Jennfier Barb, wissenschaftliche Mitarbeiterin, National Institutes of Health
Gwenyth R. Wallen, leitende Forscherin, NIH
JMP wurde von unserer interdisziplinären Gruppe am NIH Clinical Center für die Analyse klinischer Forschungsdaten verwendet, um datengesteuerte Hypothesen zu testen und zu entwickeln, die unser Bench-to-Bedside-to-Community- und Back-Translationsmodell unterstützen. Wir werden eine beispielhafte Workflow-Visualisierung von Korrelaten zwischen der Verwendung von Antibiotika und patientenspezifischen oralen Mikrobiomen präsentieren.Ausgehend von einer Tabelle mit mehr als 2000 Einträgen zum Einsatz von Antibiotika bei Patienten mit einer seltenen Krankheit und einer separaten Tabelle von Bakterien, die im oralen Mikrobiom von jedem Patienten vorhanden sind, haben wir eine Visualisierung des Antibiotikaeinsatzes im Laufe der Behandlung erstellt Programm und korrelierte die Verwendung der Antibiotika mit den Metriken der oralen Mikrobiomdiversität.Es ist allgemein bekannt, dass die Verwendung von Antibiotika die normale menschliche Mikrobiota stören kann, ihre globale Wirkung auf das orale Mikrobiom bleibt jedoch unklar.Wir beschreiben, wie das JMP Graph Builder-Tool verwendet wurde, um weiter zu erklären, ob Antibiotika das orale Mikrobiom in dieser Patientenkohorte mit seltenen Krankheiten beeinflusst haben könnten.Die grafische Natur von JMP wird in unserer Gruppe seit Jahren als Werkzeug für die Datenanalyse verwendet und hat die Veröffentlichung von häufig zitierten Artikeln zur translationalen klinischen Forschung mit Peer-Review erleichtert.
