C40mRNA発現-牛の卵胞の発達このケーススタディでは、JMP Pro 17を使用してオミックデータ分析、特にmRNA発現データを分析する方法に焦点を当てています。 これは主に、差次的遺伝子発現(DGE)ワークフローに注目しています。
このケーススタディは、動物研究/農業分野のオミックデータの分析に関心のあるSEによる顧客へのデモを提供するために使用できます。 これは、顧客から要求された機能のみを表示できるように設計されており(Great Demo!メソッドを使用)、この種のデータを分析する分析ワークフロー全体のコンテキストでも表示できます。 すべての機能をデモしようとすると、使用される機能が多数あるため、1時間以上かかります。
含まれているジャーナルには、各ステップで分析を実行するための出力ボタンとスクリプトボタンが含まれています。 一部のデータ操作タスクを実行するスクリプトボタンもあります。
ベン図アドインも使用されます
利用可能なもの
- ワークフローの紹介、科学/研究の質問、および使用されたデータセットを含むジャーナル
- 自分でできるデータセット
なぜこれが便利なのですか?
- 製品としてのJMPGenomicsは今年初めに廃止されたため、JMPPro17でオミック分析を実行する方法を示すケーススタディが必要です。
- また、特にオミックデータのコンテキストで、ワイドデータ用のJMP / JMPPro17の新機能についても説明します。
- さらに、SEが特定のデモでより自給自足になり、オミック空間の機能について話すのを支援することを目的としています。
- 'omicの世界でのデータ分析は、スクリプト化/ワークフロー指向、または本質的に探索的である可能性があります。 このケーススタディでは、「自動化された」またはスクリプト化されたタイプの分析ではなく、データ分析のより探索的な性質に焦点を当てます。 JMP Pro 17のワークフロー構築機能を使用して、ステップをワークフローに変換できます。 近い将来、概念実証として作成し、このケーススタディに添付する予定です。
ケーススタディデータテーブルJMPゲノミクスジャーナルトレーニング教材