Bonjour.
Mon nom est Jenifer Barbillon, et Je suis un recherche scientifique
à le National Instituts de Santé Clinique Centre.
Je suis en allant pour parler pour toi aujourd'hui
à propos comment je utiliser JMP pour manipuler recherche clinique médicament données
et comment je était capable pour créer un publication qualité chiffre
pour montrer comment le patient médicaments étaient utilisé
à travers le cours de un traitement protocole à le Clinique Centre.
Clinique données,
en particulier dans un recherche paramètre, peut être extrêmement bruyant.
Là sont un parcelle de personnel et personnel OMS sont impliqué dans recherche protocoles,
et le collection et stockage de pertinent recherche données
est pas toujours rationalisé.
je sera parler pour toi à propos comment je utiliser le JMP Générateur de graphiques outil
pour visualiser patient médicament ordonnances
à travers le cours de un six- mois traitement protocole
et comment nous étaient capable pour visualiser quoi est appelé un Diversité Shannon Indice
avec relation pour le antibiotique utiliser
ce étaient prescrit dans le patient [inaudible 00:00:55]
dans le clinique recherche paramètre.
je sera aller à travers comment je créé le illustration dans JMP
en utilisant quatre les patients avec un très rare maladie
ce étaient inscrit dans le traitement protocole.
Comme partie de le traitement régime de ce protocole,
le quatre les patients étaient prescrit un gamme de antibiotiques,
soit un total de en haut pour 21 différent les types de médicaments.
Le données étaient fourni pour moi dans un long format,
y compris un commencer et arrêt date de médicament administration.
Comme toi peut voir ici, je zoomé dans le d'abord chiffre de le affiche.
Quoi étaient en regardant à ici est un instantané
de quoi quelques de le recherche données regarder comme.
Dans le long format,
toi voir ce là sont répétitif Lignes de le patient IDENTIFIANT
et là sont répétitif Lignes de le différent médicaments
ce le patient reçu pendant le traitement protocole.
Il y a un parcelle de redondance ici.
Dans ajout pour ce, nous ont un commencer de médicament date
et un arrêt de médicament date ce chaque personne reçu.
Un de le d'abord pas je avait pour prendre dans le JMP données manipulation outils
était pour modifier le médicament nom donc ce il a fait pas ont donc beaucoup mots
dans le médicament nom
et aussi a fait pas inclure le dosage information
donc ce nous pourrait utiliser ce
comme un de le axes de le graphique ce Je suis en allant pour faire.
Dans ajout pour ce, je avait pour vérifier le date de patient consentement
dans le traitement programme
et pour voir si le commencer et arrêt date de ce personne médicament administration
abattre dans le traitement protocole.
Depuis ce indiquer alors, je avait pour normaliser chaque personne médicament commencer et arrêt
donc ce tout le monde avait un jour un et il serait tous correspondait
pour le certain indiquer de le traitement protocole.
Tous de ce information sera être utilisé pour créer le chiffre ce je sera montrer
à le fin de ce.
Une fois je était capable pour modifier le médicament nom
et créer le normalisé médicament commencer et arrêt,
je sera alors utiliser le Générateur de graphiques outil.
je aussi recherché pour parler à propos un autre aspect
de ce particulier recherche protocole,
et ce est le fait ce nous recherché pour regarder
à le oral microbiote de le les patients dans le traitement programme.
Quoi ce moyens est ce
nous a pris échantillons de chaque les patients oral langue brossages
et alors converti ceux dans spécifique compte de bactéries
ce étaient trouvé dans leur bouche.
Quoi nous terminé en haut vouloir pour faire était pour regarder à comment le antibiotique traitement
à travers le traitement protocole pourrait ont affecté le oral microbiome.
Comme nous savoir,
antibiotiques peut drastiquement changement ton intestin microbiome
et peut cause augmente et diminue
de différent microbien diversité dans le intestin.
Mais un question ce a pas a été élucidé
est si ou pas antibiotique utiliser serait aussi affecter le oral microbiome.
Quoi Je suis montrant ici est ce
nous ont construit un ensemble de scénarios dans le JMP
où nous installer ce sur le barre d'outils.
Nous ont un spécifique ensemble de scénarios ce serait calculer le Diversité Shannon
de le bactérien compte dans le tableau
associé avec le médicaments de quoi je juste montré sur le précédent glisser.
Dos pour le médicament tableau,
le d'abord marcher ce je a pris était pour ouvrir en haut le JMP Générateur de graphiques outil.
Le d'abord chose ce je a fait était pour glisser et goutte
le médicament commencer et arrêt date dans le X- axe comme montré ici.
Alors je serait aller pour le bar graphique outil
et Cliquez sur ce pour faire le données dans un bar graphique.
Le troisième marcher était pour glisser et goutte
le réel antibiotique raccourci médecine nom
dans le Y- axe.
Et alors enfin, dans commande pour créer le graphique donc ce je pourrait visualiser
le longitudinal durée de médicament administration,
je modifié le bar taper dans action.
Enfin, comme je a parlé pour toi plus tôt à propos le chemin
dans qui nous étaient capable pour code le traitement temps de le protocole
basé sur le médicament commencer et arrêt,
nous aussi étaient capable pour stratifier le antibiotique utiliser
dans ce différent temps indiquer de le traitement protocole comme ici.
Maintenant, tous de ces,
si toi sont familier avec le JMP Générateur de graphiques outil,
est super façons ce il y a donc beaucoup différent possibilités
sur comment toi peut manipuler données pour obtenir un particulier graphique ce toi vouloir.
Et enfin, un dernier chose nous a fait était nous a pris le patient IDENTIFIANT
ce était dans le médicament tableau
et coloré chaque bar sur le graphique par patient.
Le final chiffre regards comme ce.
Donc quoi toi voir ici est tous de le différent antibiotiques
ce étaient prescrit dans le traitement protocole.
Toi aussi voir temps indiquer B,
qui est le temps indiquer entre ligne de base et le traitement de le protocole,
et point de temps C, qui est le intervention indiquer
départ à temps indiquer C, et alors le fin de le traitement protocole.
Quoi toi voir ici est un longitudinal bar
indiquant le montant de temps un personne était sur un donné antibiotique.
Et alors toi aussi voir chaque de ces différent barres
stratifié par patient couleur.
Ce particulier chiffre a fait fin en haut en allant dans le publication,
et il était un autre chemin pour regarder à un grand tableau de médicaments
téléchargé depuis notre recherche base de données dans un graphique former pour visualiser
tous de le différent médicaments
ce le patient reçu pendant le traitement.
Maintenant, enfin, toi pourrait vouloir pour demander, pourquoi faire nous vouloir pour regarder à ce?
Un chose de importance pour nous
était pour en fait regarder à le oral microbien diversité.
Comme je mentionné,
nous étaient capable pour prendre un séparé tableau ce correspondait pour le les patients
dans le traitement protocole
et calculer quoi est appelé un Diversité Shannon métrique.
UN plus haut diversité indique plus haut oral microbien diversité,
et un inférieur indice indique inférieur microbien diversité.
Depuis dans JMP, nous étaient capable pour superposer
le traitement jambe entre temps indiquer UN et B
et le changement de le diversité métrique
depuis temps indiquer le commencer de le traitement pour le fin de le traitement.
Aussi, étaient capable pour regarder à dans un patient
comment le différent antibiotiques correspondant pour ce.
Alors le deuxième jambe de le protocole, nous étaient capable pour voir un léger rebond
de le diversité indice
dans corrélation avec le nombre de antibiotiques
ce étaient utilisé dans ce traitement jambe.
Dans conclusion,
nous étaient capable pour visualiser patient- prescrit antibiotiques
à travers le cours de un traitement protocole
en utilisant le JMP Générateur de graphiques outil.
Nous a pris un tableau de 1 289 Lignes de médicament employé dans le protocole
et créé un simplifié graphique de visualisation.
Nous aussi étaient capable pour calculer un Shannon Diversité Indice
sur bactéries données associé avec chaque personne oral échantillons.
Nous superposer ces deux graphiques, et il autorisé nous pour dessiner conclusions
sur comment le antibiotiques prescrit pour chaque patient
pourrait ont affecté le oral microbiome de personnes dans le traitement protocole.
Enfin, notre groupe a utilisé le graphique nature de JMP pour beaucoup années
dans un chemin pour traduire complexe médical recherche données
dans données- conduit Découverte et enquête.
Le utiliser de JMP a facilité beaucoup éditions
et très cité recherche revues pour notre groupe.
Remercier toi pour ton temps aujourd'hui.
