骤执行分析的脚本按钮。 还有一些脚本按钮也可以执行一些数据操作任务。
还使用了维恩图插件
有什么可用
- 一本介绍工作流程、科学/研究问题和所用数据集的期刊
- JMP 项目包含文件、日志、分析结果和数据表
- 数据集,这样你就可以自己做
为什么这有用?
- JMP Genomics 作为产品已于今年早些时候停产,因此我们需要案例研究来展示如何在 JMP Pro 17 中执行“组学分析”
- 它还强调了 JMP/JMP Pro 17 中针对广泛数据的新增功能,特别是在“组学数据”背景下
- 它还旨在帮助 SE 在给定的演示中变得更加自给自足,并讨论“组学”空间中的功能
- “组学”世界中的数据分析本质上可以是面向脚本/工作流的或探索性的。 本案例研究将重点关注数据分析的更具探索性的性质,而不是“自动化”或脚本类型的分析。 人们可以使用 JMP Pro 17 的工作流程构建功能将这些步骤转换为工作流程。 在不久的将来,我将尝试创建一个并将其附加到本案例研究中作为概念证明。
警告! 相对于其他案例研究,该期刊和数据集非常大。 .zip 文件外部压缩后约 50 MB,其中 13.5 MB 用于数据,41.6 MB 用于日志。 数据集已使用 JMP 进行压缩。
实例探究数据表JMP基因组学期刊培训教材回复:C40 mRNA 表达 - 牛卵泡发育日记在项目中,但我重新附加了 zip 文件以包含与项目以及项目内分开的日记和数据集。
回复:C40 mRNA 表达 - 牛卵泡发育当我下载 ZIP 文件时,日记不在那里。