大家好！ 我叫 Owen，是 JMP 的一名技术实习生。 我有生物学背景，尤其是合成生物学和生物技术。 在本系列的第二篇文章中，我分享了我在合成生物学背景下使用示例创建的案例研究以及与合成生物学社区互动的方式。 第1部分介绍了合成生物学和 JMP 的机遇。
生物学研究实验设计
我的工作只专注于实验设计。 在过去的几周里，我有幸采访了几位在英国合成生物学领域工作的重要学者和行业专业人士。 我们就DOE在生物研究和DOE课程教学方面的应用进行了富有成果的讨论。 我们采访的所有专家同意向学生教授 DOE 的重要性. 然而，DOE 在生物学中的渗透仍然很差。 虽然某些大学提供课程（例如伦敦大学学院)，它还没有得到广泛采用，并且有很大的需要传播对这种方法的认识。 值得庆幸的是，还有一个很棒的兴趣供生物学家了解 DOE。 例如，Synthace 最近发布了一个为生物学家举办的关于 DOE 的三部分网络研讨会系列，注册人数超过 700 人在出席。
在我自己的工作中，我已经开始编译可能对 JMP 有益的合成生物学资源。 我根据使用 DOE 进行研究的研究论文创建了三本期刊。 报告已上传至 JMP Public，本文附上期刊：
- 使用 DoE 了解乙醇生物合成的代谢相互作用 | JMP公共
- 使用 DoE 提高代谢途径效率 | JMP公共
- 了解反应组分影响无细胞蛋白质合成的动力学和性能 | JMP公共
我希望这些日志文件可用于向生物学研究人员展示 DOE。 关于所有三种期刊的一些进一步信息，以适应不同级别的用户：
- Violacein 通路（初学者）：Plackett-Burman 筛选设计，然后是 Box-Behnken 优化设计；使用最小二乘法建模
- 乙醇生物合成（高级）：裂区设计；使用偏最小二乘法建模（SIMPLS、K(10) 交叉验证）
- 无细胞系统（高级）：2x DSD 设计，然后是 RSM 设计；使用最小二乘法建模
我还使用 DOE 创建了其他合成生物学研究论文的数据库，我将继续更新该数据库（参见随附的 JMP 期刊：“使用 DoE 的生物论文”）。
参与合成生物学界
对于大多数人来说，“合成生物学”一词可能仍然很陌生，包括那些正在研究生物学相关学科的人。 根据我个人的经验，我最早是在本科学习的时候从一位讲师那里听到这个词的，当时他正在招募学生组队参加享有盛誉的比赛iGEM比赛，这是一个年度的,全球竞争专注于合成生物学.
iGEM 基金会是一个独立的非营利性全球组织，致力于促进合成生物学、教育和竞争，以及发展开放、协作和合作的社区。 他们主持首屈一指的国际合成生物学竞赛和350个多学科团队参加每年从世界各地的. iGEM 竞赛通常是学生第一次接触合成生物学。 大赛校友不断培育创新创造初创企业场内。 至此，结束iGEM 参与者已经建立了 150 家初创公司.
每年都有近 7,000 人将他们的夏天奉献给 iGEM，然后在秋天聚集在一起展示他们的工作并在会议上竞争。 大多数与会者是本科生来自世界各地的大学。 还有一小部分研究生和高中生。 评审团由约 120 名学者组成，包括博士生、博士后、首席研究员 (PI) 和教授。 可以找到已注册参加 2022 年比赛的球队名单这里. 截至撰写本文时，已有 370 多个团队注册。
iGEM 比赛是通过赞助来实现的。 JMP 的竞争对手 MathWorks赞助iGEM很多年了。
JMP 有机会通过直接赞助或在会议期间举办参展商展位和演示来与 iGEM 社区互动。 通过尽早与学生互动，我们正在投资该领域未来的研究人员、企业家和全球领导者。 更多信息可以在 iGEM 上的两个附加文档中找到。
虽然 iGEM 是首屈一指的学生和学术会议，但每年都会举办以行业为重点的会议，由用生物学建造. Built With Biology 是面向生物工程师、创新者、企业家和投资者的领先创新网络，他们都热衷于利用生物学来建设一个更美好、更可持续的星球。 他们为社区成员提供个人和专业发展，以及建立网络、伙伴关系、协作和教育的宝贵机会。
每年他们举办全球合成生物学峰会它展示了生物学的前沿发展，这些发展正在改变我们为世界提供燃料、治愈和养活世界的方式。此外，他们全年在美国和世界各地举办各种其他会议、思想领袖务虚会和当地聚会。 此外，他们有时会在社区内举办网络研讨会和课程。 这可能是 JMP 未来的潜在合作领域经验 (builtwithbiology.com) .
我希望这篇文章提供了一些信息、资源和参与该领域的方法。 我相信 JMP 可以帮助该领域的研究人员和科学家更快地将这些创新产品推向市场。 我将在为 JMP 创建未来资源时更新这篇文章。 我期待在评论中听到您的想法，并且很乐意回答任何问题！
感谢 Owen 创建和分享这些宝贵的演示资源和对合成生物学的洞察力。
