Hallo allerseits! Mein Name ist Owen und ich bin technischer Praktikant hier bei JMP. Ich habe einen Hintergrund in Biologie, insbesondere in synthetischer Biologie und Biotechnologie. In diesem zweiten Beitrag der Serie teile ich Fallstudien, die ich erstellt habe, anhand von Beispielen im Kontext der synthetischen Biologie und Möglichkeiten, mit der Gemeinschaft der synthetischen Biologie in Kontakt zu treten. Teil 1 stellte synthetische Biologie und Möglichkeiten für JMP vor.
Design von Experimenten für die biologische Forschung
Meine Arbeit konzentrierte sich ausschließlich auf das Design von Experimenten. In den letzten Wochen hatte ich das Privileg, mehrere wichtige Akademiker und Fachleute aus der Industrie zu interviewen, die auf dem Gebiet der synthetischen Biologie in Großbritannien arbeiten. Wir hatten eine fruchtbare Diskussion über DOE-Anwendungen für biologische Forschungs- und Lehrkurse über DOE. Alle Experten, die wir interviewt haben waren sich einig, wie wichtig es ist, Schülern DOE beizubringen . Die Durchdringung von DOE in der Biologie ist jedoch noch gering. Während es an ausgewählten Universitäten Kurse gibt (wie z UCL ), hat es keine breite Akzeptanz gefunden und es gibt eine große MÜSSEN Bewusstsein für diese Methodik zu verbreiten. Zum Glück gibt es auch eine tolle INTERESSE für Biologen, um etwas über DOE zu lernen. Als Beispiel hat Synthace kürzlich a veröffentlicht dreiteilige Webinar-Reihe über DOE für Biologen mit über 700 Registranten zugegen.
In meiner eigenen Arbeit habe ich damit begonnen, Ressourcen zur synthetischen Biologie zusammenzustellen, die für JMP von Nutzen sein könnten. Ich habe drei Zeitschriften auf der Grundlage von Forschungsarbeiten erstellt, die DOE für ihre Forschung verwenden. Die Berichte wurden in JMP Public hochgeladen und die Zeitschriften sind diesem Artikel beigefügt:
- Verständnis der metabolischen Wechselwirkungen für die Ethanolbiosynthese mit DoE | JMP-Öffentlichkeit
- Verbesserung der Effizienz des Stoffwechselwegs mit DoE | JMP-Öffentlichkeit
- Das Verständnis der Reaktionskomponenten beeinflusst die Kinetik und Leistung der zellfreien Proteinsynthese | JMP-Öffentlichkeit
Ich hoffe, dass diese Journaldateien verwendet werden können, um biologischen Forschern DOE zu demonstrieren. Einige weitere Informationen zu allen drei Zeitschriften für unterschiedliche Benutzerstufen:
- Violacein-Weg (Anfänger): Plackett-Burman-Screening-Design, gefolgt von Box-Behnken-Optimierungsdesign; Modellieren mit der Methode der kleinsten Quadrate
- Ethanol-Biosynthese (Fortgeschrittene): Split-Plot-Design; Modellierung mit Partial Least Squares (SIMPLS, K(10) Kreuzvalidierung)
- Zellfreie Systeme (Advanced): 2x DSD-Designs, gefolgt von RSM-Design; Modellieren mit der Methode der kleinsten Quadrate
Ich habe auch eine Datenbank mit anderen Forschungsarbeiten zur synthetischen Biologie unter Verwendung von DOE erstellt, die ich weiterhin aktualisieren werde (siehe beigefügtes JMP-Journal: "Bio Papers using DoE").
Engagieren Sie sich mit der Gemeinschaft der synthetischen Biologie
Der Begriff „Synthetische Biologie“ mag den meisten Menschen noch fremd sein, auch denjenigen, die Biologie-verwandte Disziplinen studieren. Aus eigener persönlicher Erfahrung hörte ich den Begriff zum ersten Mal zu Beginn meines Grundstudiums von einem Dozenten, der Studenten rekrutierte, um ein Team zu bilden, um an prestigeträchtigen Wettbewerben teilzunehmen iGEM-Wettbewerb , das ist ein jährlich , globaler Wettbewerb fokussiert synthetische Biologie .
Die iGEM Foundation ist eine unabhängige, gemeinnützige globale Organisation, die sich der Förderung der synthetischen Biologie, der Bildung und des Wettbewerbs sowie der Entwicklung einer offenen, kooperativen und kooperativen Gemeinschaft verschrieben hat. Sie hosten die Erster internationaler Wettbewerb für synthetische Biologie mit 350 multidisziplinäre Teams teilnehmen jährlich von weltweit . Der iGEM-Wettbewerb ist oft der erste Kontakt eines Studenten mit synthetischer Biologie. Alumni des Wettbewerbs haben weiterhin Innovation kultiviert und geschaffen Start-ups innerhalb des Feldes. So weit, vorbei 150 Startups wurden von iGEM-Teilnehmern aufgebaut .
Jedes Jahr widmen fast 7.000 Menschen ihren Sommer iGEM und kommen dann im Herbst zusammen, um ihre Arbeit zu präsentieren und sich auf der Konferenz zu messen. Die meisten Teilnehmer sind Studierende im Grundstudium Universitäten aus aller Welt. Es gibt auch einen kleineren Pool von Doktoranden und Gymnasiasten. Die Jury besteht aus ca. 120 Wissenschaftlern, darunter Doktoranden, Post-Docs, Principal Investigators (PI) und Professoren. Eine Liste der Teams, die sich für den Wettbewerb 2022 angemeldet haben, finden Sie hier hier . Zum jetzigen Zeitpunkt haben sich über 370 Teams angemeldet.
Der iGEM-Wettbewerb wird durch Sponsoring ermöglicht. MathWorks, ein Konkurrent von JMP, hat gesponsertes iGEM für viele Jahre.
JMP hat die Möglichkeit, mit der iGEM-Community in Kontakt zu treten, entweder durch direktes Sponsoring oder durch die Ausrichtung von Ausstellerständen und Vorführungen während der Konferenz. Indem wir frühzeitig mit Studenten in Kontakt treten, investieren wir in zukünftige Forscher, Unternehmer und weltweit führende Unternehmen auf diesem Gebiet. Weitere Informationen finden Sie in den beiden beigefügten Dokumenten zu iGEM.
Während iGEM die führende Studenten- und akademische Konferenz ist, gibt es auch eine jährliche branchenorientierte Konferenz, die von veranstaltet wird Mit Biologie gebaut . Built With Biology ist das führende Innovationsnetzwerk für Bioingenieure, Innovatoren, Unternehmer und Investoren, die eine Leidenschaft für den Einsatz von Biologie zum Aufbau eines besseren, nachhaltigeren Planeten teilen. Sie bieten ihren Community-Mitgliedern persönliche und berufliche Entwicklung sowie wertvolle Möglichkeiten für Networking, Partnerschaft, Zusammenarbeit und Bildung.
Jedes Jahr sind sie Gastgeber Der Global Synthetic Biology Summit die die neuesten Entwicklungen in der Biologie zeigt, die die Art und Weise verändern, wie wir die Welt mit Energie versorgen, heilen und ernähren.Darüber hinaus veranstalten sie das ganze Jahr über eine Vielzahl anderer Konferenzen, Vordenker-Retreats und lokale Treffen, sowohl in den Vereinigten Staaten als auch auf der ganzen Welt. Darüber hinaus veranstalten sie manchmal Webinare und Kurse innerhalb ihrer Community. Dies könnte in Zukunft ein potenzieller Bereich der Zusammenarbeit für JMP sein Erfahrung (builtwithbiology.com) .
Ich hoffe, dieser Beitrag hat einige Informationen, Ressourcen und Möglichkeiten zur Auseinandersetzung mit diesem Bereich bereitgestellt. Ich glaube, JMP hat viel zu bieten, wenn es darum geht, Forschern und Wissenschaftlern auf diesem Gebiet dabei zu helfen, diese innovativen Produkte schneller auf den Markt zu bringen. Ich werde diesen Artikel aktualisieren, wenn ich zukünftige Ressourcen für JMP erstelle. Ich freue mich auf Ihre Meinung in den Kommentaren und beantworte gerne Ihre Fragen!
Vielen Dank, Owen, für die Erstellung und Weitergabe dieser wertvollen Demo-Ressourcen und Einblicke in die Synthetische Biologie.
