이 사례 연구는 'omic 데이터 분석, 특히 mRNA 발현 데이터'에 JMP Pro 17을 사용하는 방법에 중점을 둡니다. 주로 차동 유전자 발현(DGE) 워크플로를 살펴봅니다.이러한 유형의 분석은 분자 생물학자/생화학자/바이오마커 연구원에게 일반적입니다.
이 사례 연구는 동물 연구/농업 영역에서 'omic 데이터 분석에 관심이 있는 사람들을 위해 SE가 고객에게 데모를 제공하는 데 사용할 수 있습니다. 고객이 요청한 기능(Great Demo! 방법 사용)만 표시할 수 있을 뿐만 아니라 이러한 종류의 데이터를 분석하는 전체 분석 워크플로에 대한 컨텍스트도 표시할 수 있도록 설계되었습니다. 모든 기능을 시연하려고 하면 사용되는 기능이 많기 때문에 한 시간 이상 걸립니다.
포함된 저널에는 각 단계에서 분석을 수행하기 위한 출력 및 스크립트 버튼이 포함되어 있습니다. 일부 데이터 조작 작업을 수행하는 스크립트 버튼도 있습니다.
Venn Diagram 추가 기능도 사용됩니다.
사용 가능한 것
- 작업 흐름, 과학/연구 질문 및 사용된 데이터 세트에 대한 소개가 포함된 저널
- 파일, 저널, 분석 결과 및 데이터 테이블이 포함된 JMP 프로젝트
- 스스로 할 수 있는 데이터 세트
이것이 유용한 이유는 무엇입니까?
- 제품으로서의 JMP Genomics는 올해 초 중단되었으므로 JMP Pro 17에서 'omic 분석을 수행하는 방법을 보여주는 사례 연구가 필요합니다.
- 또한 광범위한 데이터, 특히 '오믹 데이터' 맥락에서 JMP/JMP Pro 17의 새로운 기능을 강조합니다.
- 또한 SE가 주어진 데모에서 자급자족할 수 있도록 돕고 '오믹 공간'의 기능에 대해 이야기합니다.
- 오믹 세계의 데이터 분석은 스크립팅/워크플로 지향적이거나 본질적으로 탐색적일 수 있습니다. 이 사례 연구는 "자동화" 또는 스크립팅된 유형 분석이 아닌 데이터 분석의 보다 탐색적인 특성에 초점을 맞출 것입니다. JMP Pro 17의 워크플로 구축 기능을 사용하여 단계를 워크플로로 변환할 수 있습니다. 가까운 장래에 하나를 만들어서 개념 증명으로 이 사례 연구에 첨부하려고 합니다.
경고! 저널과 데이터 세트는 다른 사례 연구에 비해 매우 큽니다. ~50MB 압축, 데이터용 13.5MB, .zip 파일 외부의 저널용 41.6MB. 데이터 세트는 이미 JMP를 사용하여 압축되어 있습니다.
저널은 프로젝트에 있지만 프로젝트 내뿐만 아니라 프로젝트와 별도로 저널과 데이터 세트를 포함하도록 zip 파일을 다시 첨부했습니다.
