皆さんこんにちは！ 私の名前はオーウェンです。ここJMPのテクニカルインターンです。 私は生物学、特に合成生物学とバイオテクノロジーのバックグラウンドを持っています。 シリーズのこの2番目の投稿では、合成生物学のコンテキストでの例を使用して作成したケーススタディと、合成生物学コミュニティとの関わり方を共有します。 パート1合成生物学とJMPの機会を紹介しました。
生物学研究のための実験計画
私の仕事は実験計画法のみに焦点を当てています。 過去数週間、私は英国の合成生物学の分野で働いているいくつかの主要な学者や業界の専門家にインタビューする特権を持っています。 私たちは、生物学研究のためのDOEアプリケーションとDOEに関する教育コースについて実り多い議論をしました。 私たちがインタビューしたすべての専門家学生にDOEを教えることの重要性について合意した。 ただし、生物学におけるDOEの浸透はまだ不十分です。 一部の大学で利用可能なコースがありますが（ UCL ）、それは広く採用されておらず、素晴らしい必要この方法論の認識を広めるため。 ありがたいことに、素晴らしいものもあります興味生物学者がDOEについて学ぶために。 例として、Synthaceは最近リリースしました700人以上の登録者を持つ生物学者のためのDOEに関する3部構成のウェビナーシリーズ出席して。
私自身の仕事では、JMPに役立つ可能性のある合成生物学のリソースをまとめ始めました。 DOEを使った研究論文をもとに3つのジャーナルを作成しました。 レポートはJMPPublicにアップロードされており、ジャーナルはこの記事に添付されています。
- DoEを使用したエタノール生合成の代謝相互作用の理解| JMPパブリック
- DoEを使用した代謝経路効率の改善| JMPパブリック
- 反応成分を理解することは、無細胞タンパク質合成の動力学と性能に影響を及ぼします。 JMPパブリック
これらのジャーナルファイルが、生物学研究者にDOEを示すために使用できることを願っています。 さまざまなレベルのユーザーに合わせて、3つのジャーナルすべてに関する詳細情報：
- Violacein経路（初心者）：Plackett-Burmanスクリーニング設計とそれに続くBox-Behnken最適化設計。最小二乗法を使用したモデリング
- エタノール生合成（高度）：分割プロット設計;部分最小二乗法を使用したモデリング（SIMPLS、K（10）交差検定）
- 無セルシステム（高度）：2xDSD設計とそれに続くRSM設計。最小二乗法を使用したモデリング
また、DOEを使用して他の合成生物学研究論文のデータベースを作成しました。これは今後も更新されます（添付のJMPジャーナル「DoEを使用したバイオペーパー」を参照）。
合成生物学コミュニティとの関わり
「合成生物学」という用語は、生物学関連の分野を研究している人を含め、ほとんどの人にとってまだ異質である可能性があります。 私自身の個人的な経験から、私は学部課程の早い段階で、名門で競争するためにチームを形成するために学生を募集していた講師からこの用語を最初に聞きました。 iGEMコンペティション、これは通年、グローバル競争に焦点を当てた合成生物学。
iGEM Foundationは、合成生物学、教育、競争の進歩、およびオープンで協調的かつ協力的なコミュニティの開発に取り組んでいる、独立した非営利のグローバル組織です。 彼らはホストします最高の国際合成生物学コンペティションと350の学際的なチーム参加毎年から世界中で。 iGEMコンテストは、多くの場合、学生が初めて合成生物学に触れる機会です。 コンテストの卒業生は、イノベーションを育み、創造し続けてきましたスタートアップフィールド内。 これまでのところ、以上150のスタートアップがiGEM参加者によって構築されました。
毎年7,000人近くの人々が夏をiGEMに捧げ、秋に集まって自分の仕事を発表し、会議に参加します。 参加者のほとんどは学部生です世界中の大学。 大学院生と高校生の小さなプールもあります。 審査委員会は、博士課程の学生、ポスドク、プリンシパルインベスティゲーター（PI）、教授など、約120人の学者で構成されています。 2022年の大会に登録したチームのリストを見つけることができますここ。 この記事の執筆時点で、370を超えるチームが登録しています。
iGEMの競争は、スポンサーシップを通じて可能になります。 JMPのライバルであるMathWorksはスポンサー付きiGEM長年。
JMPには、直接のスポンサーシップを通じて、または会議中に出展ブースやデモンストレーションを主催することを通じて、iGEMコミュニティと交流する機会があります。 学生と早期に交流することで、私たちは将来の研究者、起業家、そしてこの分野のグローバルリーダーに投資しています。 詳細については、iGEMに添付されている2つのドキュメントを参照してください。
iGEMは最高の学生および学術会議ですが、業界に焦点を当てた年次会議も開催されています。生物学で構築。 Built With Biologyは、生物学を使用してより良い、より持続可能な惑星を構築することに情熱を共有する生物学エンジニア、イノベーター、起業家、投資家のための主要なイノベーションネットワークです。 彼らはコミュニティのメンバーに個人的および専門的な開発を提供するだけでなく、ネットワーキング、パートナーシップ、コラボレーション、教育のための貴重な機会を提供します。
毎年彼らはホストしますグローバル合成生物学サミットこれは、私たちが世界に燃料を供給し、癒し、養う方法を変革している生物学の最先端の発展を示しています。さらに、米国と世界中の両方で、他のさまざまな会議、ソートリーダーのリトリート、地元の交流会を年間を通じて開催しています。 さらに、コミュニティ内でウェビナーやコースを主催することもあります。 これは、将来のJMPのコラボレーションの潜在的な領域になる可能性があります経験（builtwithbiology.com） 。
この投稿が、この分野に取り組むための情報、リソース、および方法を提供してくれることを願っています。 JMPは、この分野の研究者や科学者がこれらの革新的な製品をより早く市場に投入できるよう支援する上で、多くのことを提供できると思います。 JMPの将来のリソースを作成するときに、この記事を更新します。 コメント欄で皆様のご意見をお待ちしております。ご不明な点がございましたら、お気軽にお問い合わせください。
