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借助 JMP 进行临床和转化生物信息学数据驱动发现的完整循环 (2022-US-EPO-1166)

Jennfier Barb，美国国立卫生研究院职员科学家
Gwenyth R. Wallen，美国国立卫生研究院首席研究员

JMP 已被我们在 NIH 临床中心的跨学科小组用于分析临床研究数据，以测试和开发数据驱动的假设，以支持我们的工作台、床边、社区和反向转化模型。我们将展示抗生素使用与患者特定口腔微生物组之间相关性的工作流程示例可视化。从包含 2000 多个罕见病患者抗生素药物使用条目的电子表格开始，以及每位患者口腔微生物组中存在的细菌的单独电子表格，我们创建了整个治疗过程中抗生素纵向使用的可视化计划并将抗生素的使用与口腔微生物群多样性指标相关联。众所周知，抗生素的使用会扰乱正常的人类微生物群，但其对口腔微生物群的整体影响仍不清楚。我们描述了如何使用 JMP Graph Builder 工具来进一步解释抗生素是否可能影响了这个罕见病患者队列中的口腔微生物组。多年来，JMP 的图形特性一直被用作我们团队的数据分析工具，并促进了经常引用的同行评审的转化临床研究文章的发表。