大家好！ 我叫 Owen，是 JMP 的技術實習生。 我有生物學背景，尤其是合成生物學和生物技術。 在該系列的第二篇文章中，我分享了我在合成生物學背景下使用示例創建的案例研究，以及與合成生物學界互動的方式。 第1部分為 JMP 介紹了合成生物學和機會。
生物研究實驗設計
我的工作只專注於實驗設計。 在過去的幾周里，我有幸採訪了幾位在英國合成生物學領域工作的重要學者和行業專業人士。 我們就 DOE 的生物研究和教學課程的 DOE 應用進行了富有成果的討論。 我們採訪的所有專家同意向學生教授 DOE 的重要性. 然而，DOE在生物學中的滲透仍然很差。 雖然某些大學提供課程（例如倫敦大學學院)，它沒有得到廣泛的採用，而且有很大的需要傳播這種方法的意識。 謝天謝地，還有一個很棒的興趣讓生物學家了解 DOE。 例如，Synthace 最近發布了一個關於 DOE 的三部分網絡研討會系列，面向 700 多名註冊人的生物學家出席。
在我自己的工作中，我已經開始編譯可能對 JMP 有益的合成生物學資源。 我根據使用 DOE 進行研究的研究論文創建了三本期刊。 報告已上傳至 JMP Public，本文附有期刊：
- 使用 DoE 了解乙醇生物合成的代謝相互作用JMP 公共
- 使用 DoE 提高代謝途徑效率 | JMP 公共
- 了解反應組分影響無細胞蛋白質合成的動力學和性能 | JMP 公共
我希望這些期刊文件可以用來向生物學研究人員展示 DOE。 有關所有三種期刊的更多信息，以適合不同級別的用戶：
- Violacein 途徑（初學者）：Plackett-Burman 篩選設計，然後是 Box-Behnken 優化設計；使用最小二乘法建模
- 乙醇生物合成（高級）：裂區設計；使用偏最小二乘法建模（SIMPLS，K(10) 交叉驗證）
- 無細胞系統（高級）：2x DSD 設計，然後是 RSM 設計；使用最小二乘法建模
我還使用 DOE 創建了一個包含其他合成生物學研究論文的數據庫，我將繼續對其進行更新（參見隨附的 JMP 期刊：“Bio Papers using DoE”）。
參與合成生物學界
對於大多數人來說，“合成生物學”這個詞可能仍然是陌生的，包括那些正在研究生物學相關學科的人。 從我個人的經驗來看，我在本科學習的早期第一次聽到這個詞是從一位講師那裡招募的，他正在招募學生組成一個團隊來參加有聲望的比賽。 iGEM 比賽，這是一個年度的,全球競爭專注於合成生物學.
iGEM 基金會是一個獨立的非營利性全球組織，致力於促進合成生物學、教育和競爭，以及發展開放、協作和合作的社區。 他們主持首屈一指的國際合成生物學競賽和350個多學科團隊參與每年從世界各地的. iGEM 競賽通常是學生第一次接觸合成生物學。 來自比賽的校友不斷培養創新和創造初創企業場內。 至此，結束iGEM 參與者已經建立了 150 家初創公司.
每年有近 7,000 人將他們的夏季奉獻給 iGEM，然後在秋季齊聚一堂，展示他們的作品並參加會議。 參加者多為本科生來自世界各地的大學。 還有一小部分研究生和高中生。 評審團由約 120 名學者組成，包括博士生、博士後、首席研究員 (PI) 和教授。 可以找到已報名參加 2022 年比賽的球隊名單這裡. 截至撰寫本文時，已有 370 多個團隊註冊。
iGEM 比賽是通過贊助實現的。 JMP 的競爭對手 MathWorks贊助 iGEM很多年了。
JMP 有機會通過直接贊助或在會議期間舉辦參展商展位和演示來與 iGEM 社區互動。 通過儘早與學生互動，我們正在對該領域的未來研究人員、企業家和全球領導者進行投資。 更多信息可以在 iGEM 的兩個附加文件中找到。
雖然 iGEM 是首屈一指的學生和學術會議，但每年還會舉辦一次以行業為中心的會議，由用生物學建造. Built With Biology 是領先的創新網絡，面向生物工程師、創新者、企業家和投資者，他們共同熱衷於利用生物學來建設一個更美好、更可持續的星球。 他們為社區成員提供個人和職業發展，以及建立聯繫、合作、協作和教育的寶貴機會。
每年他們主持全球合成生物學峰會它展示了生物學的前沿發展，這些發展正在改變我們為世界提供燃料、治愈和養活的方式。此外，他們全年在美國和世界各地舉辦各種其他會議、思想領袖靜修會和當地聚會。 此外，他們有時會在社區內舉辦網絡研討會和課程。 這可能是 JMP 未來的潛在合作領域經驗（builtwithbiology.com） .
我希望這篇文章提供了一些信息、資源和參與該領域的方法。 我相信 JMP 可以幫助該領域的研究人員和科學家更快地將這些創新產品推向市場。 我將在為 JMP 創建未來資源時更新本文。 我期待在評論中聽到您的想法，並很樂意回答任何問題！
