Diese Fallstudie konzentriert sich auf die Verwendung von JMP Pro 17 für die Analyse von Omic-Daten, insbesondere von mRNA-Expressionsdaten. Es befasst sich hauptsächlich mit dem Workflow der differentiellen Genexpression (DGE).
Diese Fallstudie kann verwendet werden, um Kunden von SEs Demos für diejenigen zu geben, die an der Analyse von 'OMIC-Daten in den Bereichen Tierforschung/Landwirtschaft interessiert sind. Es ist so konzipiert, dass Sie nur die Funktionen zeigen können, die vom Kunden angefordert werden (verwenden Sie die Great Demo!-Methode), aber auch im Kontext des gesamten Analyse-Workflows zur Analyse dieser Art von Daten. Wenn Sie versuchen, alle Funktionen zu demonstrieren, dauert dies über eine Stunde, da viele Funktionen verwendet werden.
Das enthaltene Journal enthält Ausgaben sowie Skriptschaltflächen, um die Analyse bei jedem Schritt durchzuführen. Es gibt auch Skriptschaltflächen, die auch einige Datenbearbeitungsaufgaben ausführen.
Das Venn-Diagramm-Add-In wird ebenfalls verwendet
Was ist verfügbar
- Eine Zeitschrift mit einer Einführung in den Arbeitsablauf, die wissenschaftliche Fragestellung und den verwendeten Datensatz
- Den Datensatz können Sie also selbst erstellen
Warum ist das nützlich?
- JMP Genomics als Produkt wurde Anfang dieses Jahres eingestellt, daher benötigen wir Fallstudien, um zu zeigen, wie die Omic-Analyse in JMP Pro 17 durchgeführt wird
- Außerdem werden die Neuerungen in JMP/JMP Pro 17 für breite Daten hervorgehoben, insbesondere im Kontext von 'omic-Daten
- Es soll SEs außerdem dabei helfen, in gegebenen Demos unabhängiger zu werden und über Fähigkeiten im 'omic-Raum zu sprechen
- Die Datenanalyse in der 'omic-Welt kann skript-/workfloworientiert oder explorativer Natur sein. Diese Fallstudie konzentriert sich auf den eher explorativen Charakter der Datenanalyse und nicht auf die „automatisierte“ oder skriptbasierte Analyse. Man kann die Schritte mit den Workflow-Erstellungsfunktionen von JMP Pro 17 in einen Workflow umwandeln. Ich werde versuchen, eines zu erstellen und es in naher Zukunft dieser Fallstudie als Proof of Concept beizufügen.
